95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4878 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4878  ribosomal RNA adenine methylase transferase  100 
 
 
238 aa  474  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00569691  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1627  hypothetical protein  72.73 
 
 
228 aa  295  6e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3006  hypothetical protein  69.86 
 
 
228 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2896  phospholipid N-methyltransferase PmtA  69.86 
 
 
214 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2958  phospholipid N-methyltransferase PmtA  69.86 
 
 
214 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2589  phospholipid N-methyltransferase PmtA  69.38 
 
 
214 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0444  hypothetical protein  69.38 
 
 
214 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0961  hypothetical protein  69.38 
 
 
228 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0186  phospholipid N-methyltransferase PmtA  69.38 
 
 
214 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1193  methyltransferase type 12  58.73 
 
 
190 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0112  Methyltransferase type 12  49.46 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0102  Methyltransferase type 12  49.46 
 
 
223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0915  methyltransferase type 12  48.13 
 
 
206 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3372  phospholipid N-methyltransferase-like protein  45.45 
 
 
189 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2957  Methyltransferase type 12  41 
 
 
284 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3921  phospholipid N-methyltransferase  42.78 
 
 
212 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.785681  normal  0.164521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0193  phospholipid N-methyltransferase  40 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1641  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3906  putative phospholipid N-methyltransferase  44.23 
 
 
169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6272  phospholipid N-methyltransferase  41.18 
 
 
206 aa  115  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552401  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0130  ribosomal RNA adenine methylase transferase  37.44 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0199  ribosomal RNA adenine methylase transferase  40.84 
 
 
200 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0355  phospholipid N-methyltransferase  37.63 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191687  normal  0.556592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0157  ribosomal RNA adenine methylase transferase  40.84 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3314  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
196 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0802938 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3144  phospholipid N-methyltransferase  41.84 
 
 
218 aa  113  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5159  methyltransferase type 11  42.33 
 
 
196 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0331  ribosomal RNA adenine methylase transferase  39.68 
 
 
200 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2962  phospholipid N-methyltransferase  40.51 
 
 
218 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.422208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3188  phospholipid N-methyltransferase  40.51 
 
 
218 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.105598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0338  ribosomal RNA adenine methylase transferase  40.96 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0870477  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6929  phospholipid N-methyltransferase  38.71 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2854  phospholipid N-methyltransferase-like  43.75 
 
 
196 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4790  methyltransferase type 12  44.63 
 
 
196 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310802  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4139  methyltransferase type 12  44.63 
 
 
196 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3377  methyltransferase type 12  44.63 
 
 
196 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0431  ribosomal RNA adenine methylase transferase  39.79 
 
 
200 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0389  putative phospholipid N-methyltransferase  38.95 
 
 
200 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0572  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  36.5 
 
 
187 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.667801  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2392  methyltransferase type 12  38.02 
 
 
185 aa  102  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.449799  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0594  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  36.96 
 
 
200 aa  95.5  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0746  methyltransferase type 11  36.96 
 
 
200 aa  95.5  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0943424  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3996  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  35.6 
 
 
202 aa  88.6  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518613  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5256  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  26.8 
 
 
192 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3542  hypothetical protein  30.22 
 
 
200 aa  86.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4954  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  27.23 
 
 
192 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0349  methyltransferase  31.72 
 
 
197 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19850  phospholipid N-methyltransferase  36.41 
 
 
196 aa  86.3  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0199133  decreased coverage  0.0000402222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4590  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase or phosphatidyl-N-methylethanolaminen-methyltransferase  30.53 
 
 
199 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486089  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0962  hypothetical protein  28.42 
 
 
191 aa  85.1  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0681  ribosomal RNA adenine methylase transferase  33.96 
 
 
202 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2818  Methyltransferase type 12  34.39 
 
 
191 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.973514  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4968  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  27.23 
 
 
192 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4577  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  27.66 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2253  Methyltransferase type 12  36.46 
 
 
199 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4561  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  27.23 
 
 
192 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000778577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4721  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  27.66 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5083  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  27.66 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4983  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  26.94 
 
 
192 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4803  adenosine dimethyl transferase  25.77 
 
 
192 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000013839  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4327  phospholipid N-methyltransferase protein  30.16 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4944  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  26.6 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1013  methyltransferase  30.85 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.699985 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2043  phospholipid N-methyltransferase  30.92 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114973  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2857  hypothetical protein  40.56 
 
 
180 aa  79  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0788  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  30.92 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.199665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7010  hypothetical protein  35.45 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  hitchhiker  0.000974477 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2771  phospholipid N-methyltransferase  31.89 
 
 
192 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0281  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  25.52 
 
 
192 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3294  putative methyltransferase  29.44 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.348454  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3283  putative methyltransferase  30.77 
 
 
185 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3144  putative methyltransferase  30.77 
 
 
185 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.875081  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0502  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  25.41 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2127  phospholipid N-methyltransferase  27.81 
 
 
198 aa  71.2  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2651  Ribosomal RNA adenine methylase transferase- like protein  40.8 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4668  ribosomal RNA adenine dimethylase  27.08 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1365  phospholipid N-methyltransferase  30.27 
 
 
179 aa  67.8  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.759046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1211  phospholipid N-methyltransferase  32.98 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0146492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2781  phospholipid N-methyltransferase-like protein  30.98 
 
 
228 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0096  generic methyltransferase  28.8 
 
 
208 aa  62.4  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1604  methyltransferase type 12  28.34 
 
 
212 aa  62.4  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.614347  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3529  methyltransferase type 12  30.65 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354296  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0287  methyltransferase type 11  32.89 
 
 
195 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3870  hypothetical protein  26.74 
 
 
187 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0359454 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0154  phospholipid N-methyltransferase  26.29 
 
 
228 aa  55.5  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0039  hypothetical protein  44.62 
 
 
101 aa  55.5  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243638  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3775  hypothetical protein  32.26 
 
 
184 aa  53.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651573 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5377  Methyltransferase type 12  28.64 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1585  phospholipid N-methyltransferase-like protein  24.06 
 
 
208 aa  48.5  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0911631  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1094  dimethyladenosine transferase  34.55 
 
 
281 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.461445  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  42.65 
 
 
265 aa  45.8  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3985  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349003  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  37.88 
 
 
261 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  43.86 
 
 
256 aa  42  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5840  dimethyladenosine transferase  42.86 
 
 
283 aa  42  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  33.77 
 
 
243 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>