97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3144 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3144  phospholipid N-methyltransferase  100 
 
 
218 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3188  phospholipid N-methyltransferase  95.87 
 
 
218 aa  424  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.105598 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2962  phospholipid N-methyltransferase  95.41 
 
 
218 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.422208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3921  phospholipid N-methyltransferase  77.83 
 
 
212 aa  330  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.785681  normal  0.164521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6929  phospholipid N-methyltransferase  75.36 
 
 
208 aa  316  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6272  phospholipid N-methyltransferase  77.18 
 
 
206 aa  310  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552401  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0193  phospholipid N-methyltransferase  59.69 
 
 
200 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1641  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0431  ribosomal RNA adenine methylase transferase  58.64 
 
 
200 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0389  putative phospholipid N-methyltransferase  58.12 
 
 
200 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0338  ribosomal RNA adenine methylase transferase  56.06 
 
 
201 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0870477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0331  ribosomal RNA adenine methylase transferase  57.95 
 
 
200 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0355  phospholipid N-methyltransferase  59.47 
 
 
205 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191687  normal  0.556592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0157  ribosomal RNA adenine methylase transferase  58.6 
 
 
200 aa  223  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0199  ribosomal RNA adenine methylase transferase  57.22 
 
 
200 aa  219  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2957  Methyltransferase type 12  59.89 
 
 
284 aa  216  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0130  ribosomal RNA adenine methylase transferase  54.3 
 
 
264 aa  211  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0681  ribosomal RNA adenine methylase transferase  38.71 
 
 
202 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0349  methyltransferase  38.17 
 
 
197 aa  136  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2043  phospholipid N-methyltransferase  34.85 
 
 
199 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114973  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4590  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase or phosphatidyl-N-methylethanolaminen-methyltransferase  35.05 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486089  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0788  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  34.34 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.199665  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3542  hypothetical protein  34.95 
 
 
200 aa  128  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3372  phospholipid N-methyltransferase-like protein  44.15 
 
 
189 aa  128  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4327  phospholipid N-methyltransferase protein  36.02 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2127  phospholipid N-methyltransferase  33.84 
 
 
198 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4790  methyltransferase type 12  41.76 
 
 
196 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310802  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4139  methyltransferase type 12  41.76 
 
 
196 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3377  methyltransferase type 12  41.76 
 
 
196 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0572  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  41.81 
 
 
187 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.667801  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2854  phospholipid N-methyltransferase-like  40.11 
 
 
196 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1627  hypothetical protein  40.48 
 
 
228 aa  121  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3006  hypothetical protein  42.05 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0961  hypothetical protein  42.05 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5159  methyltransferase type 11  38.3 
 
 
196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3314  methyltransferase type 11  38.3 
 
 
196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0802938 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2958  phospholipid N-methyltransferase PmtA  42.33 
 
 
214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2896  phospholipid N-methyltransferase PmtA  42.33 
 
 
214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0186  phospholipid N-methyltransferase PmtA  42.33 
 
 
214 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2589  phospholipid N-methyltransferase PmtA  42.33 
 
 
214 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0444  hypothetical protein  42.33 
 
 
214 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4878  ribosomal RNA adenine methylase transferase  41.84 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00569691  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0915  methyltransferase type 12  38.1 
 
 
206 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0594  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  39.29 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0746  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0943424  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0102  Methyltransferase type 12  37.63 
 
 
223 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0112  Methyltransferase type 12  37.11 
 
 
223 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1193  methyltransferase type 12  39.04 
 
 
190 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4954  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  29.47 
 
 
192 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4721  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  30.6 
 
 
192 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5083  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  30.6 
 
 
192 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4577  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  31.28 
 
 
192 aa  101  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4561  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  30 
 
 
192 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000778577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4968  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  30 
 
 
192 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4983  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  30 
 
 
192 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0281  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  31.41 
 
 
192 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1211  phospholipid N-methyltransferase  35.05 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0146492 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2392  methyltransferase type 12  37.17 
 
 
185 aa  97.1  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.449799  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4944  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  30.73 
 
 
192 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5256  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  27.87 
 
 
192 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4803  adenosine dimethyl transferase  28.19 
 
 
192 aa  87  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000013839  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3775  hypothetical protein  37.63 
 
 
184 aa  85.1  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651573 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2771  phospholipid N-methyltransferase  31.87 
 
 
192 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2253  Methyltransferase type 12  33.51 
 
 
199 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3906  putative phospholipid N-methyltransferase  40 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3996  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  31.25 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518613  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2818  Methyltransferase type 12  30.69 
 
 
191 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.973514  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4668  ribosomal RNA adenine dimethylase  29.51 
 
 
192 aa  79  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2781  phospholipid N-methyltransferase-like protein  28.87 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1365  phospholipid N-methyltransferase  26.42 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.759046  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2857  hypothetical protein  37.64 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19850  phospholipid N-methyltransferase  32.8 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0199133  decreased coverage  0.0000402222 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0962  hypothetical protein  25.84 
 
 
191 aa  72  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0154  phospholipid N-methyltransferase  31.13 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0502  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  23.89 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3870  hypothetical protein  24.59 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0359454 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2651  Ribosomal RNA adenine methylase transferase- like protein  37.1 
 
 
189 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1585  phospholipid N-methyltransferase-like protein  26.02 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0911631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7010  hypothetical protein  28.79 
 
 
209 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  hitchhiker  0.000974477 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3529  methyltransferase type 12  24.46 
 
 
207 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354296  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1604  methyltransferase type 12  22.99 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.614347  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3985  methyltransferase type 11  24.23 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349003  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0096  generic methyltransferase  25.43 
 
 
208 aa  55.1  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0287  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
195 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5377  Methyltransferase type 12  24.43 
 
 
234 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  34.57 
 
 
249 aa  50.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0004  dimethyladenosine transferase  26.72 
 
 
266 aa  48.1  0.00009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.50922  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1053  ribosomal RNA adenine methylase transferase  30.99 
 
 
252 aa  47  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000092435  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12019  methyltransferase  44.64 
 
 
179 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  28.83 
 
 
275 aa  45.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  32.93 
 
 
269 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  26.98 
 
 
269 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1013  methyltransferase  22.83 
 
 
185 aa  42.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.699985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2318  methyltransferase type 11  25.19 
 
 
187 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0735638 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  26.36 
 
 
263 aa  42.7  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2047  dimethyladenosine transferase  29.69 
 
 
276 aa  42  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3177  Methyltransferase type 12  32.89 
 
 
229 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.616832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  43.64 
 
 
271 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>