121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0659 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0659  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  607  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000322319 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0220  hypothetical protein  65.27 
 
 		 311 aa  388  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1601  hypothetical protein  65.91 
 
 		 304 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251967  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3434  hypothetical protein  69.45 
 
 		 307 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40490  hypothetical protein  67.64 
 
 		 307 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05660  hypothetical protein  68.49 
 
 		 311 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3424  hypothetical protein  66.78 
 
 		 304 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1369  hypothetical protein  67.3 
 
 		 324 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3619  hypothetical protein  67.53 
 
 		 304 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4294  hypothetical protein  67.53 
 
 		 304 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1575  hypothetical protein  67.21 
 
 		 304 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1355  hypothetical protein  65.99 
 
 		 306 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4843  hypothetical protein  65.22 
 
 		 325 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3648  protein of unknown function DUF808  67 
 
 		 302 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3859  hypothetical protein  66.23 
 
 		 304 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.856782 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2858  protein of unknown function DUF808  66.56 
 
 		 303 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1289  hypothetical protein  64.17 
 
 		 311 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2290  hypothetical protein  65.9 
 
 		 332 aa  361  7.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.222846  normal  0.0387634 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1584  protein of unknown function DUF808  65.57 
 
 		 332 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1442  protein of unknown function DUF808  66 
 
 		 305 aa  359  4e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2205  hypothetical protein  60.2 
 
 		 303 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1130  hypothetical protein  60.2 
 
 		 303 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00137244  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2148  hypothetical protein  59.87 
 
 		 303 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1252  hypothetical protein  60.2 
 
 		 303 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.8726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3672  hypothetical protein  61.61 
 
 		 302 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.882626  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0826  hypothetical protein  62.99 
 
 		 307 aa  354  8.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1151  hypothetical protein  61.24 
 
 		 308 aa  353  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1803  hypothetical protein  61.56 
 
 		 319 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179201  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2152  hypothetical protein  59.54 
 
 		 303 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0155438 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2930  hypothetical protein  61.06 
 
 		 310 aa  351  8e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245213  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0900  hypothetical protein  61.39 
 
 		 310 aa  351  8e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0956  hypothetical protein  60.58 
 
 		 311 aa  349  4e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0975  hypothetical protein  60.98 
 
 		 308 aa  348  5e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11841 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3095  hypothetical protein  64.24 
 
 		 328 aa  348  5e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000654386  normal  0.396631 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1821  hypothetical protein  60 
 
 		 321 aa  347  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1013  hypothetical protein  60.73 
 
 		 308 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2548  hypothetical protein  58.88 
 
 		 303 aa  347  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0271849  normal  0.708081 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1227  hypothetical protein  60.41 
 
 		 303 aa  347  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00309611  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1691  protein of unknown function DUF808  60.07 
 
 		 305 aa  346  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000308367  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1685  hypothetical protein  60.07 
 
 		 305 aa  346  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590631  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2735  hypothetical protein  60.07 
 
 		 305 aa  346  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0246746  normal  0.396498 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2060  hypothetical protein  60.07 
 
 		 305 aa  346  4e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.001704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2190  hypothetical protein  60.07 
 
 		 305 aa  346  4e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1080  hypothetical protein  60.07 
 
 		 305 aa  346  4e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231877  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0979  hypothetical protein  60.53 
 
 		 308 aa  344  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0817  hypothetical protein  60 
 
 		 314 aa  344  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3608  hypothetical protein  56.55 
 
 		 314 aa  341  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3292  hypothetical protein  63.23 
 
 		 311 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00376444  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1065  protein of unknown function DUF808  62.2 
 
 		 311 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.697461  hitchhiker  0.00968509 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2735  hypothetical protein  60.73 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3755  protein of unknown function DUF808  59.87 
 
 		 308 aa  340  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3388  hypothetical protein  62.24 
 
 		 311 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.982204  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3513  hypothetical protein  62.89 
 
 		 311 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal  0.0378522 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1869  hypothetical protein  59.42 
 
 		 308 aa  335  7e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1773  hypothetical protein  58.9 
 
 		 310 aa  334  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367738  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0281  hypothetical protein  57.24 
 
 		 307 aa  330  2e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.261162 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03380  inner membrane protein YedI  62.28 
 
 		 313 aa  328  6e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0255  hypothetical protein  56.91 
 
 		 307 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0444172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0308  hypothetical protein  55.66 
 
 		 341 aa  323  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2772  hypothetical protein  61.09 
 
 		 311 aa  321  8e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145384  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05226  hypothetical protein  56.05 
 
 		 301 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001336  hypothetical protein  56.33 
 
 		 301 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0685345  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0421  membrane protein  55.74 
 
 		 301 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.637251  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1061  hypothetical protein  62.45 
 
 		 312 aa  318  9e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2514  hypothetical protein  61.67 
 
 		 307 aa  318  9e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0478  hypothetical protein  56.95 
 
 		 305 aa  309  4e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0611  hypothetical protein  53.53 
 
 		 307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901187  hitchhiker  0.00000167296 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3288  hypothetical protein  54.02 
 
 		 316 aa  300  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00476  hypothetical protein  54.64 
 
 		 309 aa  288  6e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2902  hypothetical protein  52.87 
 
 		 310 aa  288  9e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153256 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0228  hypothetical protein  51.95 
 
 		 294 aa  264  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0229  hypothetical protein  51.95 
 
 		 294 aa  263  4e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3419  hypothetical protein  45.45 
 
 		 294 aa  229  7e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23547  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1370  hypothetical protein  41.28 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0968923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1755  protein of unknown function DUF808  45.78 
 
 		 289 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1422  hypothetical protein  44.37 
 
 		 314 aa  207  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322162  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2963  protein of unknown function DUF808  38.06 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000127698  hitchhiker  0.0000000223824 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1112  hypothetical protein  41.37 
 
 		 316 aa  192  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2059  hypothetical protein  40.38 
 
 		 313 aa  192  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603414  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0455  hypothetical protein  38.87 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2760  protein of unknown function DUF808  38.64 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1120  protein of unknown function DUF808  44.31 
 
 		 364 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2188  hypothetical protein  44.98 
 
 		 322 aa  188  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0044  protein of unknown function DUF808  40.26 
 
 		 324 aa  188  9e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2667  hypothetical protein  43.88 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2712  hypothetical protein  43.88 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2697  hypothetical protein  43.88 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.684359 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3328  hypothetical protein  37.58 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0430  hypothetical protein  30.42 
 
 		 366 aa  186  3e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000210959  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3303  protein of unknown function DUF808  41.3 
 
 		 317 aa  186  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.269589  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1699  hypothetical protein  41.23 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3043  hypothetical protein  45.56 
 
 		 330 aa  185  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6658  hypothetical protein  39.58 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04664  decreased coverage  0.00529763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3147  protein of unknown function DUF808  41.43 
 
 		 336 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1739  hypothetical protein  41.25 
 
 		 315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234932  normal  0.431557 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1113  hypothetical protein  42.97 
 
 		 311 aa  182  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19730  hypothetical protein  42.55 
 
 		 366 aa  182  7e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0318347  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1923  protein of unknown function DUF808  40.43 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1939  hypothetical protein  42.43 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4415  hypothetical protein  44.07 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal  0.391018 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>