119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0096 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0096  generic methyltransferase  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1604  methyltransferase type 12  63.29 
 
 		 212 aa  283  9e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.614347  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3529  methyltransferase type 12  60 
 
 		 207 aa  241  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354296  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3870  hypothetical protein  35.52 
 
 		 187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0359454 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4803  adenosine dimethyl transferase  32.57 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000013839  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3985  methyltransferase type 11  35.03 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349003  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4954  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  31.49 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5256  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  32 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4721  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  30.94 
 
 		 192 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5083  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  30.94 
 
 		 192 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4983  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  31.49 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4968  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  30.94 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4944  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  30.94 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4561  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  30.39 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000778577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4577  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  30.39 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0281  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  29.83 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0962  hypothetical protein  28.98 
 
 		 191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4668  ribosomal RNA adenine dimethylase  32.6 
 
 		 192 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1585  phospholipid N-methyltransferase-like protein  32.78 
 
 		 208 aa  97.8  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0911631  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0287  methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2253  Methyltransferase type 12  30.05 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2818  Methyltransferase type 12  29.35 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.973514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2651  Ribosomal RNA adenine methylase transferase- like protein  28.16 
 
 		 189 aa  85.5  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3996  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  26.32 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518613  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1627  hypothetical protein  30.43 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1211  phospholipid N-methyltransferase  29.03 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0146492 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3006  hypothetical protein  29.89 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2781  phospholipid N-methyltransferase-like protein  29.01 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2896  phospholipid N-methyltransferase PmtA  29.89 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2958  phospholipid N-methyltransferase PmtA  29.89 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0444  hypothetical protein  29.89 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2589  phospholipid N-methyltransferase PmtA  29.89 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0961  hypothetical protein  29.89 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0186  phospholipid N-methyltransferase PmtA  29.89 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0349  methyltransferase  31.06 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1013  methyltransferase  24.57 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.699985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0681  ribosomal RNA adenine methylase transferase  33.88 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4590  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase or phosphatidyl-N-methylethanolaminen-methyltransferase  32.77 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486089  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2854  phospholipid N-methyltransferase-like  30.26 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0502  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  22.87 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3294  putative methyltransferase  23.16 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.348454  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5159  methyltransferase type 11  29.68 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3314  methyltransferase type 11  29.68 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0802938 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19850  phospholipid N-methyltransferase  26.2 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0199133  decreased coverage  0.0000402222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0112  Methyltransferase type 12  29.73 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3372  phospholipid N-methyltransferase-like protein  26.71 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3144  putative methyltransferase  22.6 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.875081  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3283  putative methyltransferase  22.6 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511349  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4790  methyltransferase type 12  29.8 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310802  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3377  methyltransferase type 12  29.8 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3542  hypothetical protein  30.6 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4139  methyltransferase type 12  29.8 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4327  phospholipid N-methyltransferase protein  29.41 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4878  ribosomal RNA adenine methylase transferase  28.8 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00569691  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0915  methyltransferase type 12  26.11 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2043  phospholipid N-methyltransferase  29.41 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114973  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0102  Methyltransferase type 12  29.05 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0154  phospholipid N-methyltransferase  26.09 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1193  methyltransferase type 12  26.18 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6929  phospholipid N-methyltransferase  26.98 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3921  phospholipid N-methyltransferase  29.53 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.785681  normal  0.164521 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0788  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  27.73 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.199665  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0130  ribosomal RNA adenine methylase transferase  27.39 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0431  ribosomal RNA adenine methylase transferase  24.66 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0389  putative phospholipid N-methyltransferase  24.66 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6272  phospholipid N-methyltransferase  27.52 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552401  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_004310  BR2127  phospholipid N-methyltransferase  29.41 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2962  phospholipid N-methyltransferase  25.43 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.422208 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0746  methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0943424  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0594  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  27.52 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3144  phospholipid N-methyltransferase  25.43 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3188  phospholipid N-methyltransferase  25.43 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.105598 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2957  Methyltransferase type 12  25.62 
 
 		 284 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0331  ribosomal RNA adenine methylase transferase  23.97 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0338  ribosomal RNA adenine methylase transferase  24.22 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0870477  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0199  ribosomal RNA adenine methylase transferase  23.81 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0572  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  25.34 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.667801  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0157  ribosomal RNA adenine methylase transferase  25.17 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0355  phospholipid N-methyltransferase  23.45 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191687  normal  0.556592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7010  hypothetical protein  26.23 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  hitchhiker  0.000974477 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0455  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.08 
 
 		 313 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410064  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0193  phospholipid N-methyltransferase  23.13 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0480  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.08 
 
 		 313 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.64263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2502  S-adenosyl-methyltransferase MraW  34.57 
 
 		 316 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.2 
 
 		 313 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5377  Methyltransferase type 12  24.34 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  35.06 
 
 		 320 aa  45.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2926  S-adenosyl-methyltransferase MraW  35.06 
 
 		 320 aa  45.4  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3526  S-adenosyl-methyltransferase MraW  35.06 
 
 		 320 aa  45.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.708442  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3578  S-adenosyl-methyltransferase MraW  30.86 
 
 		 313 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3751  S-adenosyl-methyltransferase MraW  30.86 
 
 		 313 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187007 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3775  hypothetical protein  24.5 
 
 		 184 aa  45.1  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651573 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4541  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.5 
 
 		 313 aa  45.1  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0378  S-adenosyl-methyltransferase MraW  29.63 
 
 		 313 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.843738 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0551  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.08 
 
 		 313 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  35.82 
 
 		 313 aa  44.3  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0522  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.08 
 
 		 313 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3637  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.08 
 
 		 313 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0069  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.02 
 
 		 313 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2857  hypothetical protein  28.39 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>