87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3529 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3529  methyltransferase type 12  100 
 
 
207 aa  420  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354296  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1604  methyltransferase type 12  65.57 
 
 
212 aa  250  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.614347  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0096  generic methyltransferase  60 
 
 
208 aa  241  7e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4954  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  34.44 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0281  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  33.89 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4983  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  35 
 
 
192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4721  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  33.89 
 
 
192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5083  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  33.89 
 
 
192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4968  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  33.89 
 
 
192 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5256  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  34.78 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4944  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  33.89 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4561  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  32.78 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000778577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4577  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  33.33 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4803  adenosine dimethyl transferase  34.78 
 
 
192 aa  125  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000013839  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1585  phospholipid N-methyltransferase-like protein  38.25 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0911631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4668  ribosomal RNA adenine dimethylase  33.33 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0962  hypothetical protein  27.03 
 
 
191 aa  108  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2253  Methyltransferase type 12  33.68 
 
 
199 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3870  hypothetical protein  33.72 
 
 
187 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0359454 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3985  methyltransferase type 11  33.14 
 
 
212 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349003  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0287  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
195 aa  98.2  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2818  Methyltransferase type 12  29.61 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.973514  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2651  Ribosomal RNA adenine methylase transferase- like protein  31.87 
 
 
189 aa  96.3  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3314  methyltransferase type 11  32.8 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0802938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3996  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  26.94 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518613  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5159  methyltransferase type 11  32.8 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2854  phospholipid N-methyltransferase-like  30.32 
 
 
196 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2781  phospholipid N-methyltransferase-like protein  28.16 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1211  phospholipid N-methyltransferase  31.5 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0146492 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19850  phospholipid N-methyltransferase  27.23 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0199133  decreased coverage  0.0000402222 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0444  hypothetical protein  29.23 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2589  phospholipid N-methyltransferase PmtA  29.23 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0961  hypothetical protein  29.23 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0186  phospholipid N-methyltransferase PmtA  29.23 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3006  hypothetical protein  28.21 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2896  phospholipid N-methyltransferase PmtA  28.21 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2958  phospholipid N-methyltransferase PmtA  28.21 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3377  methyltransferase type 12  30.85 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4139  methyltransferase type 12  30.85 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4790  methyltransferase type 12  30.85 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310802  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0130  ribosomal RNA adenine methylase transferase  27.66 
 
 
264 aa  72  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1627  hypothetical protein  28.93 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0389  putative phospholipid N-methyltransferase  26 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0431  ribosomal RNA adenine methylase transferase  26.73 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6272  phospholipid N-methyltransferase  26.37 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552401  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3294  putative methyltransferase  27.67 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.348454  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0331  ribosomal RNA adenine methylase transferase  26.5 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3144  putative methyltransferase  27.04 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.875081  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3283  putative methyltransferase  27.04 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511349  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3372  phospholipid N-methyltransferase-like protein  26.98 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0157  ribosomal RNA adenine methylase transferase  25.95 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0681  ribosomal RNA adenine methylase transferase  30.48 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0193  phospholipid N-methyltransferase  24.02 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1641  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1013  methyltransferase  28.93 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.699985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6929  phospholipid N-methyltransferase  24.06 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3921  phospholipid N-methyltransferase  26.09 
 
 
212 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.785681  normal  0.164521 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0199  ribosomal RNA adenine methylase transferase  23.53 
 
 
200 aa  62.4  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0154  phospholipid N-methyltransferase  31.84 
 
 
228 aa  62.4  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0338  ribosomal RNA adenine methylase transferase  25.87 
 
 
201 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0870477  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0502  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  21.47 
 
 
183 aa  62  0.000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4327  phospholipid N-methyltransferase protein  27.57 
 
 
199 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0355  phospholipid N-methyltransferase  24.21 
 
 
205 aa  61.6  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191687  normal  0.556592 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0746  methyltransferase type 11  28.32 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0943424  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2962  phospholipid N-methyltransferase  24.46 
 
 
218 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.422208 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4590  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase or phosphatidyl-N-methylethanolaminen-methyltransferase  28.11 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486089  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0594  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  28.32 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3188  phospholipid N-methyltransferase  24.46 
 
 
218 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.105598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3144  phospholipid N-methyltransferase  24.46 
 
 
218 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0572  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  25.29 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.667801  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4878  ribosomal RNA adenine methylase transferase  30.65 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00569691  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7010  hypothetical protein  26.32 
 
 
209 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  hitchhiker  0.000974477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1193  methyltransferase type 12  29.17 
 
 
190 aa  58.9  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3775  hypothetical protein  27.22 
 
 
184 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651573 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2392  methyltransferase type 12  27.27 
 
 
185 aa  58.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.449799  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0112  Methyltransferase type 12  27.95 
 
 
223 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0102  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 
223 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2957  Methyltransferase type 12  26.88 
 
 
284 aa  55.1  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2857  hypothetical protein  28.02 
 
 
180 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0915  methyltransferase type 12  25.68 
 
 
206 aa  52.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0788  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  26.89 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.199665  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3542  hypothetical protein  27.73 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2043  phospholipid N-methyltransferase  26.05 
 
 
199 aa  48.9  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114973  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5377  Methyltransferase type 12  28.29 
 
 
234 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2127  phospholipid N-methyltransferase  26.05 
 
 
198 aa  43.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 
317 aa  42  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0349  methyltransferase  25.21 
 
 
197 aa  41.6  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2502  S-adenosyl-methyltransferase MraW  31.58 
 
 
316 aa  41.6  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>