121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0900 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0900  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  617  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0956  hypothetical protein  77.99 
 
 		 311 aa  487  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0975  hypothetical protein  73.87 
 
 		 308 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1013  hypothetical protein  73.23 
 
 		 308 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0979  hypothetical protein  73.87 
 
 		 308 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1151  hypothetical protein  72.58 
 
 		 308 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2930  hypothetical protein  71.29 
 
 		 310 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245213  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0826  hypothetical protein  76.9 
 
 		 307 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0817  hypothetical protein  71.84 
 
 		 314 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3513  hypothetical protein  71.84 
 
 		 311 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal  0.0378522 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3292  hypothetical protein  71.84 
 
 		 311 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00376444  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3388  hypothetical protein  71.84 
 
 		 311 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.982204  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1065  protein of unknown function DUF808  71.84 
 
 		 311 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.697461  hitchhiker  0.00968509 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3434  hypothetical protein  68.9 
 
 		 307 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1821  hypothetical protein  64.78 
 
 		 321 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40490  hypothetical protein  68.9 
 
 		 307 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2735  hypothetical protein  66.02 
 
 		 309 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1773  hypothetical protein  64.74 
 
 		 310 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367738  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1355  hypothetical protein  63.11 
 
 		 306 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1369  hypothetical protein  62.58 
 
 		 324 aa  360  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1601  hypothetical protein  59.67 
 
 		 304 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251967  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0659  hypothetical protein  61.39 
 
 		 311 aa  351  8e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000322319 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1289  hypothetical protein  60.71 
 
 		 311 aa  350  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0220  hypothetical protein  56.91 
 
 		 311 aa  345  4e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1575  hypothetical protein  61.94 
 
 		 304 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05660  hypothetical protein  61.59 
 
 		 311 aa  331  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4294  hypothetical protein  61.57 
 
 		 304 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4843  hypothetical protein  56.02 
 
 		 325 aa  329  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1869  hypothetical protein  57.51 
 
 		 308 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3619  hypothetical protein  57.42 
 
 		 304 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0421  membrane protein  57.37 
 
 		 301 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.637251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3755  protein of unknown function DUF808  56.1 
 
 		 308 aa  326  3e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0308  hypothetical protein  56.29 
 
 		 341 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2205  hypothetical protein  56.59 
 
 		 303 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1130  hypothetical protein  56.59 
 
 		 303 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00137244  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1227  hypothetical protein  57.88 
 
 		 303 aa  322  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1252  hypothetical protein  56.59 
 
 		 303 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.8726 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1691  protein of unknown function DUF808  57.56 
 
 		 305 aa  322  4e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000308367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3859  hypothetical protein  59.7 
 
 		 304 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.856782 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2148  hypothetical protein  56.27 
 
 		 303 aa  322  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2735  hypothetical protein  57.56 
 
 		 305 aa  321  9.000000000000001e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0246746  normal  0.396498 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2548  hypothetical protein  55.63 
 
 		 303 aa  321  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0271849  normal  0.708081 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2060  hypothetical protein  57.56 
 
 		 305 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.001704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2190  hypothetical protein  57.56 
 
 		 305 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1685  hypothetical protein  57.56 
 
 		 305 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590631  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1080  hypothetical protein  57.56 
 
 		 305 aa  321  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231877  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2152  hypothetical protein  55.95 
 
 		 303 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0155438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3648  protein of unknown function DUF808  57.52 
 
 		 302 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05226  hypothetical protein  56.74 
 
 		 301 aa  319  3.9999999999999996e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3608  hypothetical protein  55.23 
 
 		 314 aa  317  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3424  hypothetical protein  60.14 
 
 		 304 aa  316  4e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001336  hypothetical protein  56.41 
 
 		 301 aa  315  7e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0685345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2858  protein of unknown function DUF808  56.83 
 
 		 303 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1803  hypothetical protein  56.39 
 
 		 319 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179201  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3095  hypothetical protein  56.33 
 
 		 328 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000654386  normal  0.396631 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3288  hypothetical protein  54.75 
 
 		 316 aa  306  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3672  hypothetical protein  56.77 
 
 		 302 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.882626  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2290  hypothetical protein  58.97 
 
 		 332 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.222846  normal  0.0387634 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1584  protein of unknown function DUF808  58.62 
 
 		 332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1061  hypothetical protein  60.94 
 
 		 312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2772  hypothetical protein  56.35 
 
 		 311 aa  293  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145384  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0255  hypothetical protein  53.11 
 
 		 307 aa  291  8e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0444172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03380  inner membrane protein YedI  58.58 
 
 		 313 aa  291  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0281  hypothetical protein  52.17 
 
 		 307 aa  287  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.261162 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1442  protein of unknown function DUF808  52.43 
 
 		 305 aa  286  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0611  hypothetical protein  51.89 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901187  hitchhiker  0.00000167296 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00476  hypothetical protein  52.6 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0478  hypothetical protein  50.32 
 
 		 305 aa  280  3e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2514  hypothetical protein  51.74 
 
 		 307 aa  271  7e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2902  hypothetical protein  52.43 
 
 		 310 aa  260  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153256 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0228  hypothetical protein  49.03 
 
 		 294 aa  242  5e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0229  hypothetical protein  48.71 
 
 		 294 aa  242  5e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3419  hypothetical protein  47.35 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23547  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1755  protein of unknown function DUF808  47.81 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1370  hypothetical protein  44.19 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0968923  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2963  protein of unknown function DUF808  47.2 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000127698  hitchhiker  0.0000000223824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2059  hypothetical protein  41.31 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0044  protein of unknown function DUF808  39.01 
 
 		 324 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3043  hypothetical protein  45.66 
 
 		 330 aa  198  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0455  hypothetical protein  42.44 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3328  hypothetical protein  40.19 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3303  protein of unknown function DUF808  41.32 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.269589  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6756  protein of unknown function DUF808  42.66 
 
 		 345 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275375  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1112  hypothetical protein  43.08 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6658  hypothetical protein  40 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04664  decreased coverage  0.00529763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1120  protein of unknown function DUF808  37.7 
 
 		 364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2667  hypothetical protein  44.71 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2712  hypothetical protein  44.71 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2697  hypothetical protein  44.71 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.684359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19730  hypothetical protein  39.52 
 
 		 366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0318347  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2262  protein of unknown function DUF808  41.03 
 
 		 361 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0430  hypothetical protein  33.7 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000210959  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0384  protein of unknown function DUF808  44.62 
 
 		 320 aa  180  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2188  hypothetical protein  39.48 
 
 		 322 aa  179  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1923  protein of unknown function DUF808  41.67 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2445  protein of unknown function DUF808  39.13 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  hitchhiker  0.000000377935 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1422  hypothetical protein  41.96 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322162  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3147  protein of unknown function DUF808  44.87 
 
 		 336 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1113  hypothetical protein  44.23 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1699  hypothetical protein  38.78 
 
 		 322 aa  172  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776311  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>