121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1422 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1422  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  601  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322162  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0044  protein of unknown function DUF808  53.99 
 
 
324 aa  316  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1113  hypothetical protein  58.06 
 
 
311 aa  297  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2059  hypothetical protein  55.27 
 
 
313 aa  292  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603414  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4402  hypothetical protein  59.81 
 
 
311 aa  288  9e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.976692  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2262  protein of unknown function DUF808  52.83 
 
 
361 aa  284  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1120  protein of unknown function DUF808  52.61 
 
 
364 aa  276  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0455  hypothetical protein  51.46 
 
 
313 aa  269  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3328  hypothetical protein  50.48 
 
 
314 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2445  protein of unknown function DUF808  54.52 
 
 
339 aa  266  4e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  hitchhiker  0.000000377935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3303  protein of unknown function DUF808  53.5 
 
 
317 aa  262  4.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.269589  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3043  hypothetical protein  52.94 
 
 
330 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1431  hypothetical protein  57.53 
 
 
314 aa  259  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.424656  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0384  protein of unknown function DUF808  54.88 
 
 
320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6658  hypothetical protein  50.75 
 
 
341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04664  decreased coverage  0.00529763 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19730  hypothetical protein  51.62 
 
 
366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0318347  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1699  hypothetical protein  52.92 
 
 
322 aa  253  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776311  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1112  hypothetical protein  52.41 
 
 
316 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2188  hypothetical protein  53.62 
 
 
322 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1616  protein of unknown function DUF808  49.84 
 
 
313 aa  249  4e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2760  protein of unknown function DUF808  48.44 
 
 
305 aa  247  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2667  hypothetical protein  54.48 
 
 
327 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2712  hypothetical protein  54.48 
 
 
327 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2697  hypothetical protein  54.48 
 
 
327 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.684359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1939  hypothetical protein  52.38 
 
 
311 aa  246  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123773  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1739  hypothetical protein  54.28 
 
 
315 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234932  normal  0.431557 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1923  protein of unknown function DUF808  54.61 
 
 
338 aa  245  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275369  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3147  protein of unknown function DUF808  53.5 
 
 
336 aa  242  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4415  hypothetical protein  54.27 
 
 
317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0281  hypothetical protein  43.71 
 
 
307 aa  238  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.261162 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0752  hypothetical protein  50.16 
 
 
315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0255  hypothetical protein  42.77 
 
 
307 aa  235  8e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0444172  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1548  protein of unknown function DUF808  54.39 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  hitchhiker  0.00682503 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1870  hypothetical protein  54.66 
 
 
337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1746  hypothetical protein  56.48 
 
 
330 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2082  protein of unknown function DUF808  55.41 
 
 
330 aa  229  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00053497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6756  protein of unknown function DUF808  51.18 
 
 
345 aa  228  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275375  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2735  hypothetical protein  44.48 
 
 
309 aa  226  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0659  hypothetical protein  45.18 
 
 
311 aa  225  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000322319 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1013  hypothetical protein  45.31 
 
 
308 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4423  protein of unknown function DUF808  58.25 
 
 
320 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0975  hypothetical protein  45.31 
 
 
308 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.11841 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13109  integral membrane protein  51.63 
 
 
306 aa  223  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0328248  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1442  protein of unknown function DUF808  45.31 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34086  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0979  hypothetical protein  45.62 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1685  hypothetical protein  43.75 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590631  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2735  hypothetical protein  43.75 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0246746  normal  0.396498 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1691  protein of unknown function DUF808  43.75 
 
 
305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000308367  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1151  hypothetical protein  44.97 
 
 
308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2930  hypothetical protein  42.81 
 
 
310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245213  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2060  hypothetical protein  43.44 
 
 
305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.001704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2190  hypothetical protein  43.44 
 
 
305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1227  hypothetical protein  43.44 
 
 
303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00309611  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1080  hypothetical protein  43.44 
 
 
305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1803  hypothetical protein  46.35 
 
 
319 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179201  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2548  hypothetical protein  41.56 
 
 
303 aa  218  8.999999999999998e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0271849  normal  0.708081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3672  hypothetical protein  45.08 
 
 
302 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.882626  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0220  hypothetical protein  44.65 
 
 
311 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3648  protein of unknown function DUF808  41.74 
 
 
302 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2148  hypothetical protein  42.5 
 
 
303 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1252  hypothetical protein  42.19 
 
 
303 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.8726 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1355  hypothetical protein  43.67 
 
 
306 aa  217  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283175  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2205  hypothetical protein  42.19 
 
 
303 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1130  hypothetical protein  42.19 
 
 
303 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00137244  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2958  hypothetical protein  55.95 
 
 
323 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1603  hypothetical protein  55.95 
 
 
323 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0499282  normal  0.0520062 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0611  hypothetical protein  43.89 
 
 
307 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901187  hitchhiker  0.00000167296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2152  hypothetical protein  41.88 
 
 
303 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0155438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1388  hypothetical protein  53.31 
 
 
323 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.19024  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3513  hypothetical protein  44.37 
 
 
311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal  0.0378522 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3388  hypothetical protein  44.37 
 
 
311 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.982204  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3292  hypothetical protein  44.67 
 
 
311 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00376444  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1575  hypothetical protein  44.06 
 
 
304 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226574  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1065  protein of unknown function DUF808  44.33 
 
 
311 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.697461  hitchhiker  0.00968509 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1821  hypothetical protein  41.8 
 
 
321 aa  210  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4843  hypothetical protein  42.55 
 
 
325 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4294  hypothetical protein  44.06 
 
 
304 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22260  hypothetical protein  51.76 
 
 
317 aa  209  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3435  protein of unknown function DUF808  54.43 
 
 
351 aa  209  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2514  hypothetical protein  41.56 
 
 
307 aa  209  5e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40490  hypothetical protein  44.37 
 
 
307 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3434  hypothetical protein  44.37 
 
 
307 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0817  hypothetical protein  39.88 
 
 
314 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3859  hypothetical protein  43.01 
 
 
304 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.856782 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1773  hypothetical protein  43.34 
 
 
310 aa  206  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367738  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3619  hypothetical protein  43.71 
 
 
304 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2858  protein of unknown function DUF808  43.89 
 
 
303 aa  206  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1869  hypothetical protein  43.53 
 
 
308 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1601  hypothetical protein  40.75 
 
 
304 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251967  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0478  hypothetical protein  42.68 
 
 
305 aa  204  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05660  hypothetical protein  45.63 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3424  hypothetical protein  44.85 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0826  hypothetical protein  42.63 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1289  hypothetical protein  41.54 
 
 
311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2902  hypothetical protein  42.73 
 
 
310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.153256 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0956  hypothetical protein  40.87 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1369  hypothetical protein  43.41 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446398  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3755  protein of unknown function DUF808  42.07 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001336  hypothetical protein  41.87 
 
 
301 aa  195  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0685345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2290  hypothetical protein  42.42 
 
 
332 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.222846  normal  0.0387634 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>