120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3314 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5159  methyltransferase type 11  99.49 
 
 		 196 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3314  methyltransferase type 11  100 
 
 		 196 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0802938 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4790  methyltransferase type 12  90.05 
 
 		 196 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310802  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3377  methyltransferase type 12  90.05 
 
 		 196 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4139  methyltransferase type 12  90.05 
 
 		 196 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2854  phospholipid N-methyltransferase-like  90.96 
 
 		 196 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0572  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  47.98 
 
 		 187 aa  153  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.667801  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0746  methyltransferase type 11  46.02 
 
 		 200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0943424  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0594  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  46.02 
 
 		 200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2957  Methyltransferase type 12  45.95 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0130  ribosomal RNA adenine methylase transferase  43.72 
 
 		 264 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0389  putative phospholipid N-methyltransferase  41.53 
 
 		 200 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0331  ribosomal RNA adenine methylase transferase  42.22 
 
 		 200 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0199  ribosomal RNA adenine methylase transferase  42.78 
 
 		 200 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0193  phospholipid N-methyltransferase  41.11 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3921  phospholipid N-methyltransferase  40.53 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.785681  normal  0.164521 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0157  ribosomal RNA adenine methylase transferase  43.09 
 
 		 200 aa  121  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0355  phospholipid N-methyltransferase  38.62 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191687  normal  0.556592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0431  ribosomal RNA adenine methylase transferase  40.66 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6272  phospholipid N-methyltransferase  40.54 
 
 		 206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552401  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3144  phospholipid N-methyltransferase  38.3 
 
 		 218 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2962  phospholipid N-methyltransferase  38.3 
 
 		 218 aa  118  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.422208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3188  phospholipid N-methyltransferase  38.3 
 
 		 218 aa  118  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.105598 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1627  hypothetical protein  42.7 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6929  phospholipid N-methyltransferase  40.22 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0338  ribosomal RNA adenine methylase transferase  40 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0870477  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3006  hypothetical protein  42.7 
 
 		 228 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2896  phospholipid N-methyltransferase PmtA  42.7 
 
 		 214 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2958  phospholipid N-methyltransferase PmtA  42.7 
 
 		 214 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0681  ribosomal RNA adenine methylase transferase  41.21 
 
 		 202 aa  115  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0444  hypothetical protein  42.16 
 
 		 214 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2589  phospholipid N-methyltransferase PmtA  42.16 
 
 		 214 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0186  phospholipid N-methyltransferase PmtA  42.16 
 
 		 214 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0961  hypothetical protein  42.16 
 
 		 228 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4878  ribosomal RNA adenine methylase transferase  42.86 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00569691  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0788  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  36.31 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.199665  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3542  hypothetical protein  35.48 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1193  methyltransferase type 12  39.34 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4327  phospholipid N-methyltransferase protein  36.56 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4590  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase or phosphatidyl-N-methylethanolaminen-methyltransferase  36.56 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486089  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2043  phospholipid N-methyltransferase  35.2 
 
 		 199 aa  99.4  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114973  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19850  phospholipid N-methyltransferase  37.17 
 
 		 196 aa  98.6  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0199133  decreased coverage  0.0000402222 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0349  methyltransferase  35.56 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2127  phospholipid N-methyltransferase  33.71 
 
 		 198 aa  94.7  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0915  methyltransferase type 12  37.78 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0112  Methyltransferase type 12  35 
 
 		 223 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0102  Methyltransferase type 12  35 
 
 		 223 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4968  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  27.32 
 
 		 192 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5256  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  27.75 
 
 		 192 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2253  Methyltransferase type 12  36.46 
 
 		 199 aa  91.3  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2392  methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.449799  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4721  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  27.32 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4561  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  27.32 
 
 		 192 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000778577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4577  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  27.32 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5083  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  27.32 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0281  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  27.32 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4983  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  27.87 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3996  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  33.86 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518613  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4803  adenosine dimethyl transferase  26.15 
 
 		 192 aa  88.6  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000013839  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2857  hypothetical protein  39.88 
 
 		 180 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4954  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  26.78 
 
 		 192 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4944  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  26.23 
 
 		 192 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2771  phospholipid N-methyltransferase  34.25 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3372  phospholipid N-methyltransferase-like protein  34.24 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3529  methyltransferase type 12  32.8 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354296  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3775  hypothetical protein  36.11 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2781  phospholipid N-methyltransferase-like protein  30.43 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0962  hypothetical protein  27.62 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4668  ribosomal RNA adenine dimethylase  27.37 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1365  phospholipid N-methyltransferase  31.18 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.759046  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0502  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  26.26 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1211  phospholipid N-methyltransferase  33.66 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0146492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7010  hypothetical protein  32.79 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  hitchhiker  0.000974477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3906  putative phospholipid N-methyltransferase  35.42 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2651  Ribosomal RNA adenine methylase transferase- like protein  32.78 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0096  generic methyltransferase  29.68 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3144  putative methyltransferase  30.64 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.875081  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3283  putative methyltransferase  30.64 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2818  Methyltransferase type 12  27.93 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.973514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3985  methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349003  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1604  methyltransferase type 12  28.81 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.614347  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3294  putative methyltransferase  30.06 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.348454  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1013  methyltransferase  29.55 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.699985 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0154  phospholipid N-methyltransferase  29.81 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5377  Methyltransferase type 12  28.7 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1585  phospholipid N-methyltransferase-like protein  28.18 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0911631  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0287  methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0464  dimethyladenosine transferase  30.77 
 
 		 282 aa  50.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00568188  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 309 aa  48.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3870  hypothetical protein  23.03 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0359454 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 248 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 248 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  40.4 
 
 		 271 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  25.6 
 
 		 223 aa  45.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1094  dimethyladenosine transferase  37.23 
 
 		 281 aa  44.7  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.461445  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 267 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>