121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0228 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0228  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  574  1.0000000000000001e-163  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0229  hypothetical protein  97.62 
 
 
294 aa  514  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2858  protein of unknown function DUF808  55 
 
 
303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001336  hypothetical protein  53.85 
 
 
301 aa  302  4.0000000000000003e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0685345  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1355  hypothetical protein  55.63 
 
 
306 aa  302  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283175  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2735  hypothetical protein  55.37 
 
 
309 aa  299  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1601  hypothetical protein  59 
 
 
304 aa  298  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251967  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0659  hypothetical protein  52.24 
 
 
311 aa  297  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000322319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2205  hypothetical protein  54.18 
 
 
303 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1130  hypothetical protein  54.18 
 
 
303 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00137244  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0421  membrane protein  53.97 
 
 
301 aa  296  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.637251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40490  hypothetical protein  53.62 
 
 
307 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3648  protein of unknown function DUF808  54.36 
 
 
302 aa  296  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1252  hypothetical protein  53.51 
 
 
303 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.8726 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2148  hypothetical protein  53.51 
 
 
303 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3619  hypothetical protein  59.16 
 
 
304 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3434  hypothetical protein  52.63 
 
 
307 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3859  hypothetical protein  60.31 
 
 
304 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.856782 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2152  hypothetical protein  53.51 
 
 
303 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0155438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1575  hypothetical protein  59.92 
 
 
304 aa  292  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226574  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4294  hypothetical protein  59.92 
 
 
304 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0220  hypothetical protein  51.95 
 
 
311 aa  292  4e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3755  protein of unknown function DUF808  49.51 
 
 
308 aa  291  6e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0281  hypothetical protein  52.16 
 
 
307 aa  291  7e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.261162 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3424  hypothetical protein  57.04 
 
 
304 aa  291  8e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0255  hypothetical protein  51.5 
 
 
307 aa  290  2e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0444172  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0308  hypothetical protein  51.94 
 
 
341 aa  290  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05226  hypothetical protein  51.83 
 
 
301 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1227  hypothetical protein  56.18 
 
 
303 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00309611  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1369  hypothetical protein  50 
 
 
324 aa  288  9e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446398  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2514  hypothetical protein  57.3 
 
 
307 aa  288  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05660  hypothetical protein  55.22 
 
 
311 aa  287  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1691  protein of unknown function DUF808  51.49 
 
 
305 aa  287  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000308367  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2060  hypothetical protein  55.81 
 
 
305 aa  287  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.001704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2190  hypothetical protein  55.81 
 
 
305 aa  287  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1685  hypothetical protein  55.81 
 
 
305 aa  287  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590631  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1080  hypothetical protein  55.81 
 
 
305 aa  287  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2735  hypothetical protein  55.81 
 
 
305 aa  287  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0246746  normal  0.396498 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1151  hypothetical protein  50.97 
 
 
308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1013  hypothetical protein  50.97 
 
 
308 aa  285  5e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0975  hypothetical protein  51.3 
 
 
308 aa  285  8e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.11841 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3672  hypothetical protein  51.9 
 
 
302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.882626  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3292  hypothetical protein  55.64 
 
 
311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00376444  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03380  inner membrane protein YedI  54.81 
 
 
313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0979  hypothetical protein  51.3 
 
 
308 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1442  protein of unknown function DUF808  51.17 
 
 
305 aa  282  5.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34086  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1869  hypothetical protein  53.82 
 
 
308 aa  282  6.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2930  hypothetical protein  51.29 
 
 
310 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245213  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0826  hypothetical protein  56.15 
 
 
307 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4843  hypothetical protein  49.54 
 
 
325 aa  281  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1803  hypothetical protein  51.56 
 
 
319 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179201  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0611  hypothetical protein  49.84 
 
 
307 aa  281  8.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901187  hitchhiker  0.00000167296 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2290  hypothetical protein  54.09 
 
 
332 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.222846  normal  0.0387634 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2548  hypothetical protein  51.71 
 
 
303 aa  281  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0271849  normal  0.708081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3513  hypothetical protein  55.27 
 
 
311 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal  0.0378522 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1065  protein of unknown function DUF808  55.27 
 
 
311 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.697461  hitchhiker  0.00968509 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1584  protein of unknown function DUF808  53.74 
 
 
332 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3608  hypothetical protein  52.7 
 
 
314 aa  280  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3288  hypothetical protein  55.47 
 
 
316 aa  280  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1821  hypothetical protein  55.56 
 
 
321 aa  279  4e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3388  hypothetical protein  55.27 
 
 
311 aa  278  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.982204  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0956  hypothetical protein  50.48 
 
 
311 aa  275  9e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3095  hypothetical protein  53.87 
 
 
328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000654386  normal  0.396631 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1773  hypothetical protein  52.23 
 
 
310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367738  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0900  hypothetical protein  49.03 
 
 
310 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1289  hypothetical protein  49.03 
 
 
311 aa  271  9e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0817  hypothetical protein  55.91 
 
 
314 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0478  hypothetical protein  51.06 
 
 
305 aa  258  9e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1061  hypothetical protein  53.88 
 
 
312 aa  256  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2902  hypothetical protein  53.61 
 
 
310 aa  256  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.153256 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00476  hypothetical protein  50.85 
 
 
309 aa  255  6e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2772  hypothetical protein  49.18 
 
 
311 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145384  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1755  protein of unknown function DUF808  44.98 
 
 
289 aa  249  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333708  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1370  hypothetical protein  43.01 
 
 
282 aa  228  6e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0968923  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3419  hypothetical protein  46.55 
 
 
294 aa  226  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23547  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2963  protein of unknown function DUF808  42.96 
 
 
288 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000127698  hitchhiker  0.0000000223824 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0455  hypothetical protein  39.66 
 
 
313 aa  185  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3328  hypothetical protein  41.73 
 
 
314 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1422  hypothetical protein  40.23 
 
 
314 aa  176  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2760  protein of unknown function DUF808  35.82 
 
 
305 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2059  hypothetical protein  40.55 
 
 
313 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603414  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1112  hypothetical protein  39.46 
 
 
316 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1120  protein of unknown function DUF808  40.24 
 
 
364 aa  170  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3043  hypothetical protein  39.92 
 
 
330 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0430  hypothetical protein  34.46 
 
 
366 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000210959  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0044  protein of unknown function DUF808  36.67 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0384  protein of unknown function DUF808  41.37 
 
 
320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1739  hypothetical protein  41.2 
 
 
315 aa  159  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234932  normal  0.431557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6756  protein of unknown function DUF808  38.54 
 
 
345 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275375  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2188  hypothetical protein  41.37 
 
 
322 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19730  hypothetical protein  39 
 
 
366 aa  158  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0318347  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1923  protein of unknown function DUF808  41.18 
 
 
338 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275369  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6658  hypothetical protein  36.39 
 
 
341 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04664  decreased coverage  0.00529763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3147  protein of unknown function DUF808  42.23 
 
 
336 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2667  hypothetical protein  38.52 
 
 
327 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2712  hypothetical protein  38.52 
 
 
327 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2697  hypothetical protein  38.52 
 
 
327 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.684359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2262  protein of unknown function DUF808  40.8 
 
 
361 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1699  hypothetical protein  40 
 
 
322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776311  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0752  hypothetical protein  36.4 
 
 
315 aa  152  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>