122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1120 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1120  protein of unknown function DUF808  100 
 
 
364 aa  712    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2262  protein of unknown function DUF808  62.61 
 
 
361 aa  383  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3303  protein of unknown function DUF808  64.86 
 
 
317 aa  342  4e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.269589  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2445  protein of unknown function DUF808  65.68 
 
 
339 aa  332  6e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  hitchhiker  0.000000377935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0044  protein of unknown function DUF808  56.6 
 
 
324 aa  331  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1939  hypothetical protein  63.23 
 
 
311 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123773  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2667  hypothetical protein  61.86 
 
 
327 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2712  hypothetical protein  61.86 
 
 
327 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2697  hypothetical protein  61.86 
 
 
327 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.684359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19730  hypothetical protein  56.13 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0318347  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1431  hypothetical protein  62.82 
 
 
314 aa  312  4.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.424656  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4415  hypothetical protein  63.02 
 
 
317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0384  protein of unknown function DUF808  59.75 
 
 
320 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4423  protein of unknown function DUF808  63.89 
 
 
320 aa  290  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2059  hypothetical protein  54.55 
 
 
313 aa  291  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603414  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1113  hypothetical protein  54.98 
 
 
311 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0752  hypothetical protein  57.56 
 
 
315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3328  hypothetical protein  51.78 
 
 
314 aa  280  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1616  protein of unknown function DUF808  52.81 
 
 
313 aa  277  3e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0455  hypothetical protein  50.65 
 
 
313 aa  275  9e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3043  hypothetical protein  50.98 
 
 
330 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13109  integral membrane protein  57.38 
 
 
306 aa  260  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0328248  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1422  hypothetical protein  53.12 
 
 
314 aa  257  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322162  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4402  hypothetical protein  57.7 
 
 
311 aa  252  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.976692  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2760  protein of unknown function DUF808  51.67 
 
 
305 aa  252  9.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22260  hypothetical protein  55.9 
 
 
317 aa  251  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2188  hypothetical protein  49.67 
 
 
322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1739  hypothetical protein  51.97 
 
 
315 aa  243  5e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234932  normal  0.431557 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6658  hypothetical protein  49.09 
 
 
341 aa  242  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04664  decreased coverage  0.00529763 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1870  hypothetical protein  51.32 
 
 
337 aa  239  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1112  hypothetical protein  51.94 
 
 
316 aa  237  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1699  hypothetical protein  46.13 
 
 
322 aa  233  3e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776311  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6756  protein of unknown function DUF808  48.38 
 
 
345 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275375  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1548  protein of unknown function DUF808  48.77 
 
 
331 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  hitchhiker  0.00682503 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3435  protein of unknown function DUF808  53.95 
 
 
351 aa  220  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2958  hypothetical protein  50.52 
 
 
323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1603  hypothetical protein  50.52 
 
 
323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0499282  normal  0.0520062 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1388  hypothetical protein  49.83 
 
 
323 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.19024  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0220  hypothetical protein  42.37 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1355  hypothetical protein  43.55 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283175  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3434  hypothetical protein  41.69 
 
 
307 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40490  hypothetical protein  41.56 
 
 
307 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2930  hypothetical protein  40.26 
 
 
310 aa  206  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245213  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15650  hypothetical protein  56.55 
 
 
315 aa  204  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0737154  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0421  membrane protein  40.71 
 
 
301 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.637251  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1746  hypothetical protein  49.33 
 
 
330 aa  204  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1151  hypothetical protein  40.71 
 
 
308 aa  202  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1923  protein of unknown function DUF808  48.53 
 
 
338 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275369  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1821  hypothetical protein  39.32 
 
 
321 aa  202  6e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1013  hypothetical protein  39.87 
 
 
308 aa  202  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2082  protein of unknown function DUF808  49.33 
 
 
330 aa  202  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00053497 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0826  hypothetical protein  42.67 
 
 
307 aa  202  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0975  hypothetical protein  40.19 
 
 
308 aa  202  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.11841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4294  hypothetical protein  43.97 
 
 
304 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1773  hypothetical protein  39.87 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367738  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1575  hypothetical protein  43.97 
 
 
304 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226574  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3648  protein of unknown function DUF808  41.8 
 
 
302 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2902  hypothetical protein  41.38 
 
 
310 aa  200  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.153256 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3147  protein of unknown function DUF808  49.01 
 
 
336 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0979  hypothetical protein  39.87 
 
 
308 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1803  hypothetical protein  42.72 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179201  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2735  hypothetical protein  40.49 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1369  hypothetical protein  43.04 
 
 
324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446398  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0611  hypothetical protein  39.87 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901187  hitchhiker  0.00000167296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2205  hypothetical protein  41.29 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1130  hypothetical protein  41.29 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00137244  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1252  hypothetical protein  41.29 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.8726 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1065  protein of unknown function DUF808  41.37 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.697461  hitchhiker  0.00968509 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1584  protein of unknown function DUF808  44.44 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2290  hypothetical protein  44.44 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.222846  normal  0.0387634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3292  hypothetical protein  41.73 
 
 
311 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00376444  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0817  hypothetical protein  37.34 
 
 
314 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2148  hypothetical protein  40.97 
 
 
303 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2152  hypothetical protein  40.97 
 
 
303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0155438 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1691  protein of unknown function DUF808  39.54 
 
 
305 aa  196  7e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000308367  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1227  hypothetical protein  39.54 
 
 
303 aa  196  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00309611  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0956  hypothetical protein  39.55 
 
 
311 aa  196  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2735  hypothetical protein  39.54 
 
 
305 aa  196  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0246746  normal  0.396498 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1685  hypothetical protein  39.54 
 
 
305 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590631  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1601  hypothetical protein  41.21 
 
 
304 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251967  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2060  hypothetical protein  39.54 
 
 
305 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.001704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2190  hypothetical protein  39.54 
 
 
305 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3859  hypothetical protein  42.4 
 
 
304 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.856782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1080  hypothetical protein  39.54 
 
 
305 aa  195  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231877  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3672  hypothetical protein  41.5 
 
 
302 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.882626  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2548  hypothetical protein  38.76 
 
 
303 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0271849  normal  0.708081 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0659  hypothetical protein  40.97 
 
 
311 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000322319 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3388  hypothetical protein  41.37 
 
 
311 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.982204  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3513  hypothetical protein  41.73 
 
 
311 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal  0.0378522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3619  hypothetical protein  42.2 
 
 
304 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3424  hypothetical protein  43.33 
 
 
304 aa  194  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3095  hypothetical protein  45.15 
 
 
328 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000654386  normal  0.396631 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05660  hypothetical protein  40.78 
 
 
311 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05226  hypothetical protein  40.33 
 
 
301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4843  hypothetical protein  42.22 
 
 
325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0900  hypothetical protein  37.46 
 
 
310 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1755  protein of unknown function DUF808  45.97 
 
 
289 aa  189  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333708  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1061  hypothetical protein  43.46 
 
 
312 aa  188  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3755  protein of unknown function DUF808  40.75 
 
 
308 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2858  protein of unknown function DUF808  45.45 
 
 
303 aa  186  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>