93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2148 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2148  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.61368  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1938  cytochrome c class I  86.08 
 
 		 273 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0937188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2430  cytochrome c, class I  26.62 
 
 		 301 aa  92  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0593  hypothetical protein  27 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2664  hypothetical protein  29.44 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0759  putative cytochrome c  31.95 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.681503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1198  hypothetical protein  26.78 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000391848  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2110  hypothetical protein  28.25 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3695  cytochrome c, class I  27.27 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3156  cytochrome c, class I  28.21 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0755  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor  26.28 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.819139  normal  0.030808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5275  cytochrome c-related protein  33.59 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0648  cytochrome c family protein  26.99 
 
 		 332 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.42 
 
 		 689 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1001  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  25.1 
 
 		 430 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0986  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.89 
 
 		 430 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0263  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.36 
 
 		 470 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  25.1 
 
 		 426 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  24.8 
 
 		 415 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0858  cytochrome c, class I  25.23 
 
 		 429 aa  53.5  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2958  cytochrome c family protein  26.99 
 
 		 327 aa  52.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  26.89 
 
 		 698 aa  52.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7344  cytochrome c, class I  24.51 
 
 		 501 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.335201  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0966  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  24.69 
 
 		 430 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  25.31 
 
 		 669 aa  52.4  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.11 
 
 		 680 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5292  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.03 
 
 		 531 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330766  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0306  class I diheme cytochrome c  23.81 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239873  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.03 
 
 		 531 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4638  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.94 
 
 		 451 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1951  class I diheme cytochrome c  45 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.4 
 
 		 395 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  24.81 
 
 		 417 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2085  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.69 
 
 		 432 aa  50.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  24.81 
 
 		 417 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2272  cytochrome c, class I  29.27 
 
 		 458 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.242682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2867  cytochrome c-related protein  25.55 
 
 		 340 aa  49.3  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4058  isoquinoline 1-oxidoreductase  26.54 
 
 		 1215 aa  49.3  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.222777 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  24.32 
 
 		 728 aa  48.9  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6144  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.91 
 
 		 527 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.548869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.18 
 
 		 415 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2502  cytochrome c, class I  23.48 
 
 		 450 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  24.54 
 
 		 473 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4890  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.91 
 
 		 436 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1294  cytochrome c, class I  26.91 
 
 		 527 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0963416  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2986  cytochrome c, class I  25.91 
 
 		 436 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  24.19 
 
 		 708 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6536  cytochrome c, class I  26.91 
 
 		 527 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5380  cytochrome c, class I  25.91 
 
 		 436 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  24.23 
 
 		 440 aa  47  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3088  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.08 
 
 		 442 aa  46.6  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.161961  normal  0.0270934 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  27.6 
 
 		 439 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2187  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor, cytochrome c553  23.33 
 
 		 476 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.89 
 
 		 448 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.1 
 
 		 425 aa  45.8  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1440  putative cytochrome c, class I  21.78 
 
 		 466 aa  45.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1159  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.87 
 
 		 466 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  27.02 
 
 		 675 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1781  cytochrome c, class I  24.6 
 
 		 451 aa  45.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0339245 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  26.64 
 
 		 675 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2835  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.32 
 
 		 448 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0245579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.77 
 
 		 699 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0016  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.28 
 
 		 420 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.331141 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.44 
 
 		 422 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.62 
 
 		 440 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6799  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.45 
 
 		 454 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131117  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  27.06 
 
 		 450 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1163  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.18 
 
 		 448 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1183  cytochrome c, class I  24.18 
 
 		 420 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4225  cytochrome c, class I  25.37 
 
 		 475 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138651  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3292  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.37 
 
 		 475 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.618986 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  22.89 
 
 		 439 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4141  cytochrome c, class I  25.37 
 
 		 475 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.5261  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1104  cytochrome c, class I  24.87 
 
 		 416 aa  43.5  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6575  cytochrome c, class I  25.7 
 
 		 554 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0822253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  26.19 
 
 		 434 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0652  cytochrome c family protein  24.91 
 
 		 509 aa  43.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.7 
 
 		 441 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.9 
 
 		 537 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943544 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1792  cytochrome c, class I  25 
 
 		 470 aa  42.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.346602 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.77 
 
 		 434 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2356  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.34 
 
 		 498 aa  42.7  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  25.57 
 
 		 712 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.29 
 
 		 444 aa  42.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6289  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.3 
 
 		 530 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.550632  normal  0.0291984 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.39 
 
 		 429 aa  42.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4265  cytochrome c, class I  23.02 
 
 		 466 aa  42.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.105526  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  24.91 
 
 		 433 aa  42.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0772  putative oxidoreductase dehydrogenase (cytochrome C subunit) signal peptide protein  27.71 
 
 		 429 aa  42.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456552  hitchhiker  0.00960965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1599  cytochrome c, class I  23.69 
 
 		 438 aa  42.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3959  cytochrome c, class I  24.77 
 
 		 434 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4408  cytochrome c, class I  24.77 
 
 		 434 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  26.07 
 
 		 691 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>