121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3859 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3859  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.856782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3619  hypothetical protein  92.41 
 
 		 304 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4294  hypothetical protein  90.46 
 
 		 304 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1575  hypothetical protein  90.13 
 
 		 304 aa  510  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1601  hypothetical protein  77.56 
 
 		 304 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251967  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4843  hypothetical protein  69.14 
 
 		 325 aa  415  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1355  hypothetical protein  67.99 
 
 		 306 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2290  hypothetical protein  68.9 
 
 		 332 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.222846  normal  0.0387634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0659  hypothetical protein  66.23 
 
 		 311 aa  391  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000322319 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1584  protein of unknown function DUF808  68.9 
 
 		 332 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0220  hypothetical protein  65.26 
 
 		 311 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2548  hypothetical protein  67 
 
 		 303 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0271849  normal  0.708081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3648  protein of unknown function DUF808  69.57 
 
 		 302 aa  384  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1369  hypothetical protein  67.99 
 
 		 324 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40490  hypothetical protein  69.7 
 
 		 307 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2152  hypothetical protein  66.33 
 
 		 303 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0155438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2205  hypothetical protein  66.67 
 
 		 303 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2148  hypothetical protein  66 
 
 		 303 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1130  hypothetical protein  66.67 
 
 		 303 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00137244  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1252  hypothetical protein  66.67 
 
 		 303 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.8726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3434  hypothetical protein  67.68 
 
 		 307 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1289  hypothetical protein  65.8 
 
 		 311 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2858  protein of unknown function DUF808  68.23 
 
 		 303 aa  374  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05660  hypothetical protein  66.67 
 
 		 311 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1869  hypothetical protein  66.55 
 
 		 308 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3608  hypothetical protein  61.98 
 
 		 314 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3095  hypothetical protein  64.95 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000654386  normal  0.396631 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1691  protein of unknown function DUF808  63 
 
 		 305 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000308367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1803  hypothetical protein  61.56 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179201  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2060  hypothetical protein  63 
 
 		 305 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.001704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2190  hypothetical protein  63 
 
 		 305 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1685  hypothetical protein  63 
 
 		 305 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590631  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1227  hypothetical protein  63.33 
 
 		 303 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1080  hypothetical protein  63 
 
 		 305 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231877  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3755  protein of unknown function DUF808  62.42 
 
 		 308 aa  364  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2735  hypothetical protein  63 
 
 		 305 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0246746  normal  0.396498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3672  hypothetical protein  61.24 
 
 		 302 aa  363  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.882626  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3424  hypothetical protein  69.58 
 
 		 304 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2735  hypothetical protein  62.62 
 
 		 309 aa  354  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03380  inner membrane protein YedI  66.08 
 
 		 313 aa  352  5.9999999999999994e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1442  protein of unknown function DUF808  62.29 
 
 		 305 aa  348  5e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0975  hypothetical protein  60.13 
 
 		 308 aa  345  4e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1013  hypothetical protein  59.81 
 
 		 308 aa  344  8e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0979  hypothetical protein  60.13 
 
 		 308 aa  343  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2930  hypothetical protein  60 
 
 		 310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245213  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1151  hypothetical protein  59.68 
 
 		 308 aa  341  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2772  hypothetical protein  65.57 
 
 		 311 aa  339  4e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145384  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0281  hypothetical protein  60.74 
 
 		 307 aa  338  7e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.261162 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0956  hypothetical protein  58.06 
 
 		 311 aa  338  9e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3292  hypothetical protein  61.17 
 
 		 311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00376444  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1065  protein of unknown function DUF808  61.17 
 
 		 311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.697461  hitchhiker  0.00968509 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0255  hypothetical protein  60.07 
 
 		 307 aa  334  1e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0444172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0900  hypothetical protein  56.45 
 
 		 310 aa  333  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3513  hypothetical protein  60.82 
 
 		 311 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal  0.0378522 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0826  hypothetical protein  62.69 
 
 		 307 aa  331  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3388  hypothetical protein  60.48 
 
 		 311 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.982204  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0817  hypothetical protein  60 
 
 		 314 aa  330  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1821  hypothetical protein  56.27 
 
 		 321 aa  326  3e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2514  hypothetical protein  61.41 
 
 		 307 aa  325  8.000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0308  hypothetical protein  56.37 
 
 		 341 aa  322  3e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0421  membrane protein  57.19 
 
 		 301 aa  323  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.637251  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1061  hypothetical protein  58.95 
 
 		 312 aa  321  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001336  hypothetical protein  59.26 
 
 		 301 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0685345  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0478  hypothetical protein  60.67 
 
 		 305 aa  319  3e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1773  hypothetical protein  57.51 
 
 		 310 aa  319  5e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367738  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05226  hypothetical protein  57.89 
 
 		 301 aa  317  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00476  hypothetical protein  59.32 
 
 		 309 aa  311  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3288  hypothetical protein  54.61 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0611  hypothetical protein  60.7 
 
 		 307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901187  hitchhiker  0.00000167296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2902  hypothetical protein  55.3 
 
 		 310 aa  299  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153256 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0228  hypothetical protein  54.82 
 
 		 294 aa  269  4e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0229  hypothetical protein  54.15 
 
 		 294 aa  266  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3419  hypothetical protein  45.55 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23547  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1755  protein of unknown function DUF808  44 
 
 		 289 aa  230  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2963  protein of unknown function DUF808  45.94 
 
 		 288 aa  218  7.999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000127698  hitchhiker  0.0000000223824 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1370  hypothetical protein  41.11 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0968923  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2059  hypothetical protein  42.72 
 
 		 313 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1422  hypothetical protein  43.01 
 
 		 314 aa  199  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322162  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1120  protein of unknown function DUF808  41.16 
 
 		 364 aa  196  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1113  hypothetical protein  41.1 
 
 		 311 aa  195  9e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1112  hypothetical protein  45.31 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0455  hypothetical protein  39.06 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2667  hypothetical protein  41.99 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2712  hypothetical protein  41.99 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2697  hypothetical protein  41.99 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.684359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3303  protein of unknown function DUF808  42.81 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.269589  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2760  protein of unknown function DUF808  40.67 
 
 		 305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0044  protein of unknown function DUF808  38.49 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3328  hypothetical protein  41.48 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2188  hypothetical protein  38.71 
 
 		 322 aa  182  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1699  hypothetical protein  41.23 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0430  hypothetical protein  31.12 
 
 		 366 aa  179  4e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000210959  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1739  hypothetical protein  42.24 
 
 		 315 aa  179  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234932  normal  0.431557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3043  hypothetical protein  43.46 
 
 		 330 aa  179  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1939  hypothetical protein  41.64 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4402  hypothetical protein  41.77 
 
 		 311 aa  175  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.976692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4415  hypothetical protein  43.1 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1431  hypothetical protein  42.42 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.424656  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2445  protein of unknown function DUF808  41.75 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  hitchhiker  0.000000377935 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6756  protein of unknown function DUF808  40.59 
 
 		 345 aa  172  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>