121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2760 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2760  protein of unknown function DUF808  100 
 
 
305 aa  612  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1120  protein of unknown function DUF808  47.67 
 
 
364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1113  hypothetical protein  49.17 
 
 
311 aa  246  4e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2059  hypothetical protein  45.51 
 
 
313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603414  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0455  hypothetical protein  45.86 
 
 
313 aa  239  4e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1422  hypothetical protein  48.44 
 
 
314 aa  236  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322162  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4402  hypothetical protein  50.48 
 
 
311 aa  236  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.976692  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2262  protein of unknown function DUF808  46.2 
 
 
361 aa  233  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3043  hypothetical protein  45.07 
 
 
330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1699  hypothetical protein  46.33 
 
 
322 aa  232  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776311  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0044  protein of unknown function DUF808  43.71 
 
 
324 aa  230  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3328  hypothetical protein  52.99 
 
 
314 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2188  hypothetical protein  52.29 
 
 
322 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1112  hypothetical protein  46.64 
 
 
316 aa  224  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6658  hypothetical protein  42.68 
 
 
341 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04664  decreased coverage  0.00529763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6756  protein of unknown function DUF808  49.82 
 
 
345 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275375  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19730  hypothetical protein  44.52 
 
 
366 aa  218  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0318347  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1616  protein of unknown function DUF808  41.35 
 
 
313 aa  217  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3147  protein of unknown function DUF808  46.84 
 
 
336 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2445  protein of unknown function DUF808  44.15 
 
 
339 aa  215  7e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  hitchhiker  0.000000377935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1548  protein of unknown function DUF808  47.65 
 
 
331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  hitchhiker  0.00682503 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1739  hypothetical protein  43.67 
 
 
315 aa  211  7.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234932  normal  0.431557 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1923  protein of unknown function DUF808  46.73 
 
 
338 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275369  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3303  protein of unknown function DUF808  44.37 
 
 
317 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.269589  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2902  hypothetical protein  42.77 
 
 
310 aa  206  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.153256 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0421  membrane protein  38.54 
 
 
301 aa  206  5e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.637251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40490  hypothetical protein  38.51 
 
 
307 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1431  hypothetical protein  48.16 
 
 
314 aa  205  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.424656  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3434  hypothetical protein  38.51 
 
 
307 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2958  hypothetical protein  49.8 
 
 
323 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0384  protein of unknown function DUF808  46.04 
 
 
320 aa  202  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1603  hypothetical protein  49.8 
 
 
323 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0499282  normal  0.0520062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1746  hypothetical protein  47.74 
 
 
330 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3672  hypothetical protein  40.32 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.882626  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1803  hypothetical protein  40 
 
 
319 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179201  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1388  hypothetical protein  50 
 
 
323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.19024  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2082  protein of unknown function DUF808  47.1 
 
 
330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00053497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2667  hypothetical protein  48.58 
 
 
327 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2712  hypothetical protein  48.58 
 
 
327 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2697  hypothetical protein  48.58 
 
 
327 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.684359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3424  hypothetical protein  40.58 
 
 
304 aa  199  7e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3648  protein of unknown function DUF808  39.71 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0220  hypothetical protein  37.78 
 
 
311 aa  196  6e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05226  hypothetical protein  38.57 
 
 
301 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4843  hypothetical protein  37.04 
 
 
325 aa  195  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1939  hypothetical protein  42.38 
 
 
311 aa  195  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123773  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1355  hypothetical protein  37.74 
 
 
306 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283175  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2858  protein of unknown function DUF808  40.77 
 
 
303 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4415  hypothetical protein  44.26 
 
 
317 aa  193  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05660  hypothetical protein  38.68 
 
 
311 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0659  hypothetical protein  35.62 
 
 
311 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000322319 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1584  protein of unknown function DUF808  37.98 
 
 
332 aa  190  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0752  hypothetical protein  48.79 
 
 
315 aa  190  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3095  hypothetical protein  37.38 
 
 
328 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000654386  normal  0.396631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2290  hypothetical protein  37.98 
 
 
332 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.222846  normal  0.0387634 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1601  hypothetical protein  38.26 
 
 
304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251967  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0611  hypothetical protein  42.53 
 
 
307 aa  189  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901187  hitchhiker  0.00000167296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2205  hypothetical protein  38.33 
 
 
303 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1130  hypothetical protein  38.33 
 
 
303 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00137244  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2152  hypothetical protein  38.33 
 
 
303 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0155438 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1252  hypothetical protein  38.33 
 
 
303 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.8726 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0308  hypothetical protein  36.18 
 
 
341 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2148  hypothetical protein  38 
 
 
303 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4294  hypothetical protein  39.03 
 
 
304 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1821  hypothetical protein  34.06 
 
 
321 aa  186  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001336  hypothetical protein  37.88 
 
 
301 aa  186  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0685345  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1369  hypothetical protein  35.42 
 
 
324 aa  186  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446398  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2548  hypothetical protein  38.67 
 
 
303 aa  186  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0271849  normal  0.708081 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2930  hypothetical protein  35 
 
 
310 aa  186  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245213  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13109  integral membrane protein  42.3 
 
 
306 aa  186  6e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0328248  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2735  hypothetical protein  38.85 
 
 
305 aa  185  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0246746  normal  0.396498 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1691  protein of unknown function DUF808  38.85 
 
 
305 aa  185  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000308367  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2060  hypothetical protein  38.85 
 
 
305 aa  185  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.001704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2190  hypothetical protein  38.85 
 
 
305 aa  185  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1685  hypothetical protein  38.85 
 
 
305 aa  185  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590631  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1227  hypothetical protein  38.85 
 
 
303 aa  185  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00309611  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1080  hypothetical protein  38.85 
 
 
305 aa  185  8e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231877  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0975  hypothetical protein  37.05 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.11841 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0826  hypothetical protein  36.93 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1575  hypothetical protein  38.29 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226574  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3859  hypothetical protein  40.67 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.856782 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3292  hypothetical protein  35.37 
 
 
311 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00376444  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3619  hypothetical protein  39.93 
 
 
304 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0979  hypothetical protein  37.05 
 
 
308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1151  hypothetical protein  37.77 
 
 
308 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03380  inner membrane protein YedI  37.54 
 
 
313 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1442  protein of unknown function DUF808  37.66 
 
 
305 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34086  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3513  hypothetical protein  35.03 
 
 
311 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal  0.0378522 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2735  hypothetical protein  38.4 
 
 
309 aa  179  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3388  hypothetical protein  35.03 
 
 
311 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.982204  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3755  protein of unknown function DUF808  37.91 
 
 
308 aa  179  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1065  protein of unknown function DUF808  34.35 
 
 
311 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.697461  hitchhiker  0.00968509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1013  hypothetical protein  36.33 
 
 
308 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3288  hypothetical protein  35.67 
 
 
316 aa  178  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3608  hypothetical protein  35.69 
 
 
314 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1755  protein of unknown function DUF808  40.79 
 
 
289 aa  176  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333708  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0956  hypothetical protein  35.87 
 
 
311 aa  175  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1870  hypothetical protein  44.81 
 
 
337 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1289  hypothetical protein  36.19 
 
 
311 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0900  hypothetical protein  34.56 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>