121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1370 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1370  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  552  1e-156  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0968923  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3419  hypothetical protein  58.01 
 
 
294 aa  286  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23547  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1755  protein of unknown function DUF808  51.76 
 
 
289 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333708  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2963  protein of unknown function DUF808  52.46 
 
 
288 aa  263  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000127698  hitchhiker  0.0000000223824 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0421  membrane protein  46.21 
 
 
301 aa  247  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.637251  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1369  hypothetical protein  42.21 
 
 
324 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446398  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0826  hypothetical protein  46.88 
 
 
307 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001336  hypothetical protein  49.05 
 
 
301 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0685345  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2735  hypothetical protein  43.91 
 
 
309 aa  229  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1803  hypothetical protein  43.14 
 
 
319 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179201  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0255  hypothetical protein  44.15 
 
 
307 aa  226  4e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0444172  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1355  hypothetical protein  44.07 
 
 
306 aa  226  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283175  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05660  hypothetical protein  44.08 
 
 
311 aa  225  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3424  hypothetical protein  48.09 
 
 
304 aa  225  8e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2930  hypothetical protein  43.73 
 
 
310 aa  224  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245213  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3672  hypothetical protein  44.16 
 
 
302 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.882626  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0281  hypothetical protein  43.81 
 
 
307 aa  224  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.261162 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0220  hypothetical protein  41.12 
 
 
311 aa  223  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1584  protein of unknown function DUF808  43.51 
 
 
332 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3608  hypothetical protein  42.02 
 
 
314 aa  223  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3288  hypothetical protein  43.85 
 
 
316 aa  222  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0975  hypothetical protein  41.23 
 
 
308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.11841 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0956  hypothetical protein  42.44 
 
 
311 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2290  hypothetical protein  43.51 
 
 
332 aa  222  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.222846  normal  0.0387634 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1821  hypothetical protein  42.14 
 
 
321 aa  221  8e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1065  protein of unknown function DUF808  46.8 
 
 
311 aa  221  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.697461  hitchhiker  0.00968509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3292  hypothetical protein  46.8 
 
 
311 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00376444  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05226  hypothetical protein  45.36 
 
 
301 aa  221  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3513  hypothetical protein  46.8 
 
 
311 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal  0.0378522 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1013  hypothetical protein  41.35 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0900  hypothetical protein  44.19 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0817  hypothetical protein  40.84 
 
 
314 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0659  hypothetical protein  41.28 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000322319 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2148  hypothetical protein  43.84 
 
 
303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00476  hypothetical protein  46.26 
 
 
309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0308  hypothetical protein  40.91 
 
 
341 aa  219  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3388  hypothetical protein  47.01 
 
 
311 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.982204  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1869  hypothetical protein  42.71 
 
 
308 aa  219  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0979  hypothetical protein  40.91 
 
 
308 aa  219  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2205  hypothetical protein  43.15 
 
 
303 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1130  hypothetical protein  43.15 
 
 
303 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00137244  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1252  hypothetical protein  43.15 
 
 
303 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.8726 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1773  hypothetical protein  45.91 
 
 
310 aa  218  7e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40490  hypothetical protein  43.81 
 
 
307 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2152  hypothetical protein  42.81 
 
 
303 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0155438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3434  hypothetical protein  43.48 
 
 
307 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4843  hypothetical protein  39.88 
 
 
325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1691  protein of unknown function DUF808  42.72 
 
 
305 aa  215  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000308367  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2514  hypothetical protein  44.29 
 
 
307 aa  216  5e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2548  hypothetical protein  41.55 
 
 
303 aa  215  5.9999999999999996e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0271849  normal  0.708081 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1685  hypothetical protein  42.72 
 
 
305 aa  215  9e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590631  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2735  hypothetical protein  42.72 
 
 
305 aa  214  9e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0246746  normal  0.396498 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1442  protein of unknown function DUF808  41.86 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34086  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1289  hypothetical protein  41.48 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1151  hypothetical protein  44.14 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2060  hypothetical protein  43.73 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.001704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2190  hypothetical protein  43.73 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3648  protein of unknown function DUF808  41.14 
 
 
302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1227  hypothetical protein  43.73 
 
 
303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00309611  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1080  hypothetical protein  43.73 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231877  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3755  protein of unknown function DUF808  42.67 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2902  hypothetical protein  44.22 
 
 
310 aa  212  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.153256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1601  hypothetical protein  40.33 
 
 
304 aa  211  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251967  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4294  hypothetical protein  43.31 
 
 
304 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1575  hypothetical protein  42.91 
 
 
304 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226574  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1061  hypothetical protein  44.87 
 
 
312 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0611  hypothetical protein  41.86 
 
 
307 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901187  hitchhiker  0.00000167296 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2858  protein of unknown function DUF808  47.3 
 
 
303 aa  205  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0478  hypothetical protein  42.38 
 
 
305 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3859  hypothetical protein  40.81 
 
 
304 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.856782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3619  hypothetical protein  39.93 
 
 
304 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0228  hypothetical protein  43.01 
 
 
294 aa  199  5e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03380  inner membrane protein YedI  41.95 
 
 
313 aa  198  6e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3095  hypothetical protein  42.11 
 
 
328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000654386  normal  0.396631 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0229  hypothetical protein  42.31 
 
 
294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2772  hypothetical protein  41.64 
 
 
311 aa  193  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145384  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2059  hypothetical protein  37.14 
 
 
313 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603414  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1120  protein of unknown function DUF808  43.95 
 
 
364 aa  175  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0430  hypothetical protein  37.01 
 
 
366 aa  175  7e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000210959  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0044  protein of unknown function DUF808  36.19 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0455  hypothetical protein  41.45 
 
 
313 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1422  hypothetical protein  42.97 
 
 
314 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2760  protein of unknown function DUF808  38.28 
 
 
305 aa  165  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6658  hypothetical protein  40.36 
 
 
341 aa  165  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04664  decreased coverage  0.00529763 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19730  hypothetical protein  37.29 
 
 
366 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0318347  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3328  hypothetical protein  37.14 
 
 
314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1113  hypothetical protein  38.61 
 
 
311 aa  161  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1699  hypothetical protein  36.84 
 
 
322 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776311  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2445  protein of unknown function DUF808  43.37 
 
 
339 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  hitchhiker  0.000000377935 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1739  hypothetical protein  42.91 
 
 
315 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234932  normal  0.431557 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0752  hypothetical protein  42.97 
 
 
315 aa  156  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0384  protein of unknown function DUF808  39.72 
 
 
320 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3043  hypothetical protein  38.02 
 
 
330 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1939  hypothetical protein  36.99 
 
 
311 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123773  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1112  hypothetical protein  38.52 
 
 
316 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2667  hypothetical protein  40.96 
 
 
327 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2712  hypothetical protein  40.96 
 
 
327 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2697  hypothetical protein  40.96 
 
 
327 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.684359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2262  protein of unknown function DUF808  37.97 
 
 
361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6756  protein of unknown function DUF808  37.01 
 
 
345 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>