110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1193 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1193  methyltransferase type 12  100 
 
 
190 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4878  ribosomal RNA adenine methylase transferase  58.73 
 
 
238 aa  226  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00569691  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1627  hypothetical protein  58.95 
 
 
228 aa  216  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3006  hypothetical protein  58.73 
 
 
228 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2896  phospholipid N-methyltransferase PmtA  58.73 
 
 
214 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2958  phospholipid N-methyltransferase PmtA  58.73 
 
 
214 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0444  hypothetical protein  58.2 
 
 
214 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2589  phospholipid N-methyltransferase PmtA  58.2 
 
 
214 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0961  hypothetical protein  58.2 
 
 
228 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0186  phospholipid N-methyltransferase PmtA  58.2 
 
 
214 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0112  Methyltransferase type 12  54.7 
 
 
223 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0102  Methyltransferase type 12  55.25 
 
 
223 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0915  methyltransferase type 12  50.8 
 
 
206 aa  176  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3372  phospholipid N-methyltransferase-like protein  48.07 
 
 
189 aa  159  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3906  putative phospholipid N-methyltransferase  46.79 
 
 
169 aa  131  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0130  ribosomal RNA adenine methylase transferase  43.85 
 
 
264 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3921  phospholipid N-methyltransferase  39.04 
 
 
212 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.785681  normal  0.164521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6272  phospholipid N-methyltransferase  38.83 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552401  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0331  ribosomal RNA adenine methylase transferase  38.17 
 
 
200 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0199  ribosomal RNA adenine methylase transferase  39.78 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0157  ribosomal RNA adenine methylase transferase  37.77 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2962  phospholipid N-methyltransferase  39.57 
 
 
218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.422208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3188  phospholipid N-methyltransferase  39.57 
 
 
218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.105598 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2957  Methyltransferase type 12  38.02 
 
 
284 aa  108  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0338  ribosomal RNA adenine methylase transferase  38.17 
 
 
201 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0870477  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3144  phospholipid N-methyltransferase  39.04 
 
 
218 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6929  phospholipid N-methyltransferase  36.56 
 
 
208 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0431  ribosomal RNA adenine methylase transferase  37.97 
 
 
200 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0193  phospholipid N-methyltransferase  36.76 
 
 
200 aa  104  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1641  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5159  methyltransferase type 11  39.34 
 
 
196 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3314  methyltransferase type 11  39.34 
 
 
196 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0802938 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0389  putative phospholipid N-methyltransferase  37.97 
 
 
200 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4790  methyltransferase type 12  41.01 
 
 
196 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310802  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3377  methyltransferase type 12  41.01 
 
 
196 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0355  phospholipid N-methyltransferase  38.1 
 
 
205 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191687  normal  0.556592 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4139  methyltransferase type 12  41.01 
 
 
196 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2854  phospholipid N-methyltransferase-like  39.55 
 
 
196 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0681  ribosomal RNA adenine methylase transferase  34.76 
 
 
202 aa  101  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2392  methyltransferase type 12  38.34 
 
 
185 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.449799  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0349  methyltransferase  34.04 
 
 
197 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4590  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase or phosphatidyl-N-methylethanolaminen-methyltransferase  34.03 
 
 
199 aa  95.9  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486089  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3542  hypothetical protein  31.91 
 
 
200 aa  95.5  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0788  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.51 
 
 
199 aa  94.4  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.199665  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0572  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  39.47 
 
 
187 aa  94.4  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.667801  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3996  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  35.94 
 
 
202 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518613  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2043  phospholipid N-methyltransferase  32.45 
 
 
199 aa  92.4  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114973  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0746  methyltransferase type 11  36.08 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0943424  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0594  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  36.08 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4327  phospholipid N-methyltransferase protein  31.91 
 
 
199 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4561  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  30.21 
 
 
192 aa  86.3  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000778577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4968  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  29.69 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4954  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  29.19 
 
 
192 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4983  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  29.69 
 
 
192 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4803  adenosine dimethyl transferase  28.72 
 
 
192 aa  84.3  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000013839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5256  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  28.57 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2127  phospholipid N-methyltransferase  31.38 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4721  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  29.03 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4577  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  29.03 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5083  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  29.03 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0281  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  28.87 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4944  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  27.84 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2857  hypothetical protein  40.86 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2253  Methyltransferase type 12  35.57 
 
 
199 aa  79  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2818  Methyltransferase type 12  32.97 
 
 
191 aa  79  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.973514  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1365  phospholipid N-methyltransferase  30.98 
 
 
179 aa  74.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.759046  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0962  hypothetical protein  28.49 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2771  phospholipid N-methyltransferase  30.05 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0502  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  30.05 
 
 
183 aa  72  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19850  phospholipid N-methyltransferase  35.11 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0199133  decreased coverage  0.0000402222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2651  Ribosomal RNA adenine methylase transferase- like protein  32.26 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4668  ribosomal RNA adenine dimethylase  28.87 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1211  phospholipid N-methyltransferase  33.15 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0146492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2781  phospholipid N-methyltransferase-like protein  30.65 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0039  hypothetical protein  48.39 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243638  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0096  generic methyltransferase  26.18 
 
 
208 aa  60.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3529  methyltransferase type 12  29.17 
 
 
207 aa  58.9  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354296  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0287  methyltransferase type 11  30.32 
 
 
195 aa  58.2  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7010  hypothetical protein  31.18 
 
 
209 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  hitchhiker  0.000974477 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3870  hypothetical protein  27.96 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0359454 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3775  hypothetical protein  34.59 
 
 
184 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651573 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3985  methyltransferase type 11  30.22 
 
 
212 aa  52.4  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349003  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1604  methyltransferase type 12  25.38 
 
 
212 aa  51.2  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.614347  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3144  putative methyltransferase  28.49 
 
 
185 aa  51.6  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.875081  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3283  putative methyltransferase  28.49 
 
 
185 aa  51.6  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511349  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1053  ribosomal RNA adenine methylase transferase  35.62 
 
 
252 aa  50.8  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000092435  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3294  putative methyltransferase  27.93 
 
 
185 aa  48.5  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.348454  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1585  phospholipid N-methyltransferase-like protein  28.93 
 
 
208 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0911631  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0154  phospholipid N-methyltransferase  26.09 
 
 
228 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1013  methyltransferase  28.89 
 
 
185 aa  45.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.699985 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  42.59 
 
 
262 aa  45.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5377  Methyltransferase type 12  24.76 
 
 
234 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  34.91 
 
 
265 aa  45.1  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  30.49 
 
 
278 aa  44.7  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  31.91 
 
 
249 aa  44.7  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1901  dimethyladenosine transferase  31.58 
 
 
272 aa  43.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.13527 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  30.19 
 
 
287 aa  43.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10161  dimethyladenosine transferase  26.09 
 
 
276 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6598  hypothetical protein  45.24 
 
 
87 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150055 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  29.29 
 
 
285 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  29.29 
 
 
285 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>