110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0338 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0338  ribosomal RNA adenine methylase transferase  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0870477  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0431  ribosomal RNA adenine methylase transferase  87.5 
 
 		 200 aa  355  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0389  putative phospholipid N-methyltransferase  88 
 
 		 200 aa  354  5e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0331  ribosomal RNA adenine methylase transferase  84.5 
 
 		 200 aa  344  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0193  phospholipid N-methyltransferase  82 
 
 		 200 aa  337  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0199  ribosomal RNA adenine methylase transferase  80.6 
 
 		 200 aa  328  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0157  ribosomal RNA adenine methylase transferase  80 
 
 		 200 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6272  phospholipid N-methyltransferase  59.89 
 
 		 206 aa  235  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552401  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6929  phospholipid N-methyltransferase  58.79 
 
 		 208 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2962  phospholipid N-methyltransferase  56.57 
 
 		 218 aa  227  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.422208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3921  phospholipid N-methyltransferase  59.36 
 
 		 212 aa  227  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.785681  normal  0.164521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3188  phospholipid N-methyltransferase  56.57 
 
 		 218 aa  227  9e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.105598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3144  phospholipid N-methyltransferase  56.06 
 
 		 218 aa  227  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0130  ribosomal RNA adenine methylase transferase  54.3 
 
 		 264 aa  208  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2957  Methyltransferase type 12  54.55 
 
 		 284 aa  201  6e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0355  phospholipid N-methyltransferase  51.02 
 
 		 205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191687  normal  0.556592 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2043  phospholipid N-methyltransferase  36.26 
 
 		 199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114973  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0788  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  35.36 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.199665  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0681  ribosomal RNA adenine methylase transferase  38.59 
 
 		 202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4590  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase or phosphatidyl-N-methylethanolaminen-methyltransferase  35.71 
 
 		 199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486089  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_004310  BR2127  phospholipid N-methyltransferase  34.81 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3542  hypothetical protein  32.99 
 
 		 200 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0102  Methyltransferase type 12  41.05 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0112  Methyltransferase type 12  41.05 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0349  methyltransferase  33.88 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4327  phospholipid N-methyltransferase protein  33.52 
 
 		 199 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3372  phospholipid N-methyltransferase-like protein  40.22 
 
 		 189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1627  hypothetical protein  43.26 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3006  hypothetical protein  43.02 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2854  phospholipid N-methyltransferase-like  41.11 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4790  methyltransferase type 12  41.34 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310802  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0915  methyltransferase type 12  39.04 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5159  methyltransferase type 11  40.56 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3377  methyltransferase type 12  41.34 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2896  phospholipid N-methyltransferase PmtA  43.02 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2958  phospholipid N-methyltransferase PmtA  43.02 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4139  methyltransferase type 12  41.34 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3314  methyltransferase type 11  40 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0802938 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0444  hypothetical protein  43.02 
 
 		 214 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2589  phospholipid N-methyltransferase PmtA  43.02 
 
 		 214 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0961  hypothetical protein  43.02 
 
 		 228 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0186  phospholipid N-methyltransferase PmtA  43.02 
 
 		 214 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0572  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  38.07 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.667801  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4878  ribosomal RNA adenine methylase transferase  40.96 
 
 		 238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00569691  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1193  methyltransferase type 12  38.17 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4577  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  29.03 
 
 		 192 aa  104  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4721  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  29.03 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5083  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  29.03 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4561  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  28.49 
 
 		 192 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000778577  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4983  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  28.49 
 
 		 192 aa  101  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0746  methyltransferase type 11  36.9 
 
 		 200 aa  101  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0943424  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0594  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  36.9 
 
 		 200 aa  101  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2392  methyltransferase type 12  37.23 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.449799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4968  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  27.96 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4944  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  27.96 
 
 		 192 aa  99  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4954  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  27.42 
 
 		 192 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3906  putative phospholipid N-methyltransferase  38.89 
 
 		 169 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0281  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  27.81 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1211  phospholipid N-methyltransferase  34.85 
 
 		 209 aa  87.8  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0146492 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4803  adenosine dimethyl transferase  26.34 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000013839  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4668  ribosomal RNA adenine dimethylase  27.42 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5256  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  26.34 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2771  phospholipid N-methyltransferase  30.37 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3996  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  31.58 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518613  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1365  phospholipid N-methyltransferase  30.77 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.759046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2253  Methyltransferase type 12  32.26 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2818  Methyltransferase type 12  29.02 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.973514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1585  phospholipid N-methyltransferase-like protein  27.41 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0911631  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0962  hypothetical protein  27.53 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19850  phospholipid N-methyltransferase  30.65 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0199133  decreased coverage  0.0000402222 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3775  hypothetical protein  34.25 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3870  hypothetical protein  22.99 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0359454 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3985  methyltransferase type 11  30.57 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349003  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2651  Ribosomal RNA adenine methylase transferase- like protein  30.27 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2857  hypothetical protein  34.07 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3529  methyltransferase type 12  25.87 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354296  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7010  hypothetical protein  28.72 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  hitchhiker  0.000974477 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1604  methyltransferase type 12  25.27 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.614347  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2781  phospholipid N-methyltransferase-like protein  30.47 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0502  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  24.46 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0154  phospholipid N-methyltransferase  27.31 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  31.25 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5377  Methyltransferase type 12  27.36 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1053  ribosomal RNA adenine methylase transferase  29.7 
 
 		 252 aa  52  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000092435  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0096  generic methyltransferase  24.22 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0287  methyltransferase type 11  25.41 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  32.29 
 
 		 263 aa  48.9  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3294  putative methyltransferase  22.16 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.348454  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3144  putative methyltransferase  23.66 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.875081  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3283  putative methyltransferase  23.66 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511349  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  29.82 
 
 		 260 aa  45.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  28.07 
 
 		 260 aa  45.8  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2464  dimethyladenosine transferase  27.43 
 
 		 280 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000579309  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  31.19 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0528  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  37.5 
 
 		 253 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  31.2 
 
 		 271 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2200  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32.26 
 
 		 113 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.60187  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0004  dimethyladenosine transferase  24.19 
 
 		 266 aa  43.1  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.50922  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2047  dimethyladenosine transferase  26.23 
 
 		 276 aa  42.4  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1094  dimethyladenosine transferase  34.29 
 
 		 281 aa  42  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.461445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>