90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1938 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1938  cytochrome c class I  100 
 
 		 273 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0937188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2148  hypothetical protein  86.08 
 
 		 273 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.61368  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2430  cytochrome c, class I  27.8 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3695  cytochrome c, class I  29.33 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2110  hypothetical protein  30.51 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1198  hypothetical protein  28.19 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000391848  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3156  cytochrome c, class I  29.61 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0759  putative cytochrome c  29.63 
 
 		 296 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.681503 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2664  hypothetical protein  30.34 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0593  hypothetical protein  26.94 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.09 
 
 		 680 aa  60.1  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0755  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor  25.83 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.819139  normal  0.030808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5275  cytochrome c-related protein  27.88 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0263  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.69 
 
 		 470 aa  56.6  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2867  cytochrome c-related protein  26.64 
 
 		 340 aa  53.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7344  cytochrome c, class I  24.51 
 
 		 501 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.335201  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0016  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.05 
 
 		 420 aa  52.4  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.331141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0648  cytochrome c family protein  26.75 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1159  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.78 
 
 		 466 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  23.85 
 
 		 426 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  24.92 
 
 		 728 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0986  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.43 
 
 		 430 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1951  class I diheme cytochrome c  47.17 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1001  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  23.85 
 
 		 430 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0306  class I diheme cytochrome c  47.17 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239873  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0858  cytochrome c, class I  23.94 
 
 		 429 aa  50.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2272  cytochrome c, class I  29.24 
 
 		 458 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.242682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.14 
 
 		 440 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.7 
 
 		 395 aa  49.7  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  25.3 
 
 		 440 aa  49.3  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.25 
 
 		 689 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0966  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  23.43 
 
 		 430 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  26.02 
 
 		 473 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.26 
 
 		 531 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.8 
 
 		 726 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2187  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor, cytochrome c553  25 
 
 		 476 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1417  cytochrome c, class I  25.93 
 
 		 421 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00268752  normal  0.0511274 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  23.96 
 
 		 468 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2958  cytochrome c family protein  26.2 
 
 		 327 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1440  putative cytochrome c, class I  22.95 
 
 		 466 aa  47  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  24.91 
 
 		 698 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0652  cytochrome c family protein  25.18 
 
 		 509 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  26.48 
 
 		 675 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.44 
 
 		 426 aa  46.6  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6799  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.54 
 
 		 454 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131117  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3175  cytochrome c, class I  29.61 
 
 		 432 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5084  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.61 
 
 		 432 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5193  cytochrome c, class I  29.61 
 
 		 432 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  23.23 
 
 		 415 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1857  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.89 
 
 		 538 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  25 
 
 		 450 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4638  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.22 
 
 		 451 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  25.48 
 
 		 708 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6144  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.98 
 
 		 527 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.548869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2085  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.8 
 
 		 432 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.49 
 
 		 425 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.91 
 
 		 429 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.14 
 
 		 448 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  22.58 
 
 		 444 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  25.56 
 
 		 721 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  29.05 
 
 		 439 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2835  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.17 
 
 		 448 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0245579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  25.68 
 
 		 712 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2294  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  24.72 
 
 		 453 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1294  cytochrome c, class I  26.59 
 
 		 527 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0963416  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3959  cytochrome c, class I  27.93 
 
 		 434 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  25.56 
 
 		 694 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33640  dehydrogenase cytochrome c subunit  26.3 
 
 		 434 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  23.57 
 
 		 439 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  25 
 
 		 439 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.61 
 
 		 441 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  25 
 
 		 439 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4408  cytochrome c, class I  27.93 
 
 		 434 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6536  cytochrome c, class I  26.59 
 
 		 527 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4954  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.91 
 
 		 420 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  0.0290114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  23.35 
 
 		 417 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2356  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  22.36 
 
 		 498 aa  43.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  25.2 
 
 		 675 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.95 
 
 		 415 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  23.35 
 
 		 417 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  25.94 
 
 		 721 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  28.49 
 
 		 432 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  22.73 
 
 		 467 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  25.19 
 
 		 773 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  21.71 
 
 		 461 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  25.48 
 
 		 691 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.93 
 
 		 434 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2030  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.99 
 
 		 433 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305388 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.61 
 
 		 425 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1183  cytochrome c, class I  26.09 
 
 		 420 aa  42  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>