80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3906 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3906  putative phospholipid N-methyltransferase  100 
 
 
169 aa  333  5e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0915  methyltransferase type 12  55.43 
 
 
206 aa  159  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0112  Methyltransferase type 12  53.05 
 
 
223 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0102  Methyltransferase type 12  52.44 
 
 
223 aa  154  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3372  phospholipid N-methyltransferase-like protein  47.62 
 
 
189 aa  142  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1193  methyltransferase type 12  47.31 
 
 
190 aa  139  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1627  hypothetical protein  45.88 
 
 
228 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2896  phospholipid N-methyltransferase PmtA  45.29 
 
 
214 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3006  hypothetical protein  45.29 
 
 
228 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2958  phospholipid N-methyltransferase PmtA  45.29 
 
 
214 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0186  phospholipid N-methyltransferase PmtA  44.71 
 
 
214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2589  phospholipid N-methyltransferase PmtA  44.71 
 
 
214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0961  hypothetical protein  44.71 
 
 
228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0444  hypothetical protein  44.71 
 
 
214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4878  ribosomal RNA adenine methylase transferase  44.91 
 
 
238 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00569691  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0331  ribosomal RNA adenine methylase transferase  40.36 
 
 
200 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0431  ribosomal RNA adenine methylase transferase  41.1 
 
 
200 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0389  putative phospholipid N-methyltransferase  38.89 
 
 
200 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0199  ribosomal RNA adenine methylase transferase  37.2 
 
 
200 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0338  ribosomal RNA adenine methylase transferase  38.89 
 
 
201 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0870477  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0157  ribosomal RNA adenine methylase transferase  37.24 
 
 
200 aa  94.7  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0193  phospholipid N-methyltransferase  38.36 
 
 
200 aa  94  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1641  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0355  phospholipid N-methyltransferase  39.29 
 
 
205 aa  89.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191687  normal  0.556592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6272  phospholipid N-methyltransferase  37.35 
 
 
206 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552401  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3188  phospholipid N-methyltransferase  39.16 
 
 
218 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.105598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6929  phospholipid N-methyltransferase  38.89 
 
 
208 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2962  phospholipid N-methyltransferase  39.16 
 
 
218 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.422208 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0130  ribosomal RNA adenine methylase transferase  34.15 
 
 
264 aa  84.7  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3144  phospholipid N-methyltransferase  40 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2957  Methyltransferase type 12  35.37 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3921  phospholipid N-methyltransferase  37.76 
 
 
212 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.785681  normal  0.164521 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2392  methyltransferase type 12  36.81 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.449799  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0572  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  37.69 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.667801  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2854  phospholipid N-methyltransferase-like  33.33 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3377  methyltransferase type 12  34.55 
 
 
196 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4790  methyltransferase type 12  34.55 
 
 
196 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310802  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4139  methyltransferase type 12  34.55 
 
 
196 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5159  methyltransferase type 11  34.38 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4721  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  29.94 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3314  methyltransferase type 11  34.38 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0802938 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4577  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  29.94 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2043  phospholipid N-methyltransferase  29.88 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5083  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  29.94 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0788  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  29.88 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.199665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4968  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  29.94 
 
 
192 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0594  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  33.95 
 
 
200 aa  72  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4983  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  29.94 
 
 
192 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0746  methyltransferase type 11  33.95 
 
 
200 aa  72  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0943424  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4561  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  28.74 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000778577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4954  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  29.34 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0349  methyltransferase  32.32 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4944  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  28.74 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3996  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  34.83 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518613  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0281  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  28.74 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0681  ribosomal RNA adenine methylase transferase  31.71 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4803  adenosine dimethyl transferase  29.71 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000013839  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3542  hypothetical protein  32.35 
 
 
200 aa  67.8  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5256  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  29.07 
 
 
192 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0039  hypothetical protein  53.45 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243638  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0962  hypothetical protein  26.7 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2771  phospholipid N-methyltransferase  32.12 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4590  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase or phosphatidyl-N-methylethanolaminen-methyltransferase  29.27 
 
 
199 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486089  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_004310  BR2127  phospholipid N-methyltransferase  28.66 
 
 
198 aa  63.2  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2818  Methyltransferase type 12  29.34 
 
 
191 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.973514  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4327  phospholipid N-methyltransferase protein  28.66 
 
 
199 aa  58.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4668  ribosomal RNA adenine dimethylase  29.07 
 
 
192 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19850  phospholipid N-methyltransferase  32.54 
 
 
196 aa  57  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0199133  decreased coverage  0.0000402222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2253  Methyltransferase type 12  31.95 
 
 
199 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3870  hypothetical protein  27.48 
 
 
187 aa  47.8  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0359454 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0502  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  25.6 
 
 
183 aa  47  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2781  phospholipid N-methyltransferase-like protein  28.92 
 
 
228 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0096  generic methyltransferase  26.32 
 
 
208 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3775  hypothetical protein  31.93 
 
 
184 aa  44.7  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651573 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2857  hypothetical protein  31.4 
 
 
180 aa  44.3  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1013  methyltransferase  30 
 
 
185 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.699985 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1094  dimethyladenosine transferase  36.25 
 
 
281 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.461445  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0154  phospholipid N-methyltransferase  29.29 
 
 
228 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1571  dimethyladenosine transferase  29.77 
 
 
258 aa  42  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0280695 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0251  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 
297 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1211  phospholipid N-methyltransferase  30.71 
 
 
209 aa  41.6  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0146492 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>