121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0308 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0308  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  678    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001336  hypothetical protein  74.04 
 
 		 301 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0685345  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05226  hypothetical protein  73.63 
 
 		 301 aa  434  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0421  membrane protein  68.39 
 
 		 301 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.637251  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3434  hypothetical protein  61.31 
 
 		 307 aa  346  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40490  hypothetical protein  60.66 
 
 		 307 aa  345  7e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1601  hypothetical protein  59.37 
 
 		 304 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251967  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3608  hypothetical protein  58.13 
 
 		 314 aa  339  4e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1355  hypothetical protein  56.83 
 
 		 306 aa  335  9e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0220  hypothetical protein  56.05 
 
 		 311 aa  331  1e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0956  hypothetical protein  58.93 
 
 		 311 aa  331  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1013  hypothetical protein  56.15 
 
 		 308 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0975  hypothetical protein  55.84 
 
 		 308 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11841 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2930  hypothetical protein  54.57 
 
 		 310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05660  hypothetical protein  57.98 
 
 		 311 aa  326  3e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0979  hypothetical protein  55.21 
 
 		 308 aa  325  5e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1369  hypothetical protein  54.52 
 
 		 324 aa  325  5e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0900  hypothetical protein  56.29 
 
 		 310 aa  326  5e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3672  hypothetical protein  56.15 
 
 		 302 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.882626  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0659  hypothetical protein  55.66 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000322319 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1821  hypothetical protein  56.23 
 
 		 321 aa  322  4e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2735  hypothetical protein  57.41 
 
 		 309 aa  323  4e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1803  hypothetical protein  57.37 
 
 		 319 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179201  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1151  hypothetical protein  54.89 
 
 		 308 aa  322  7e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3648  protein of unknown function DUF808  57.79 
 
 		 302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0826  hypothetical protein  56.83 
 
 		 307 aa  320  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3292  hypothetical protein  56.29 
 
 		 311 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00376444  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1065  protein of unknown function DUF808  55.97 
 
 		 311 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.697461  hitchhiker  0.00968509 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2858  protein of unknown function DUF808  56.91 
 
 		 303 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1869  hypothetical protein  56.19 
 
 		 308 aa  317  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3513  hypothetical protein  55.97 
 
 		 311 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal  0.0378522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3619  hypothetical protein  58.84 
 
 		 304 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3388  hypothetical protein  55.97 
 
 		 311 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.982204  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2290  hypothetical protein  57.88 
 
 		 332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.222846  normal  0.0387634 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0817  hypothetical protein  53.87 
 
 		 314 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1584  protein of unknown function DUF808  57.88 
 
 		 332 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2514  hypothetical protein  57.82 
 
 		 307 aa  311  7.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1773  hypothetical protein  57.1 
 
 		 310 aa  311  9e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367738  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0281  hypothetical protein  55.13 
 
 		 307 aa  311  1e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.261162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1575  hypothetical protein  60.67 
 
 		 304 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1227  hypothetical protein  55.73 
 
 		 303 aa  310  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4294  hypothetical protein  60.67 
 
 		 304 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0255  hypothetical protein  55.31 
 
 		 307 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0444172  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1691  protein of unknown function DUF808  55.1 
 
 		 305 aa  309  5e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000308367  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2060  hypothetical protein  55.41 
 
 		 305 aa  309  5e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.001704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2190  hypothetical protein  55.41 
 
 		 305 aa  309  5e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1080  hypothetical protein  55.41 
 
 		 305 aa  309  5e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4843  hypothetical protein  54.82 
 
 		 325 aa  309  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1289  hypothetical protein  56.56 
 
 		 311 aa  308  9e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1685  hypothetical protein  55.1 
 
 		 305 aa  308  9e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590631  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2735  hypothetical protein  55.1 
 
 		 305 aa  308  9e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0246746  normal  0.396498 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0611  hypothetical protein  55.95 
 
 		 307 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901187  hitchhiker  0.00000167296 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3859  hypothetical protein  60.67 
 
 		 304 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.856782 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2548  hypothetical protein  53.7 
 
 		 303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0271849  normal  0.708081 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3288  hypothetical protein  54.69 
 
 		 316 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1061  hypothetical protein  60.46 
 
 		 312 aa  301  2e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3755  protein of unknown function DUF808  53.75 
 
 		 308 aa  300  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3424  hypothetical protein  60.15 
 
 		 304 aa  298  7e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03380  inner membrane protein YedI  59.57 
 
 		 313 aa  298  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1252  hypothetical protein  53.04 
 
 		 303 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.8726 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2205  hypothetical protein  53.04 
 
 		 303 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2148  hypothetical protein  53.04 
 
 		 303 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1130  hypothetical protein  53.04 
 
 		 303 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00137244  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2152  hypothetical protein  52.72 
 
 		 303 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0155438 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3095  hypothetical protein  54.1 
 
 		 328 aa  294  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000654386  normal  0.396631 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0478  hypothetical protein  53.7 
 
 		 305 aa  294  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1442  protein of unknown function DUF808  52.92 
 
 		 305 aa  293  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2902  hypothetical protein  50.63 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153256 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2772  hypothetical protein  56.19 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145384  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00476  hypothetical protein  52.96 
 
 		 309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0228  hypothetical protein  51.94 
 
 		 294 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3419  hypothetical protein  49.81 
 
 		 294 aa  256  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23547  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0229  hypothetical protein  50.97 
 
 		 294 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1755  protein of unknown function DUF808  42.95 
 
 		 289 aa  242  9e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2963  protein of unknown function DUF808  44.44 
 
 		 288 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000127698  hitchhiker  0.0000000223824 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1370  hypothetical protein  40.91 
 
 		 282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0968923  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2059  hypothetical protein  41.12 
 
 		 313 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0044  protein of unknown function DUF808  39.39 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1112  hypothetical protein  43.73 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0455  hypothetical protein  36.7 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1120  protein of unknown function DUF808  36 
 
 		 364 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1699  hypothetical protein  40.06 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2760  protein of unknown function DUF808  37.19 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0430  hypothetical protein  31.4 
 
 		 366 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000210959  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19730  hypothetical protein  37.37 
 
 		 366 aa  179  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0318347  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3303  protein of unknown function DUF808  41.67 
 
 		 317 aa  179  9e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.269589  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3043  hypothetical protein  43.28 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1113  hypothetical protein  40.3 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2445  protein of unknown function DUF808  40.98 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  hitchhiker  0.000000377935 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3328  hypothetical protein  36.92 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6658  hypothetical protein  36.52 
 
 		 341 aa  175  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04664  decreased coverage  0.00529763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2667  hypothetical protein  40.91 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2712  hypothetical protein  40.91 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2697  hypothetical protein  40.91 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.684359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2262  protein of unknown function DUF808  38.2 
 
 		 361 aa  173  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2188  hypothetical protein  44.53 
 
 		 322 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1422  hypothetical protein  41.67 
 
 		 314 aa  170  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322162  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1431  hypothetical protein  40.58 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.424656  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1739  hypothetical protein  45.11 
 
 		 315 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234932  normal  0.431557 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1923  protein of unknown function DUF808  39.27 
 
 		 338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275369  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>