121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4402 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4402  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  593  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.976692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2059  hypothetical protein  62.22 
 
 		 313 aa  321  8e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1422  hypothetical protein  62.72 
 
 		 314 aa  309  4e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322162  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3043  hypothetical protein  59.68 
 
 		 330 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1120  protein of unknown function DUF808  57.7 
 
 		 364 aa  308  8e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0044  protein of unknown function DUF808  55.27 
 
 		 324 aa  306  3e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2262  protein of unknown function DUF808  56.05 
 
 		 361 aa  302  5.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6658  hypothetical protein  55.32 
 
 		 341 aa  295  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04664  decreased coverage  0.00529763 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1113  hypothetical protein  57.19 
 
 		 311 aa  291  8e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3303  protein of unknown function DUF808  55.91 
 
 		 317 aa  278  8e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.269589  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6756  protein of unknown function DUF808  56.77 
 
 		 345 aa  277  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275375  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2445  protein of unknown function DUF808  55.91 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  hitchhiker  0.000000377935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2760  protein of unknown function DUF808  52.43 
 
 		 305 aa  273  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1431  hypothetical protein  57.49 
 
 		 314 aa  272  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.424656  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0455  hypothetical protein  51.77 
 
 		 313 aa  268  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2188  hypothetical protein  56.72 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1699  hypothetical protein  53.59 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3147  protein of unknown function DUF808  57.84 
 
 		 336 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0384  protein of unknown function DUF808  54.21 
 
 		 320 aa  265  8e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1739  hypothetical protein  56.15 
 
 		 315 aa  264  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234932  normal  0.431557 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3328  hypothetical protein  48.56 
 
 		 314 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1923  protein of unknown function DUF808  56.77 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1548  protein of unknown function DUF808  59.14 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  hitchhiker  0.00682503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1112  hypothetical protein  51.38 
 
 		 316 aa  258  7e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1746  hypothetical protein  57.64 
 
 		 330 aa  257  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2082  protein of unknown function DUF808  57.46 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00053497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1939  hypothetical protein  53.02 
 
 		 311 aa  255  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2667  hypothetical protein  56.1 
 
 		 327 aa  255  7e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2712  hypothetical protein  56.1 
 
 		 327 aa  255  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2697  hypothetical protein  56.1 
 
 		 327 aa  255  7e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.684359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19730  hypothetical protein  51.14 
 
 		 366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0318347  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4415  hypothetical protein  56.16 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1616  protein of unknown function DUF808  50 
 
 		 313 aa  246  4e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2958  hypothetical protein  57.39 
 
 		 323 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1603  hypothetical protein  57.39 
 
 		 323 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0499282  normal  0.0520062 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4423  protein of unknown function DUF808  58.19 
 
 		 320 aa  239  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1388  hypothetical protein  57.04 
 
 		 323 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.19024  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1013  hypothetical protein  44.06 
 
 		 308 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1355  hypothetical protein  43.95 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1442  protein of unknown function DUF808  48.92 
 
 		 305 aa  232  8.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0975  hypothetical protein  43.75 
 
 		 308 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11841 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3672  hypothetical protein  50.16 
 
 		 302 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.882626  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0611  hypothetical protein  43.85 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901187  hitchhiker  0.00000167296 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2930  hypothetical protein  43.12 
 
 		 310 aa  228  7e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245213  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0752  hypothetical protein  49.83 
 
 		 315 aa  228  8e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0979  hypothetical protein  43.75 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1151  hypothetical protein  43.12 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13109  integral membrane protein  51.97 
 
 		 306 aa  225  6e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0328248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1870  hypothetical protein  52.96 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3434  hypothetical protein  48.55 
 
 		 307 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1685  hypothetical protein  44.38 
 
 		 305 aa  222  8e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590631  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1691  protein of unknown function DUF808  44.38 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000308367  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2060  hypothetical protein  44.38 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.001704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2190  hypothetical protein  44.38 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1227  hypothetical protein  44.38 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1080  hypothetical protein  44.38 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1803  hypothetical protein  47.3 
 
 		 319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179201  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2735  hypothetical protein  44.38 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0246746  normal  0.396498 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05660  hypothetical protein  44.62 
 
 		 311 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0220  hypothetical protein  45.2 
 
 		 311 aa  220  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40490  hypothetical protein  48.55 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1252  hypothetical protein  44.06 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.8726 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2148  hypothetical protein  46.03 
 
 		 303 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2205  hypothetical protein  44.06 
 
 		 303 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1130  hypothetical protein  44.06 
 
 		 303 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00137244  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2548  hypothetical protein  43.12 
 
 		 303 aa  218  7.999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0271849  normal  0.708081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1575  hypothetical protein  50 
 
 		 304 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3292  hypothetical protein  45.52 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00376444  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0826  hypothetical protein  42.99 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4843  hypothetical protein  45.37 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4294  hypothetical protein  49.64 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2735  hypothetical protein  43.85 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2152  hypothetical protein  43.75 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0155438 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1065  protein of unknown function DUF808  45.52 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.697461  hitchhiker  0.00968509 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3388  hypothetical protein  46.77 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.982204  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3513  hypothetical protein  46.77 
 
 		 311 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal  0.0378522 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0421  membrane protein  41.53 
 
 		 301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.637251  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0817  hypothetical protein  40.13 
 
 		 314 aa  215  9e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2290  hypothetical protein  47.2 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.222846  normal  0.0387634 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1584  protein of unknown function DUF808  47.2 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3648  protein of unknown function DUF808  45.79 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1369  hypothetical protein  42.94 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0659  hypothetical protein  43.63 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000322319 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0956  hypothetical protein  40.73 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1601  hypothetical protein  43.04 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251967  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0281  hypothetical protein  42.63 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.261162 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22260  hypothetical protein  52.79 
 
 		 317 aa  211  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0255  hypothetical protein  42.63 
 
 		 307 aa  209  3e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0444172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0308  hypothetical protein  40.18 
 
 		 341 aa  208  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1773  hypothetical protein  41.77 
 
 		 310 aa  208  9e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367738  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0900  hypothetical protein  46.33 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2858  protein of unknown function DUF808  43.4 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3619  hypothetical protein  46.72 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1869  hypothetical protein  45.58 
 
 		 308 aa  205  8e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3608  hypothetical protein  40.99 
 
 		 314 aa  205  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3095  hypothetical protein  45.96 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000654386  normal  0.396631 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05226  hypothetical protein  47.04 
 
 		 301 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3424  hypothetical protein  45.59 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3859  hypothetical protein  46.35 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.856782 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3435  protein of unknown function DUF808  52.48 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>