295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0728 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0728  cytochrome c-related protein  100 
 
 		 321 aa  664    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2958  cytochrome c family protein  58.68 
 
 		 327 aa  418  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0080  cytochrome c-related protein  61.25 
 
 		 324 aa  417  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.670842  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2867  cytochrome c-related protein  51.72 
 
 		 340 aa  363  2e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0648  cytochrome c family protein  48.75 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2272  cytochrome c, class I  34.45 
 
 		 458 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.242682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5275  cytochrome c-related protein  27.57 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0306  class I diheme cytochrome c  28.57 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239873  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1951  class I diheme cytochrome c  28.21 
 
 		 290 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5380  cytochrome c, class I  28.92 
 
 		 436 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2986  cytochrome c, class I  28.92 
 
 		 436 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4890  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.92 
 
 		 436 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.96 
 
 		 474 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  27.85 
 
 		 425 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0759  putative cytochrome c  29.39 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.681503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  27.44 
 
 		 425 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  27.44 
 
 		 425 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.44 
 
 		 425 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  27 
 
 		 425 aa  95.9  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2085  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.09 
 
 		 432 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1295  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.17 
 
 		 278 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.250133  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.12 
 
 		 425 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4495  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.99 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71248  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.33 
 
 		 425 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  26 
 
 		 425 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3556  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.23 
 
 		 403 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0808  cytochrome c, class I  26.69 
 
 		 437 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.71514  normal  0.0769565 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.67 
 
 		 424 aa  89.7  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4272  hypothetical protein  28.79 
 
 		 545 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.49 
 
 		 461 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1632  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  31.52 
 
 		 403 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  25.77 
 
 		 468 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.72 
 
 		 432 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1162  cytochrome c  27.56 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.460761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7344  cytochrome c, class I  27.1 
 
 		 501 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.335201  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  28.12 
 
 		 424 aa  87.4  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.01 
 
 		 444 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3798  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  31.52 
 
 		 403 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.679754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4232  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  31.52 
 
 		 403 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0350  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.52 
 
 		 461 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  27.05 
 
 		 432 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.05 
 
 		 432 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.78 
 
 		 434 aa  85.9  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3842  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.75 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.05 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  27.05 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  27.05 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  27.4 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2430  cytochrome c, class I  25.47 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2479  cytochrome c family protein  26.03 
 
 		 407 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  28.47 
 
 		 432 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  28.11 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  28.11 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2356  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.29 
 
 		 498 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.17 
 
 		 429 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  28.11 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  28.11 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  25.62 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  28.11 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  27.76 
 
 		 432 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  28.11 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.76 
 
 		 432 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  27.76 
 
 		 432 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.09 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  28.11 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.69 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.34 
 
 		 680 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  25.54 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  25.54 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1857  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.41 
 
 		 538 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  26.64 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  27.3 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  25.18 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3373  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.55 
 
 		 421 aa  79.3  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4201  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.43 
 
 		 418 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0016  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.07 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.331141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2315  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  31.31 
 
 		 1191 aa  79.3  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  25.4 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1543  cytochrome c, class I  34.38 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303209  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.78 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5692  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.47 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0139384 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61130  putative c-type cytochrome  26.55 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00213286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6358  cytochrome c, class I  28.27 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0883371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7024  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.27 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263193  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1159  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.61 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1470  cytochrome c, class I  28.27 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212518  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5264  putative c-type cytochrome  28.08 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  27.15 
 
 		 497 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  26.5 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  27.15 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2502  cytochrome c, class I  26.22 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  27.15 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1244  cytochrome c family protein  27.15 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148627  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0488  cytochrome c family protein  27.15 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155198  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1084  cytochrome c family protein  27.15 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0215  cytochrome c family protein  27.15 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4312  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.15 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1143  hypothetical protein  27.84 
 
 		 532 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0240878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1807  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.5 
 
 		 469 aa  76.6  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000207286  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4612  cytochrome c, class I  25.47 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0237858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>