94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0130 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0130  ribosomal RNA adenine methylase transferase  100 
 
 		 264 aa  534  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2957  Methyltransferase type 12  58.8 
 
 		 284 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3921  phospholipid N-methyltransferase  59.68 
 
 		 212 aa  232  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.785681  normal  0.164521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6272  phospholipid N-methyltransferase  55.43 
 
 		 206 aa  218  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552401  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6929  phospholipid N-methyltransferase  54.35 
 
 		 208 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0431  ribosomal RNA adenine methylase transferase  52.85 
 
 		 200 aa  214  8e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0193  phospholipid N-methyltransferase  54.55 
 
 		 200 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0389  putative phospholipid N-methyltransferase  52.85 
 
 		 200 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0331  ribosomal RNA adenine methylase transferase  53.37 
 
 		 200 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3144  phospholipid N-methyltransferase  54.3 
 
 		 218 aa  211  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0157  ribosomal RNA adenine methylase transferase  55.61 
 
 		 200 aa  211  7.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2962  phospholipid N-methyltransferase  54.3 
 
 		 218 aa  211  9e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.422208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0199  ribosomal RNA adenine methylase transferase  54.55 
 
 		 200 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3188  phospholipid N-methyltransferase  54.3 
 
 		 218 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.105598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0338  ribosomal RNA adenine methylase transferase  54.3 
 
 		 201 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0870477  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0355  phospholipid N-methyltransferase  54.01 
 
 		 205 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191687  normal  0.556592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3542  hypothetical protein  41.67 
 
 		 200 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0349  methyltransferase  40.31 
 
 		 197 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0788  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  41.58 
 
 		 199 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.199665  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2043  phospholipid N-methyltransferase  40 
 
 		 199 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114973  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4327  phospholipid N-methyltransferase protein  38.22 
 
 		 199 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4590  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase or phosphatidyl-N-methylethanolaminen-methyltransferase  37.7 
 
 		 199 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486089  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_004310  BR2127  phospholipid N-methyltransferase  38.95 
 
 		 198 aa  135  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0681  ribosomal RNA adenine methylase transferase  38.3 
 
 		 202 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2854  phospholipid N-methyltransferase-like  43.96 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3314  methyltransferase type 11  43.72 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0802938 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5159  methyltransferase type 11  43.72 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1193  methyltransferase type 12  43.85 
 
 		 190 aa  129  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4790  methyltransferase type 12  44.57 
 
 		 196 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310802  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4139  methyltransferase type 12  44.57 
 
 		 196 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2958  phospholipid N-methyltransferase PmtA  38.31 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2896  phospholipid N-methyltransferase PmtA  38.31 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3377  methyltransferase type 12  44.57 
 
 		 196 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3006  hypothetical protein  38.12 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2589  phospholipid N-methyltransferase PmtA  37.81 
 
 		 214 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0961  hypothetical protein  37.62 
 
 		 228 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0186  phospholipid N-methyltransferase PmtA  37.81 
 
 		 214 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0444  hypothetical protein  37.81 
 
 		 214 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0102  Methyltransferase type 12  43.48 
 
 		 223 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0112  Methyltransferase type 12  42.93 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0572  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  43.17 
 
 		 187 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.667801  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1627  hypothetical protein  37.81 
 
 		 228 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3372  phospholipid N-methyltransferase-like protein  35.79 
 
 		 189 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4878  ribosomal RNA adenine methylase transferase  37.44 
 
 		 238 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00569691  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0915  methyltransferase type 12  35.64 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4577  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  31.84 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5083  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  31.84 
 
 		 192 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4721  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  31.84 
 
 		 192 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4983  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  31.28 
 
 		 192 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4968  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  30.73 
 
 		 192 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4561  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  31.28 
 
 		 192 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000778577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4954  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  30.73 
 
 		 192 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0746  methyltransferase type 11  37.3 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0943424  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0594  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  37.3 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4944  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  30.73 
 
 		 192 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5256  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  28.65 
 
 		 192 aa  99  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0281  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  30.73 
 
 		 192 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4803  adenosine dimethyl transferase  29.19 
 
 		 192 aa  97.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000013839  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2392  methyltransferase type 12  37.1 
 
 		 185 aa  95.9  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.449799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4668  ribosomal RNA adenine dimethylase  29.51 
 
 		 192 aa  85.9  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2818  Methyltransferase type 12  31.34 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.973514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3906  putative phospholipid N-methyltransferase  35.92 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1211  phospholipid N-methyltransferase  35.23 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0146492 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2857  hypothetical protein  39.33 
 
 		 180 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19850  phospholipid N-methyltransferase  34.04 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0199133  decreased coverage  0.0000402222 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1365  phospholipid N-methyltransferase  31.32 
 
 		 179 aa  78.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.759046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2253  Methyltransferase type 12  30.37 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3996  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  31.66 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518613  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3775  hypothetical protein  35.64 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2781  phospholipid N-methyltransferase-like protein  32.29 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0962  hypothetical protein  29.12 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2771  phospholipid N-methyltransferase  30.6 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3529  methyltransferase type 12  27.66 
 
 		 207 aa  72  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354296  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0502  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  29.03 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0287  methyltransferase type 11  30.98 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7010  hypothetical protein  28.04 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  hitchhiker  0.000974477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2651  Ribosomal RNA adenine methylase transferase- like protein  28.8 
 
 		 189 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1604  methyltransferase type 12  23.63 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.614347  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3985  methyltransferase type 11  27.55 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349003  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0096  generic methyltransferase  27.39 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5377  Methyltransferase type 12  29.52 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3870  hypothetical protein  25.14 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0359454 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1585  phospholipid N-methyltransferase-like protein  25 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0911631  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0154  phospholipid N-methyltransferase  28.44 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1013  methyltransferase  27.66 
 
 		 185 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.699985 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1053  ribosomal RNA adenine methylase transferase  27.27 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000092435  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3294  putative methyltransferase  25.7 
 
 		 185 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.348454  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3029  dimethyladenosine transferase  37.66 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 		 288 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0700  ribosomal RNA adenine methylase transferase  37.8 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000255838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3283  putative methyltransferase  24.72 
 
 		 185 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3144  putative methyltransferase  24.72 
 
 		 185 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.875081  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  26.42 
 
 		 238 aa  42.7  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>