121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_40490 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_40490  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3434  hypothetical protein  97.39 
 
 
307 aa  584  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1369  hypothetical protein  68.55 
 
 
324 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446398  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0900  hypothetical protein  68.9 
 
 
310 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1355  hypothetical protein  69.18 
 
 
306 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283175  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0956  hypothetical protein  67.65 
 
 
311 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0826  hypothetical protein  71.28 
 
 
307 aa  388  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2735  hypothetical protein  67.32 
 
 
309 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0659  hypothetical protein  67.64 
 
 
311 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000322319 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05660  hypothetical protein  67.1 
 
 
311 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0220  hypothetical protein  64.4 
 
 
311 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1601  hypothetical protein  65.57 
 
 
304 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251967  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0975  hypothetical protein  67.12 
 
 
308 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.11841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1013  hypothetical protein  66.78 
 
 
308 aa  377  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1151  hypothetical protein  66.1 
 
 
308 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0979  hypothetical protein  67.12 
 
 
308 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4843  hypothetical protein  64.11 
 
 
325 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3619  hypothetical protein  68.17 
 
 
304 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4294  hypothetical protein  68.66 
 
 
304 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2930  hypothetical protein  63.3 
 
 
310 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245213  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1575  hypothetical protein  69.72 
 
 
304 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226574  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3859  hypothetical protein  69.72 
 
 
304 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.856782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3648  protein of unknown function DUF808  67.11 
 
 
302 aa  364  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3388  hypothetical protein  64.95 
 
 
311 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.982204  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0817  hypothetical protein  62.1 
 
 
314 aa  364  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3513  hypothetical protein  64.6 
 
 
311 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal  0.0378522 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1065  protein of unknown function DUF808  64.95 
 
 
311 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.697461  hitchhiker  0.00968509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3292  hypothetical protein  64.6 
 
 
311 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00376444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3095  hypothetical protein  66.77 
 
 
328 aa  362  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000654386  normal  0.396631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1289  hypothetical protein  65.69 
 
 
311 aa  358  5e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2858  protein of unknown function DUF808  65.57 
 
 
303 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2290  hypothetical protein  64.65 
 
 
332 aa  355  5e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.222846  normal  0.0387634 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1584  protein of unknown function DUF808  64.35 
 
 
332 aa  353  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3672  hypothetical protein  62.94 
 
 
302 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.882626  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1803  hypothetical protein  61.81 
 
 
319 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179201  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1821  hypothetical protein  60.38 
 
 
321 aa  348  8e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1442  protein of unknown function DUF808  63.61 
 
 
305 aa  348  9e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34086  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0308  hypothetical protein  60.66 
 
 
341 aa  345  6e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3424  hypothetical protein  67.42 
 
 
304 aa  345  7e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2148  hypothetical protein  62.96 
 
 
303 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2205  hypothetical protein  62.63 
 
 
303 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1130  hypothetical protein  62.63 
 
 
303 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00137244  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1252  hypothetical protein  62.63 
 
 
303 aa  342  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.8726 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2548  hypothetical protein  60.87 
 
 
303 aa  342  5.999999999999999e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0271849  normal  0.708081 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05226  hypothetical protein  60.26 
 
 
301 aa  341  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1773  hypothetical protein  60.52 
 
 
310 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367738  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2152  hypothetical protein  61.95 
 
 
303 aa  338  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0155438 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03380  inner membrane protein YedI  67.4 
 
 
313 aa  335  7.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3755  protein of unknown function DUF808  59.31 
 
 
308 aa  335  7.999999999999999e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1691  protein of unknown function DUF808  59.34 
 
 
305 aa  334  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000308367  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1227  hypothetical protein  59.67 
 
 
303 aa  334  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00309611  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001336  hypothetical protein  59.8 
 
 
301 aa  333  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0685345  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1685  hypothetical protein  59.34 
 
 
305 aa  333  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590631  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2060  hypothetical protein  59.34 
 
 
305 aa  332  3e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.001704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2190  hypothetical protein  59.34 
 
 
305 aa  332  3e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1080  hypothetical protein  59.34 
 
 
305 aa  332  3e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2735  hypothetical protein  59.34 
 
 
305 aa  333  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0246746  normal  0.396498 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1869  hypothetical protein  60.54 
 
 
308 aa  328  7e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0421  membrane protein  58.22 
 
 
301 aa  324  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.637251  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3288  hypothetical protein  57.95 
 
 
316 aa  323  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3608  hypothetical protein  54.98 
 
 
314 aa  322  6e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2772  hypothetical protein  65.5 
 
 
311 aa  316  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145384  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0255  hypothetical protein  55.45 
 
 
307 aa  314  9.999999999999999e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0444172  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2514  hypothetical protein  57.69 
 
 
307 aa  312  5.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0281  hypothetical protein  55.13 
 
 
307 aa  312  5.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.261162 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1061  hypothetical protein  59.34 
 
 
312 aa  301  1e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0611  hypothetical protein  53.67 
 
 
307 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901187  hitchhiker  0.00000167296 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0478  hypothetical protein  57.33 
 
 
305 aa  293  3e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00476  hypothetical protein  63.45 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2902  hypothetical protein  54.52 
 
 
310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.153256 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0228  hypothetical protein  53.62 
 
 
294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0229  hypothetical protein  52.63 
 
 
294 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3419  hypothetical protein  48.64 
 
 
294 aa  239  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23547  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1755  protein of unknown function DUF808  41.78 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333708  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2963  protein of unknown function DUF808  48.15 
 
 
288 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000127698  hitchhiker  0.0000000223824 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1370  hypothetical protein  43.81 
 
 
282 aa  217  2e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0968923  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2059  hypothetical protein  42.09 
 
 
313 aa  205  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603414  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19730  hypothetical protein  44.85 
 
 
366 aa  205  9e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0318347  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1120  protein of unknown function DUF808  41.25 
 
 
364 aa  202  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1112  hypothetical protein  47.79 
 
 
316 aa  202  6e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3043  hypothetical protein  49.41 
 
 
330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0455  hypothetical protein  42.49 
 
 
313 aa  199  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2760  protein of unknown function DUF808  40.6 
 
 
305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2667  hypothetical protein  44.93 
 
 
327 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2712  hypothetical protein  44.93 
 
 
327 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2697  hypothetical protein  44.93 
 
 
327 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.684359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6756  protein of unknown function DUF808  44.96 
 
 
345 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275375  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1422  hypothetical protein  44.44 
 
 
314 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6658  hypothetical protein  40.87 
 
 
341 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04664  decreased coverage  0.00529763 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3328  hypothetical protein  41.08 
 
 
314 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0384  protein of unknown function DUF808  45.58 
 
 
320 aa  189  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0044  protein of unknown function DUF808  39.08 
 
 
324 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0430  hypothetical protein  32.86 
 
 
366 aa  188  8e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000210959  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1113  hypothetical protein  39.5 
 
 
311 aa  186  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2445  protein of unknown function DUF808  42.14 
 
 
339 aa  185  9e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  hitchhiker  0.000000377935 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1699  hypothetical protein  41.46 
 
 
322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776311  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4415  hypothetical protein  45.99 
 
 
317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1923  protein of unknown function DUF808  42.38 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275369  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3303  protein of unknown function DUF808  40.68 
 
 
317 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.269589  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1939  hypothetical protein  42.27 
 
 
311 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123773  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>