87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1365 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1365  phospholipid N-methyltransferase  100 
 
 		 179 aa  365  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.759046  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0355  phospholipid N-methyltransferase  32.79 
 
 		 205 aa  85.1  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191687  normal  0.556592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0338  ribosomal RNA adenine methylase transferase  30.77 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0870477  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3775  hypothetical protein  34.27 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2957  Methyltransferase type 12  30.56 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0193  phospholipid N-methyltransferase  29.44 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0130  ribosomal RNA adenine methylase transferase  31.32 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1627  hypothetical protein  31.61 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0331  ribosomal RNA adenine methylase transferase  29.08 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0199  ribosomal RNA adenine methylase transferase  30 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4327  phospholipid N-methyltransferase protein  30.39 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3314  methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0802938 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0431  ribosomal RNA adenine methylase transferase  29.29 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5159  methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0389  putative phospholipid N-methyltransferase  30.15 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4590  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase or phosphatidyl-N-methylethanolaminen-methyltransferase  28.49 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486089  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2771  phospholipid N-methyltransferase  29.55 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3188  phospholipid N-methyltransferase  26.94 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.105598 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2896  phospholipid N-methyltransferase PmtA  32.97 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2958  phospholipid N-methyltransferase PmtA  32.97 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2962  phospholipid N-methyltransferase  26.94 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.422208 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3006  hypothetical protein  32.42 
 
 		 228 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1193  methyltransferase type 12  30.98 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0681  ribosomal RNA adenine methylase transferase  28.95 
 
 		 202 aa  74.3  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0157  ribosomal RNA adenine methylase transferase  28.89 
 
 		 200 aa  74.3  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3144  phospholipid N-methyltransferase  26.42 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2589  phospholipid N-methyltransferase PmtA  32.42 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0961  hypothetical protein  32.42 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0444  hypothetical protein  32.42 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0186  phospholipid N-methyltransferase PmtA  32.42 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0788  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  29.28 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.199665  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2854  phospholipid N-methyltransferase-like  30.11 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3542  hypothetical protein  27.78 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6272  phospholipid N-methyltransferase  29.44 
 
 		 206 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552401  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3921  phospholipid N-methyltransferase  27.07 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.785681  normal  0.164521 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4790  methyltransferase type 12  29.57 
 
 		 196 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310802  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3377  methyltransferase type 12  29.57 
 
 		 196 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4139  methyltransferase type 12  29.57 
 
 		 196 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4878  ribosomal RNA adenine methylase transferase  30.27 
 
 		 238 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00569691  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6929  phospholipid N-methyltransferase  28.25 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2043  phospholipid N-methyltransferase  25.68 
 
 		 199 aa  67  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114973  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2857  hypothetical protein  31.79 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2818  Methyltransferase type 12  32.39 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.973514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19850  phospholipid N-methyltransferase  27.6 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0199133  decreased coverage  0.0000402222 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0349  methyltransferase  26.67 
 
 		 197 aa  62  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2127  phospholipid N-methyltransferase  25 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0572  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  29.28 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.667801  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2781  phospholipid N-methyltransferase-like protein  33.67 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0102  Methyltransferase type 12  29.05 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0746  methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0943424  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0594  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  27.22 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4561  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  34.91 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000778577  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0112  Methyltransferase type 12  29.05 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4577  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  33.96 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4954  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  33.02 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5083  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  33.96 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3283  putative methyltransferase  28.81 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511349  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0915  methyltransferase type 12  25.7 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4721  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  33.96 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3144  putative methyltransferase  28.81 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.875081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4944  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  33.96 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4968  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  33.02 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4983  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  32.08 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0962  hypothetical protein  37.21 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1211  phospholipid N-methyltransferase  25.93 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0146492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2253  Methyltransferase type 12  26.06 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1013  methyltransferase  29.21 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.699985 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3294  putative methyltransferase  28.25 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.348454  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0281  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  35.8 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4803  adenosine dimethyl transferase  34.57 
 
 		 192 aa  51.6  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000013839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5256  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  34.57 
 
 		 192 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3996  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  30.23 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518613  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3985  methyltransferase type 11  31.17 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349003  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2392  methyltransferase type 12  37.65 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.449799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5377  Methyltransferase type 12  36.14 
 
 		 234 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2651  Ribosomal RNA adenine methylase transferase- like protein  28.28 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3870  hypothetical protein  26.23 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0359454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3372  phospholipid N-methyltransferase-like protein  25 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1585  phospholipid N-methyltransferase-like protein  29.47 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0911631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4668  ribosomal RNA adenine dimethylase  38.89 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3423  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  35.71 
 
 		 253 aa  45.1  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7010  hypothetical protein  29.41 
 
 		 209 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  hitchhiker  0.000974477 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  30 
 
 		 276 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0287  methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  31.17 
 
 		 260 aa  42.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1604  methyltransferase type 12  25.32 
 
 		 212 aa  41.6  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.614347  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3348  dimethyladenosine transferase  36.21 
 
 		 285 aa  41.2  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.908407  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>