110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4327 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4327  phospholipid N-methyltransferase protein  100 
 
 
199 aa  410  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4590  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase or phosphatidyl-N-methylethanolaminen-methyltransferase  87.94 
 
 
199 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486089  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3542  hypothetical protein  67.17 
 
 
200 aa  289  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0349  methyltransferase  67.86 
 
 
197 aa  287  7e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0788  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  61.98 
 
 
199 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.199665  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2043  phospholipid N-methyltransferase  61.46 
 
 
199 aa  253  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114973  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2127  phospholipid N-methyltransferase  60.42 
 
 
198 aa  243  9e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0681  ribosomal RNA adenine methylase transferase  58.85 
 
 
202 aa  239  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0130  ribosomal RNA adenine methylase transferase  38.22 
 
 
264 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0431  ribosomal RNA adenine methylase transferase  36.56 
 
 
200 aa  141  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2957  Methyltransferase type 12  38.71 
 
 
284 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3921  phospholipid N-methyltransferase  36.02 
 
 
212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.785681  normal  0.164521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6272  phospholipid N-methyltransferase  36.22 
 
 
206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552401  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6929  phospholipid N-methyltransferase  35.87 
 
 
208 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0389  putative phospholipid N-methyltransferase  36.02 
 
 
200 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0157  ribosomal RNA adenine methylase transferase  36.56 
 
 
200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0199  ribosomal RNA adenine methylase transferase  35.33 
 
 
200 aa  135  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0355  phospholipid N-methyltransferase  38.59 
 
 
205 aa  134  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191687  normal  0.556592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0331  ribosomal RNA adenine methylase transferase  35.48 
 
 
200 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3188  phospholipid N-methyltransferase  36.56 
 
 
218 aa  131  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.105598 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2962  phospholipid N-methyltransferase  36.56 
 
 
218 aa  131  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.422208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0193  phospholipid N-methyltransferase  34.05 
 
 
200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1641  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3144  phospholipid N-methyltransferase  36.02 
 
 
218 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0338  ribosomal RNA adenine methylase transferase  33.52 
 
 
201 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0870477  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5159  methyltransferase type 11  36.56 
 
 
196 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3314  methyltransferase type 11  36.56 
 
 
196 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0802938 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2854  phospholipid N-methyltransferase-like  35.33 
 
 
196 aa  95.5  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4790  methyltransferase type 12  35.8 
 
 
196 aa  95.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310802  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3377  methyltransferase type 12  35.8 
 
 
196 aa  95.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4139  methyltransferase type 12  35.8 
 
 
196 aa  95.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0746  methyltransferase type 11  31.64 
 
 
200 aa  94.7  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0943424  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0594  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  31.64 
 
 
200 aa  94.7  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0572  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  29.44 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.667801  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1193  methyltransferase type 12  31.91 
 
 
190 aa  88.2  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4983  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  28.04 
 
 
192 aa  87  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4954  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  28.57 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1627  hypothetical protein  30.77 
 
 
228 aa  87  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3006  hypothetical protein  29.5 
 
 
228 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0961  hypothetical protein  29.5 
 
 
228 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0281  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  28.57 
 
 
192 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4968  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  28.04 
 
 
192 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2896  phospholipid N-methyltransferase PmtA  30.73 
 
 
214 aa  85.1  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2958  phospholipid N-methyltransferase PmtA  30.73 
 
 
214 aa  85.1  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0444  hypothetical protein  30.73 
 
 
214 aa  84.7  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2589  phospholipid N-methyltransferase PmtA  30.73 
 
 
214 aa  84.7  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0186  phospholipid N-methyltransferase PmtA  30.73 
 
 
214 aa  84.7  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4561  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  26.98 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000778577  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2771  phospholipid N-methyltransferase  29.83 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4721  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  26.98 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4577  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  26.98 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5083  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  26.98 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3372  phospholipid N-methyltransferase-like protein  28.8 
 
 
189 aa  82  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0102  Methyltransferase type 12  32.97 
 
 
223 aa  81.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4878  ribosomal RNA adenine methylase transferase  30.16 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00569691  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0112  Methyltransferase type 12  31.89 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4944  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  26.46 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4668  ribosomal RNA adenine dimethylase  27.51 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1365  phospholipid N-methyltransferase  30.39 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.759046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2253  Methyltransferase type 12  28.95 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4803  adenosine dimethyl transferase  26.63 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000013839  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2781  phospholipid N-methyltransferase-like protein  32.84 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3294  putative methyltransferase  28.26 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.348454  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3144  putative methyltransferase  28.26 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.875081  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3283  putative methyltransferase  28.26 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5256  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  27.81 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1211  phospholipid N-methyltransferase  28.19 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0146492 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2818  Methyltransferase type 12  28.18 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.973514  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19850  phospholipid N-methyltransferase  29.41 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0199133  decreased coverage  0.0000402222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0915  methyltransferase type 12  29.73 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1013  methyltransferase  26.7 
 
 
185 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.699985 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2651  Ribosomal RNA adenine methylase transferase- like protein  29 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3870  hypothetical protein  27.32 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0359454 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0962  hypothetical protein  24.73 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2392  methyltransferase type 12  29.73 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.449799  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3775  hypothetical protein  31.61 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651573 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3985  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349003  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7010  hypothetical protein  32.62 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  hitchhiker  0.000974477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0154  phospholipid N-methyltransferase  28.5 
 
 
228 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0096  generic methyltransferase  29.41 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3529  methyltransferase type 12  27.57 
 
 
207 aa  61.6  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354296  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1604  methyltransferase type 12  27.92 
 
 
212 aa  61.2  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.614347  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2857  hypothetical protein  28.41 
 
 
180 aa  58.9  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1585  phospholipid N-methyltransferase-like protein  24.73 
 
 
208 aa  57.8  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0911631  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3906  putative phospholipid N-methyltransferase  29.08 
 
 
169 aa  54.7  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5377  Methyltransferase type 12  27.92 
 
 
234 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3996  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  30.23 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518613  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0287  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
195 aa  52  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0502  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  23.4 
 
 
183 aa  45.8  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.46 
 
 
258 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0706  dimethyladenosine transferase  27.27 
 
 
281 aa  45.1  0.0007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.486021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  30.25 
 
 
258 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1187  dimethyladenosine transferase  32.5 
 
 
274 aa  43.9  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  23.37 
 
 
258 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  29.46 
 
 
276 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  28.89 
 
 
275 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_002950  PG0135  dimethyladenosine transferase  25.33 
 
 
258 aa  42.4  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  37.33 
 
 
280 aa  42.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  32.63 
 
 
258 aa  42.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3573  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.74 
 
 
377 aa  42  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.716424  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 
220 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>