94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0349 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0349  methyltransferase  100 
 
 		 197 aa  403  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4590  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase or phosphatidyl-N-methylethanolaminen-methyltransferase  68.88 
 
 		 199 aa  294  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486089  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4327  phospholipid N-methyltransferase protein  67.86 
 
 		 199 aa  287  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3542  hypothetical protein  66.84 
 
 		 200 aa  285  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2043  phospholipid N-methyltransferase  64.1 
 
 		 199 aa  270  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114973  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0788  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  64.1 
 
 		 199 aa  268  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.199665  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2127  phospholipid N-methyltransferase  62.56 
 
 		 198 aa  258  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0681  ribosomal RNA adenine methylase transferase  61.34 
 
 		 202 aa  249  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3921  phospholipid N-methyltransferase  39.25 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.785681  normal  0.164521 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0130  ribosomal RNA adenine methylase transferase  40.31 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6272  phospholipid N-methyltransferase  38.59 
 
 		 206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552401  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6929  phospholipid N-methyltransferase  38.04 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3188  phospholipid N-methyltransferase  38.71 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.105598 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2962  phospholipid N-methyltransferase  38.71 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.422208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0199  ribosomal RNA adenine methylase transferase  35.5 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0355  phospholipid N-methyltransferase  39.78 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191687  normal  0.556592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2957  Methyltransferase type 12  37.11 
 
 		 284 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3144  phospholipid N-methyltransferase  38.17 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0193  phospholipid N-methyltransferase  35.68 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0331  ribosomal RNA adenine methylase transferase  35.68 
 
 		 200 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0157  ribosomal RNA adenine methylase transferase  34.67 
 
 		 200 aa  131  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0431  ribosomal RNA adenine methylase transferase  34.76 
 
 		 200 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0389  putative phospholipid N-methyltransferase  34.76 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0338  ribosomal RNA adenine methylase transferase  33.88 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0870477  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1193  methyltransferase type 12  34.04 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5159  methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 196 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0572  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  31.07 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.667801  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3314  methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 196 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0802938 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3372  phospholipid N-methyltransferase-like protein  32.2 
 
 		 189 aa  95.5  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0746  methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 200 aa  94.7  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0943424  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0594  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  32.09 
 
 		 200 aa  94.7  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4139  methyltransferase type 12  36 
 
 		 196 aa  94.4  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3377  methyltransferase type 12  36 
 
 		 196 aa  94.4  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4790  methyltransferase type 12  36 
 
 		 196 aa  94.4  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310802  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2854  phospholipid N-methyltransferase-like  35.75 
 
 		 196 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4954  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  30.53 
 
 		 192 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4983  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  30.53 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4968  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  30 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4561  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  28.95 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000778577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4668  ribosomal RNA adenine dimethylase  31.58 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0112  Methyltransferase type 12  32.43 
 
 		 223 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4878  ribosomal RNA adenine methylase transferase  31.72 
 
 		 238 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00569691  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0102  Methyltransferase type 12  32.97 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4577  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  28.95 
 
 		 192 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4721  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  28.95 
 
 		 192 aa  85.1  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5083  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  28.95 
 
 		 192 aa  85.1  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0281  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  28.95 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4803  adenosine dimethyl transferase  29.63 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000013839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5256  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  29.1 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0915  methyltransferase type 12  32.26 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4944  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  28.42 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3006  hypothetical protein  27.92 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1627  hypothetical protein  28.57 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0961  hypothetical protein  27.92 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2896  phospholipid N-methyltransferase PmtA  28.57 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2958  phospholipid N-methyltransferase PmtA  28.57 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0186  phospholipid N-methyltransferase PmtA  28.57 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2589  phospholipid N-methyltransferase PmtA  28.57 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0444  hypothetical protein  28.57 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19850  phospholipid N-methyltransferase  32.11 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0199133  decreased coverage  0.0000402222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2651  Ribosomal RNA adenine methylase transferase- like protein  32.11 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2771  phospholipid N-methyltransferase  28.81 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2392  methyltransferase type 12  32.24 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.449799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0096  generic methyltransferase  31.06 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7010  hypothetical protein  31.97 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  hitchhiker  0.000974477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3906  putative phospholipid N-methyltransferase  32.24 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2781  phospholipid N-methyltransferase-like protein  32.31 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2253  Methyltransferase type 12  27.32 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0962  hypothetical protein  26.55 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1211  phospholipid N-methyltransferase  29.95 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0146492 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1365  phospholipid N-methyltransferase  26.67 
 
 		 179 aa  62  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.759046  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3144  putative methyltransferase  25.67 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.875081  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3283  putative methyltransferase  25.67 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2818  Methyltransferase type 12  27.07 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.973514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3870  hypothetical protein  25.68 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0359454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3996  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  28.95 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518613  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3294  putative methyltransferase  23.66 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.348454  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0287  methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0154  phospholipid N-methyltransferase  31.34 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1585  phospholipid N-methyltransferase-like protein  24.59 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0911631  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3985  methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349003  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1013  methyltransferase  24.46 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.699985 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2857  hypothetical protein  28.32 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1604  methyltransferase type 12  27.07 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.614347  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3775  hypothetical protein  28.73 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651573 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5377  Methyltransferase type 12  28.89 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0502  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  22.75 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  36.25 
 
 		 265 aa  44.3  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2145  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  30.97 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19122  predicted protein  34.57 
 
 		 322 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1915  methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 267 aa  42  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565033  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3529  methyltransferase type 12  25.21 
 
 		 207 aa  41.6  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354296  normal  0.178298 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>