121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1870 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1870  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  661    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3435  protein of unknown function DUF808  83.81 
 
 
351 aa  425  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19730  hypothetical protein  59.82 
 
 
366 aa  330  2e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0318347  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2262  protein of unknown function DUF808  61.06 
 
 
361 aa  327  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2445  protein of unknown function DUF808  62.67 
 
 
339 aa  317  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  hitchhiker  0.000000377935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0044  protein of unknown function DUF808  51.71 
 
 
324 aa  317  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0384  protein of unknown function DUF808  61.62 
 
 
320 aa  306  3e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2667  hypothetical protein  58.97 
 
 
327 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2712  hypothetical protein  58.97 
 
 
327 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2697  hypothetical protein  58.97 
 
 
327 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.684359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3303  protein of unknown function DUF808  59.02 
 
 
317 aa  293  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.269589  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1431  hypothetical protein  62.5 
 
 
314 aa  292  6e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.424656  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1939  hypothetical protein  58.31 
 
 
311 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123773  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0752  hypothetical protein  55.18 
 
 
315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4415  hypothetical protein  58.92 
 
 
317 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1120  protein of unknown function DUF808  52.55 
 
 
364 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1422  hypothetical protein  55.74 
 
 
314 aa  264  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322162  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1113  hypothetical protein  53.29 
 
 
311 aa  263  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1616  protein of unknown function DUF808  50.33 
 
 
313 aa  257  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4423  protein of unknown function DUF808  62.2 
 
 
320 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1699  hypothetical protein  52.92 
 
 
322 aa  249  4e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776311  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15650  hypothetical protein  62 
 
 
315 aa  249  5e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0737154  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22260  hypothetical protein  55.42 
 
 
317 aa  245  8e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13109  integral membrane protein  54.61 
 
 
306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0328248  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1112  hypothetical protein  53.61 
 
 
316 aa  238  8e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2059  hypothetical protein  48.59 
 
 
313 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603414  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2188  hypothetical protein  51.66 
 
 
322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3043  hypothetical protein  49.19 
 
 
330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0455  hypothetical protein  47.06 
 
 
313 aa  227  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3328  hypothetical protein  46.56 
 
 
314 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4402  hypothetical protein  52.96 
 
 
311 aa  223  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.976692  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6658  hypothetical protein  44.95 
 
 
341 aa  215  9e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04664  decreased coverage  0.00529763 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2760  protein of unknown function DUF808  45.52 
 
 
305 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1739  hypothetical protein  47.83 
 
 
315 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234932  normal  0.431557 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1923  protein of unknown function DUF808  51.1 
 
 
338 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275369  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3147  protein of unknown function DUF808  50.97 
 
 
336 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1548  protein of unknown function DUF808  46.79 
 
 
331 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  hitchhiker  0.00682503 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0826  hypothetical protein  42.03 
 
 
307 aa  197  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1388  hypothetical protein  50.18 
 
 
323 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.19024  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2930  hypothetical protein  39.27 
 
 
310 aa  194  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245213  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3434  hypothetical protein  42.41 
 
 
307 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0900  hypothetical protein  40.95 
 
 
310 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1746  hypothetical protein  49.2 
 
 
330 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2082  protein of unknown function DUF808  48.72 
 
 
330 aa  194  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00053497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0975  hypothetical protein  39.93 
 
 
308 aa  192  9e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.11841 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6756  protein of unknown function DUF808  47.1 
 
 
345 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275375  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40490  hypothetical protein  41.46 
 
 
307 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0611  hypothetical protein  43.25 
 
 
307 aa  189  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901187  hitchhiker  0.00000167296 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0281  hypothetical protein  37.31 
 
 
307 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.261162 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1013  hypothetical protein  39.93 
 
 
308 aa  189  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0956  hypothetical protein  40.45 
 
 
311 aa  189  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2958  hypothetical protein  50.96 
 
 
323 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1603  hypothetical protein  50.96 
 
 
323 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0499282  normal  0.0520062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0979  hypothetical protein  39.6 
 
 
308 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1065  protein of unknown function DUF808  39.26 
 
 
311 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.697461  hitchhiker  0.00968509 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0817  hypothetical protein  38.22 
 
 
314 aa  186  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1151  hypothetical protein  39.93 
 
 
308 aa  186  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05660  hypothetical protein  41.74 
 
 
311 aa  186  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0255  hypothetical protein  38.76 
 
 
307 aa  185  8e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0444172  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3292  hypothetical protein  38.93 
 
 
311 aa  185  8e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00376444  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0220  hypothetical protein  40.91 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1821  hypothetical protein  37.99 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1773  hypothetical protein  40.63 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367738  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3513  hypothetical protein  38.59 
 
 
311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal  0.0378522 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1355  hypothetical protein  40.13 
 
 
306 aa  182  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283175  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3388  hypothetical protein  38.59 
 
 
311 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.982204  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3424  hypothetical protein  44.09 
 
 
304 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3419  hypothetical protein  44.53 
 
 
294 aa  176  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23547  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2858  protein of unknown function DUF808  41.88 
 
 
303 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3648  protein of unknown function DUF808  38.71 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2735  hypothetical protein  36.22 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0659  hypothetical protein  39.54 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000322319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1442  protein of unknown function DUF808  42.04 
 
 
305 aa  172  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34086  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1369  hypothetical protein  38.72 
 
 
324 aa  172  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446398  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4843  hypothetical protein  39.25 
 
 
325 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05226  hypothetical protein  38.94 
 
 
301 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1691  protein of unknown function DUF808  40.2 
 
 
305 aa  169  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000308367  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2060  hypothetical protein  40.2 
 
 
305 aa  169  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.001704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2190  hypothetical protein  40.2 
 
 
305 aa  169  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1685  hypothetical protein  40.2 
 
 
305 aa  169  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590631  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1227  hypothetical protein  40.2 
 
 
303 aa  169  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00309611  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1080  hypothetical protein  40.2 
 
 
305 aa  169  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2735  hypothetical protein  40.2 
 
 
305 aa  169  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0246746  normal  0.396498 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2514  hypothetical protein  38.14 
 
 
307 aa  169  7e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2152  hypothetical protein  38.46 
 
 
303 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0155438 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1869  hypothetical protein  41.06 
 
 
308 aa  169  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1601  hypothetical protein  38.1 
 
 
304 aa  169  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251967  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2205  hypothetical protein  38.46 
 
 
303 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1130  hypothetical protein  38.46 
 
 
303 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00137244  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1252  hypothetical protein  38.46 
 
 
303 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.8726 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1755  protein of unknown function DUF808  38.39 
 
 
289 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333708  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0478  hypothetical protein  41.43 
 
 
305 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2148  hypothetical protein  38.46 
 
 
303 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2548  hypothetical protein  37.58 
 
 
303 aa  166  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0271849  normal  0.708081 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001336  hypothetical protein  37.95 
 
 
301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0685345  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3672  hypothetical protein  40.13 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.882626  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1370  hypothetical protein  35.94 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0968923  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1575  hypothetical protein  40.94 
 
 
304 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226574  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0421  membrane protein  36.81 
 
 
301 aa  164  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.637251  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3288  hypothetical protein  36.28 
 
 
316 aa  162  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>