77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3144 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3283  putative methyltransferase  100 
 
 
185 aa  380  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3144  putative methyltransferase  100 
 
 
185 aa  380  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.875081  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3294  putative methyltransferase  99.46 
 
 
185 aa  378  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.348454  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1013  methyltransferase  73.91 
 
 
185 aa  288  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.699985 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0962  hypothetical protein  30.77 
 
 
191 aa  97.1  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2651  Ribosomal RNA adenine methylase transferase- like protein  34.57 
 
 
189 aa  95.1  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5256  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  32.04 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4803  adenosine dimethyl transferase  31.87 
 
 
192 aa  88.6  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000013839  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4954  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  31.11 
 
 
192 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4968  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  31.11 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4721  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  31.11 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5083  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  31.11 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4944  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  31.11 
 
 
192 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4983  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  31.11 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0281  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  30.56 
 
 
192 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4577  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  30.56 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4561  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  30 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000778577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4668  ribosomal RNA adenine dimethylase  28.89 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2818  Methyltransferase type 12  31.67 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.973514  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1604  methyltransferase type 12  27.98 
 
 
212 aa  77  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.614347  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4878  ribosomal RNA adenine methylase transferase  30.77 
 
 
238 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00569691  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4327  phospholipid N-methyltransferase protein  28.26 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0788  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  26.63 
 
 
199 aa  67  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.199665  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3529  methyltransferase type 12  27.04 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354296  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1627  hypothetical protein  29.28 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5159  methyltransferase type 11  30.64 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3006  hypothetical protein  29.28 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2958  phospholipid N-methyltransferase PmtA  29.28 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2896  phospholipid N-methyltransferase PmtA  29.28 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0287  methyltransferase type 11  27.84 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3314  methyltransferase type 11  30.64 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0802938 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2589  phospholipid N-methyltransferase PmtA  29.28 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0444  hypothetical protein  29.28 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0186  phospholipid N-methyltransferase PmtA  29.28 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0961  hypothetical protein  29.28 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2043  phospholipid N-methyltransferase  25.54 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114973  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2771  phospholipid N-methyltransferase  30.11 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0096  generic methyltransferase  22.6 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3870  hypothetical protein  27.78 
 
 
187 aa  63.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0359454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4590  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase or phosphatidyl-N-methylethanolaminen-methyltransferase  28.11 
 
 
199 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486089  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3542  hypothetical protein  25.93 
 
 
200 aa  62.8  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3377  methyltransferase type 12  28.9 
 
 
196 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4139  methyltransferase type 12  28.9 
 
 
196 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4790  methyltransferase type 12  28.9 
 
 
196 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310802  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0594  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  30.39 
 
 
200 aa  61.6  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2854  phospholipid N-methyltransferase-like  29.17 
 
 
196 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0746  methyltransferase type 11  30.39 
 
 
200 aa  61.6  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0943424  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2253  Methyltransferase type 12  26.88 
 
 
199 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0349  methyltransferase  25.67 
 
 
197 aa  60.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3985  methyltransferase type 11  26.06 
 
 
212 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349003  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0681  ribosomal RNA adenine methylase transferase  27.32 
 
 
202 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19850  phospholipid N-methyltransferase  26.88 
 
 
196 aa  58.2  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0199133  decreased coverage  0.0000402222 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0502  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  27.03 
 
 
183 aa  57.8  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0102  Methyltransferase type 12  29.44 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1211  phospholipid N-methyltransferase  24.59 
 
 
209 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0146492 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1365  phospholipid N-methyltransferase  28.81 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.759046  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0355  phospholipid N-methyltransferase  25.95 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191687  normal  0.556592 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1585  phospholipid N-methyltransferase-like protein  24.02 
 
 
208 aa  55.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0911631  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2127  phospholipid N-methyltransferase  23.5 
 
 
198 aa  55.1  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0112  Methyltransferase type 12  28.33 
 
 
223 aa  54.3  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2781  phospholipid N-methyltransferase-like protein  25.52 
 
 
228 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1193  methyltransferase type 12  28.49 
 
 
190 aa  51.6  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3996  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  23.37 
 
 
202 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518613  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0572  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  25.71 
 
 
187 aa  48.9  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.667801  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2957  Methyltransferase type 12  24.48 
 
 
284 aa  48.1  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0389  putative phospholipid N-methyltransferase  23.91 
 
 
200 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0331  ribosomal RNA adenine methylase transferase  24.46 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0431  ribosomal RNA adenine methylase transferase  24.46 
 
 
200 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0338  ribosomal RNA adenine methylase transferase  23.66 
 
 
201 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0870477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0193  phospholipid N-methyltransferase  24.04 
 
 
200 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1641  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3921  phospholipid N-methyltransferase  22.99 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.785681  normal  0.164521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6272  phospholipid N-methyltransferase  22.87 
 
 
206 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552401  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2392  methyltransferase type 12  25.79 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.449799  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0199  ribosomal RNA adenine methylase transferase  23.37 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0157  ribosomal RNA adenine methylase transferase  22.95 
 
 
200 aa  42.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0130  ribosomal RNA adenine methylase transferase  24.72 
 
 
264 aa  42.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3775  hypothetical protein  26.97 
 
 
184 aa  42.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>