298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1951 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1951  class I diheme cytochrome c  100 
 
 		 290 aa  578  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0306  class I diheme cytochrome c  99.31 
 
 		 290 aa  577  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239873  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2958  cytochrome c family protein  29.82 
 
 		 327 aa  123  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2272  cytochrome c, class I  32.71 
 
 		 458 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.242682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5275  cytochrome c-related protein  33.58 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2867  cytochrome c-related protein  31.8 
 
 		 340 aa  115  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0080  cytochrome c-related protein  32.62 
 
 		 324 aa  112  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.670842  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.2 
 
 		 461 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  31.82 
 
 		 468 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.34 
 
 		 474 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7344  cytochrome c, class I  31.29 
 
 		 501 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.335201  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0728  cytochrome c-related protein  28.21 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0350  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.92 
 
 		 461 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0808  cytochrome c, class I  31.48 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.71514  normal  0.0769565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0648  cytochrome c family protein  30.6 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.62 
 
 		 444 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5380  cytochrome c, class I  32.12 
 
 		 436 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2986  cytochrome c, class I  32.12 
 
 		 436 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4890  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.12 
 
 		 436 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.86 
 
 		 426 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.03 
 
 		 432 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5193  cytochrome c, class I  32 
 
 		 432 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931011 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5084  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32 
 
 		 432 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3175  cytochrome c, class I  32 
 
 		 432 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.77 
 
 		 434 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  28.32 
 
 		 432 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  30.15 
 
 		 430 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  31.99 
 
 		 439 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  30.91 
 
 		 432 aa  95.9  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0689  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.58 
 
 		 447 aa  95.5  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4380  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.6 
 
 		 469 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  28.84 
 
 		 432 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1792  cytochrome c, class I  30.18 
 
 		 470 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.346602 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.84 
 
 		 432 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  28.84 
 
 		 432 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0016  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31 
 
 		 420 aa  94  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.331141 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  28.67 
 
 		 432 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.09 
 
 		 432 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3695  cytochrome c, class I  32.59 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.67 
 
 		 432 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.62 
 
 		 441 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.15 
 
 		 429 aa  93.2  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4225  cytochrome c, class I  29.71 
 
 		 475 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138651  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3292  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.71 
 
 		 475 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.618986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4141  cytochrome c, class I  29.71 
 
 		 475 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.5261  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1719  cytochrome c, class I  29.5 
 
 		 437 aa  92.4  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  29.41 
 
 		 417 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1159  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.79 
 
 		 466 aa  91.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  29.24 
 
 		 432 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2110  hypothetical protein  30.37 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1162  cytochrome c  30.4 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.460761  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  28.88 
 
 		 432 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  28.88 
 
 		 432 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  28.88 
 
 		 432 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  28.88 
 
 		 432 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  29.41 
 
 		 415 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  28.88 
 
 		 432 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  28.88 
 
 		 432 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.09 
 
 		 432 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  28.88 
 
 		 432 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  28.09 
 
 		 432 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1295  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.96 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.250133  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4408  cytochrome c, class I  29.78 
 
 		 434 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3959  cytochrome c, class I  29.78 
 
 		 434 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  29.78 
 
 		 430 aa  90.1  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2085  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.67 
 
 		 432 aa  90.1  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3647  cytochrome c, class I  29.71 
 
 		 477 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1907  cytochrome c, class I  29.55 
 
 		 411 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.551897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4121  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.71 
 
 		 477 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3802  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.88 
 
 		 455 aa  89  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.503165 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.43 
 
 		 422 aa  89  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4216  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.56 
 
 		 434 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  27.52 
 
 		 421 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.37 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2356  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.21 
 
 		 498 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5605  diheme cytochrome c-type  27.11 
 
 		 306 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.388833 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0755  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor  30.18 
 
 		 438 aa  87.8  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.819139  normal  0.030808 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.29 
 
 		 447 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  29.41 
 
 		 430 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.04 
 
 		 434 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  27.86 
 
 		 407 aa  87.4  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3842  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.17 
 
 		 436 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  29.04 
 
 		 417 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5292  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.95 
 
 		 531 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330766  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  29.41 
 
 		 430 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  31.32 
 
 		 434 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  29.41 
 
 		 430 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.32 
 
 		 680 aa  85.9  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1632  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  28.21 
 
 		 403 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2335  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.48 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1453  cytochrome c, class I  32.46 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0943  cytochrome c family protein  28.42 
 
 		 650 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.62 
 
 		 531 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0780  cytochrome c family protein  28.52 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00190536  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.56 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0768  cytochrome c family protein  28.52 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00254  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.57 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4232  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  28.27 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.62 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2187  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor, cytochrome c553  28.78 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0196419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>