121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1616 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1616  protein of unknown function DUF808  100 
 
 		 313 aa  608  1e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0044  protein of unknown function DUF808  51.28 
 
 		 324 aa  296  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1120  protein of unknown function DUF808  52.48 
 
 		 364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2262  protein of unknown function DUF808  50.63 
 
 		 361 aa  281  7.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2445  protein of unknown function DUF808  52.72 
 
 		 339 aa  266  4e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  hitchhiker  0.000000377935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1939  hypothetical protein  52.48 
 
 		 311 aa  249  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3303  protein of unknown function DUF808  51.48 
 
 		 317 aa  246  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.269589  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19730  hypothetical protein  47.96 
 
 		 366 aa  245  6.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0318347  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0384  protein of unknown function DUF808  49.83 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2667  hypothetical protein  50.34 
 
 		 327 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2712  hypothetical protein  50.34 
 
 		 327 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2697  hypothetical protein  50.34 
 
 		 327 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.684359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1431  hypothetical protein  50.34 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.424656  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1113  hypothetical protein  47.45 
 
 		 311 aa  239  4e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0752  hypothetical protein  50.17 
 
 		 315 aa  238  6.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4415  hypothetical protein  52.72 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1422  hypothetical protein  50.51 
 
 		 314 aa  235  7e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6658  hypothetical protein  44.55 
 
 		 341 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04664  decreased coverage  0.00529763 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0455  hypothetical protein  44.94 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3043  hypothetical protein  50.57 
 
 		 330 aa  228  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3328  hypothetical protein  42.99 
 
 		 314 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2059  hypothetical protein  45.21 
 
 		 313 aa  222  8e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13109  integral membrane protein  50.33 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0328248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1739  hypothetical protein  46.52 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234932  normal  0.431557 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22260  hypothetical protein  50.66 
 
 		 317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1870  hypothetical protein  50.33 
 
 		 337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1699  hypothetical protein  46.41 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2760  protein of unknown function DUF808  46.96 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4423  protein of unknown function DUF808  50.52 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1112  hypothetical protein  46.3 
 
 		 316 aa  211  9e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2188  hypothetical protein  44.04 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3435  protein of unknown function DUF808  50 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4402  hypothetical protein  50 
 
 		 311 aa  198  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.976692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6756  protein of unknown function DUF808  43.87 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275375  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15650  hypothetical protein  48.87 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0737154  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1923  protein of unknown function DUF808  46.3 
 
 		 338 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3648  protein of unknown function DUF808  42.15 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2958  hypothetical protein  47.17 
 
 		 323 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1603  hypothetical protein  47.17 
 
 		 323 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0499282  normal  0.0520062 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1388  hypothetical protein  46.64 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.19024  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2152  hypothetical protein  40.19 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0155438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3147  protein of unknown function DUF808  45.63 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1252  hypothetical protein  39.87 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.8726 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2205  hypothetical protein  39.87 
 
 		 303 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1130  hypothetical protein  39.87 
 
 		 303 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00137244  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1548  protein of unknown function DUF808  49.41 
 
 		 331 aa  188  9e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  hitchhiker  0.00682503 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1355  hypothetical protein  40.76 
 
 		 306 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2148  hypothetical protein  39.24 
 
 		 303 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0421  membrane protein  42.91 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.637251  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05226  hypothetical protein  38.49 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001336  hypothetical protein  39.5 
 
 		 301 aa  182  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0685345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4843  hypothetical protein  40.41 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2735  hypothetical protein  38.63 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0246746  normal  0.396498 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2060  hypothetical protein  38.36 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.001704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2190  hypothetical protein  38.36 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1685  hypothetical protein  38.36 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590631  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1227  hypothetical protein  38.36 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1080  hypothetical protein  38.36 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231877  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1691  protein of unknown function DUF808  38.36 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000308367  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1746  hypothetical protein  44.81 
 
 		 330 aa  178  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2930  hypothetical protein  38.75 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245213  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2082  protein of unknown function DUF808  45.13 
 
 		 330 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00053497 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1821  hypothetical protein  36.47 
 
 		 321 aa  176  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0900  hypothetical protein  37.04 
 
 		 310 aa  176  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1803  hypothetical protein  41.4 
 
 		 319 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179201  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0281  hypothetical protein  37.54 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.261162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3434  hypothetical protein  38.02 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0255  hypothetical protein  36.59 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0444172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0826  hypothetical protein  39.24 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0659  hypothetical protein  38.44 
 
 		 311 aa  172  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000322319 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0220  hypothetical protein  39.69 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3095  hypothetical protein  40.25 
 
 		 328 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000654386  normal  0.396631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0975  hypothetical protein  37.74 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2902  hypothetical protein  40.78 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0979  hypothetical protein  37.74 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1151  hypothetical protein  36.62 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1584  protein of unknown function DUF808  39.87 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2290  hypothetical protein  39.54 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.222846  normal  0.0387634 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3672  hypothetical protein  39.75 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.882626  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2548  hypothetical protein  37.06 
 
 		 303 aa  169  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0271849  normal  0.708081 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0308  hypothetical protein  37.8 
 
 		 341 aa  169  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1013  hypothetical protein  37.85 
 
 		 308 aa  168  9e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40490  hypothetical protein  37.38 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3755  protein of unknown function DUF808  37.73 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2735  hypothetical protein  37.22 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3424  hypothetical protein  40.07 
 
 		 304 aa  165  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1369  hypothetical protein  40.69 
 
 		 324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3619  hypothetical protein  37.66 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2858  protein of unknown function DUF808  42.63 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4294  hypothetical protein  41.6 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1065  protein of unknown function DUF808  37.74 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.697461  hitchhiker  0.00968509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3292  hypothetical protein  37.74 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00376444  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3513  hypothetical protein  38.24 
 
 		 311 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.458451  normal  0.0378522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0956  hypothetical protein  35.22 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1289  hypothetical protein  39.2 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3388  hypothetical protein  38.24 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.982204  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0817  hypothetical protein  36.96 
 
 		 314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2514  hypothetical protein  38.17 
 
 		 307 aa  162  9e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3859  hypothetical protein  40.84 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.856782 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05660  hypothetical protein  39.1 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>