96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3006 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0961  hypothetical protein  99.12 
 
 
228 aa  447  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3006  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2589  phospholipid N-methyltransferase PmtA  99.07 
 
 
214 aa  417  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2896  phospholipid N-methyltransferase PmtA  100 
 
 
214 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2958  phospholipid N-methyltransferase PmtA  100 
 
 
214 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0444  hypothetical protein  99.07 
 
 
214 aa  417  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0186  phospholipid N-methyltransferase PmtA  99.07 
 
 
214 aa  417  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1627  hypothetical protein  93.86 
 
 
228 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4878  ribosomal RNA adenine methylase transferase  69.86 
 
 
238 aa  280  9e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00569691  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1193  methyltransferase type 12  58.73 
 
 
190 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0915  methyltransferase type 12  50.81 
 
 
206 aa  168  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0112  Methyltransferase type 12  49.17 
 
 
223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0102  Methyltransferase type 12  49.17 
 
 
223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3372  phospholipid N-methyltransferase-like protein  46.32 
 
 
189 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0355  phospholipid N-methyltransferase  42.31 
 
 
205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191687  normal  0.556592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0130  ribosomal RNA adenine methylase transferase  38.12 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0157  ribosomal RNA adenine methylase transferase  42.27 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0199  ribosomal RNA adenine methylase transferase  42.78 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2957  Methyltransferase type 12  41.41 
 
 
284 aa  125  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3906  putative phospholipid N-methyltransferase  44.65 
 
 
169 aa  124  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0331  ribosomal RNA adenine methylase transferase  42.47 
 
 
200 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3188  phospholipid N-methyltransferase  41.58 
 
 
218 aa  121  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.105598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3144  phospholipid N-methyltransferase  42.05 
 
 
218 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0193  phospholipid N-methyltransferase  40.74 
 
 
200 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1641  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2962  phospholipid N-methyltransferase  40.58 
 
 
218 aa  119  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.422208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3921  phospholipid N-methyltransferase  39.89 
 
 
212 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.785681  normal  0.164521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0389  putative phospholipid N-methyltransferase  40.53 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6272  phospholipid N-methyltransferase  39.89 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552401  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0338  ribosomal RNA adenine methylase transferase  43.02 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0870477  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0431  ribosomal RNA adenine methylase transferase  40.53 
 
 
200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3314  methyltransferase type 11  42.7 
 
 
196 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0802938 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5159  methyltransferase type 11  42.16 
 
 
196 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6929  phospholipid N-methyltransferase  37.23 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2854  phospholipid N-methyltransferase-like  41.4 
 
 
196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3377  methyltransferase type 12  42.86 
 
 
196 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4790  methyltransferase type 12  42.86 
 
 
196 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310802  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4139  methyltransferase type 12  42.86 
 
 
196 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0572  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  38.17 
 
 
187 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.667801  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2392  methyltransferase type 12  39.15 
 
 
185 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.449799  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0746  methyltransferase type 11  37.7 
 
 
200 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0943424  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0594  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  37.7 
 
 
200 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0681  ribosomal RNA adenine methylase transferase  32.98 
 
 
202 aa  92  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2818  Methyltransferase type 12  33.15 
 
 
191 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.973514  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2771  phospholipid N-methyltransferase  35.11 
 
 
192 aa  90.1  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4954  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  28.93 
 
 
192 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5083  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  29.29 
 
 
192 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4721  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  29.29 
 
 
192 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4968  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  29.32 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19850  phospholipid N-methyltransferase  36.08 
 
 
196 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0199133  decreased coverage  0.0000402222 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2857  hypothetical protein  40.76 
 
 
180 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3542  hypothetical protein  28.72 
 
 
200 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4577  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  29.84 
 
 
192 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4327  phospholipid N-methyltransferase protein  29.5 
 
 
199 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4561  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  29.32 
 
 
192 aa  85.9  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000778577  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4983  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  27.92 
 
 
192 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4944  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  27.41 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0962  hypothetical protein  28.96 
 
 
191 aa  82  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0281  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  26.4 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0788  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  29.26 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.199665  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4803  adenosine dimethyl transferase  26.9 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000013839  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4590  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase or phosphatidyl-N-methylethanolaminen-methyltransferase  30.27 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486089  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5256  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  26.4 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2043  phospholipid N-methyltransferase  28.19 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3996  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  34.38 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518613  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2253  Methyltransferase type 12  37.11 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7010  hypothetical protein  35.45 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  hitchhiker  0.000974477 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0349  methyltransferase  27.92 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2127  phospholipid N-methyltransferase  26.2 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0502  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  27.27 
 
 
183 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1365  phospholipid N-methyltransferase  32.42 
 
 
179 aa  74.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.759046  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3529  methyltransferase type 12  28.21 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354296  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0096  generic methyltransferase  29.89 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2651  Ribosomal RNA adenine methylase transferase- like protein  44.54 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2781  phospholipid N-methyltransferase-like protein  30 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1211  phospholipid N-methyltransferase  34.03 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0146492 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1604  methyltransferase type 12  29.57 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.614347  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3775  hypothetical protein  35.14 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651573 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5377  Methyltransferase type 12  27.98 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4668  ribosomal RNA adenine dimethylase  26.09 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3283  putative methyltransferase  29.28 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3144  putative methyltransferase  29.28 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.875081  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3870  hypothetical protein  27.17 
 
 
187 aa  63.2  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0359454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0039  hypothetical protein  46.38 
 
 
101 aa  63.2  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243638  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3294  putative methyltransferase  28.73 
 
 
185 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.348454  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1013  methyltransferase  29.83 
 
 
185 aa  62  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.699985 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0154  phospholipid N-methyltransferase  28.17 
 
 
228 aa  62  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0287  methyltransferase type 11  36.67 
 
 
195 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1585  phospholipid N-methyltransferase-like protein  26.34 
 
 
208 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0911631  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  37.98 
 
 
256 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1094  dimethyladenosine transferase  37.68 
 
 
281 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.461445  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3985  methyltransferase type 11  33.11 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349003  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1457  Methyltransferase type 12  42.03 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.129024  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2671  dimethyladenosine transferase  39.56 
 
 
290 aa  42.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6598  hypothetical protein  43.9 
 
 
87 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150055 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86084  methyltransferase  32.2 
 
 
333 aa  41.6  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0255585 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  30.36 
 
 
257 aa  41.6  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>