96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0287 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0287  methyltransferase type 11  100 
 
 
195 aa  377  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2651  Ribosomal RNA adenine methylase transferase- like protein  53.33 
 
 
189 aa  171  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4721  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  30.56 
 
 
192 aa  118  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5083  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  30.56 
 
 
192 aa  118  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4983  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  31.67 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4968  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  30.56 
 
 
192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4577  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  30 
 
 
192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4561  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  30 
 
 
192 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000778577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4954  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  30 
 
 
192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4944  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  29.44 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0281  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  30 
 
 
192 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5256  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  29.73 
 
 
192 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4803  adenosine dimethyl transferase  30.27 
 
 
192 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000013839  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2818  Methyltransferase type 12  31.49 
 
 
191 aa  104  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.973514  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3529  methyltransferase type 12  34.25 
 
 
207 aa  104  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354296  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0962  hypothetical protein  32.42 
 
 
191 aa  101  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4668  ribosomal RNA adenine dimethylase  29.78 
 
 
192 aa  99.8  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0096  generic methyltransferase  30.86 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1604  methyltransferase type 12  32.39 
 
 
212 aa  94  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.614347  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3985  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349003  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3870  hypothetical protein  32.53 
 
 
187 aa  82  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0359454 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1585  phospholipid N-methyltransferase-like protein  31.15 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0911631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3996  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  30.1 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518613  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1013  methyltransferase  29.12 
 
 
185 aa  77  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.699985 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1211  phospholipid N-methyltransferase  30.73 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0146492 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3283  putative methyltransferase  28.41 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3144  putative methyltransferase  28.41 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.875081  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19850  phospholipid N-methyltransferase  28.93 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0199133  decreased coverage  0.0000402222 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3294  putative methyltransferase  27.84 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.348454  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0130  ribosomal RNA adenine methylase transferase  31.69 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2253  Methyltransferase type 12  28.72 
 
 
199 aa  67.8  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0502  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  25.13 
 
 
183 aa  67  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7010  hypothetical protein  32.45 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  hitchhiker  0.000974477 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2857  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3006  hypothetical protein  33.69 
 
 
228 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2958  phospholipid N-methyltransferase PmtA  33.69 
 
 
214 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2896  phospholipid N-methyltransferase PmtA  33.69 
 
 
214 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2589  phospholipid N-methyltransferase PmtA  33.69 
 
 
214 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0961  hypothetical protein  33.69 
 
 
228 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0444  hypothetical protein  33.69 
 
 
214 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1627  hypothetical protein  33.69 
 
 
228 aa  62  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0186  phospholipid N-methyltransferase PmtA  33.69 
 
 
214 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1193  methyltransferase type 12  30.81 
 
 
190 aa  61.6  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4878  ribosomal RNA adenine methylase transferase  32.07 
 
 
238 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00569691  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2781  phospholipid N-methyltransferase-like protein  31.79 
 
 
228 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0389  putative phospholipid N-methyltransferase  26.55 
 
 
200 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2854  phospholipid N-methyltransferase-like  32.57 
 
 
196 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0349  methyltransferase  31.54 
 
 
197 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3542  hypothetical protein  30.6 
 
 
200 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0431  ribosomal RNA adenine methylase transferase  26.55 
 
 
200 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3372  phospholipid N-methyltransferase-like protein  29.28 
 
 
189 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2771  phospholipid N-methyltransferase  27.01 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3144  phospholipid N-methyltransferase  28.57 
 
 
218 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0355  phospholipid N-methyltransferase  26.42 
 
 
205 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191687  normal  0.556592 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0681  ribosomal RNA adenine methylase transferase  32.61 
 
 
202 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4590  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase or phosphatidyl-N-methylethanolaminen-methyltransferase  28.42 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486089  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5159  methyltransferase type 11  32 
 
 
196 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3314  methyltransferase type 11  32 
 
 
196 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0802938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0193  phospholipid N-methyltransferase  26.37 
 
 
200 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1641  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3921  phospholipid N-methyltransferase  26.98 
 
 
212 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.785681  normal  0.164521 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4139  methyltransferase type 12  31.43 
 
 
196 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3377  methyltransferase type 12  31.43 
 
 
196 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0788  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  24.86 
 
 
199 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.199665  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4790  methyltransferase type 12  31.43 
 
 
196 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310802  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3188  phospholipid N-methyltransferase  26.8 
 
 
218 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.105598 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2962  phospholipid N-methyltransferase  26.8 
 
 
218 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.422208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0199  ribosomal RNA adenine methylase transferase  27.68 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4327  phospholipid N-methyltransferase protein  27.22 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0157  ribosomal RNA adenine methylase transferase  27.59 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6272  phospholipid N-methyltransferase  28.73 
 
 
206 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552401  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0331  ribosomal RNA adenine methylase transferase  26.4 
 
 
200 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2043  phospholipid N-methyltransferase  24.19 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114973  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2957  Methyltransferase type 12  27.32 
 
 
284 aa  52.4  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6929  phospholipid N-methyltransferase  27.57 
 
 
208 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0915  methyltransferase type 12  27.53 
 
 
206 aa  51.6  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0338  ribosomal RNA adenine methylase transferase  26.44 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0870477  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0572  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  26.21 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.667801  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0102  Methyltransferase type 12  27.47 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0112  Methyltransferase type 12  26.37 
 
 
223 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3775  hypothetical protein  27.34 
 
 
184 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651573 
 
 
-
 
NC_004310  BR2127  phospholipid N-methyltransferase  23.66 
 
 
198 aa  46.2  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  24.59 
 
 
285 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  24.59 
 
 
285 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0817  methyltransferase type 11  31.06 
 
 
282 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  28.7 
 
 
291 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1365  phospholipid N-methyltransferase  23.78 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.759046  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
331 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0708  dimethyladenosine transferase  26.05 
 
 
281 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.94 
 
 
282 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2313  generic methyltransferase  30 
 
 
252 aa  42  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0714275  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  27.43 
 
 
291 aa  41.6  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13950  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  28.78 
 
 
363 aa  41.6  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.846433 
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  26.55 
 
 
291 aa  41.6  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.58 
 
 
215 aa  41.6  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1204  generic methyl-transferase  28.81 
 
 
363 aa  41.2  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>