250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2664 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2664  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  590  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0593  hypothetical protein  62.07 
 
 		 292 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3695  cytochrome c, class I  52.4 
 
 		 298 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2110  hypothetical protein  49.32 
 
 		 298 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3156  cytochrome c, class I  50.37 
 
 		 305 aa  278  7e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2430  cytochrome c, class I  38.26 
 
 		 301 aa  185  8e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1198  hypothetical protein  33.22 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000391848  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2272  cytochrome c, class I  32.29 
 
 		 458 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.242682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5275  cytochrome c-related protein  28.7 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2148  hypothetical protein  27.05 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.61368  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1951  class I diheme cytochrome c  31.97 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0306  class I diheme cytochrome c  31.6 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239873  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2867  cytochrome c-related protein  23.81 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1938  cytochrome c class I  27.87 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0937188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  26.99 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.97 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2835  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.1 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0245579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0080  cytochrome c-related protein  27.15 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.670842  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  25.47 
 
 		 426 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1104  cytochrome c, class I  26.05 
 
 		 416 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1001  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  25.48 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4201  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.24 
 
 		 418 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2356  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.81 
 
 		 498 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  31.77 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4638  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.52 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1295  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.82 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.250133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  27.55 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0858  cytochrome c, class I  25.38 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  31.32 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.53 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2958  cytochrome c family protein  22.26 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0728  cytochrome c-related protein  24.4 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3373  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.41 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.02 
 
 		 531 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.33 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.22 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  28.72 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0986  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.29 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.63 
 
 		 680 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5292  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.02 
 
 		 531 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330766  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  30.22 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  30.22 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0966  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  24.81 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  26.33 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  31.49 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0488  cytochrome c family protein  34.15 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155198  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1244  cytochrome c family protein  34.15 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148627  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0759  putative cytochrome c  24.39 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.681503 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1084  cytochrome c family protein  34.15 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0215  cytochrome c family protein  34.15 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  34.15 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3449  cytochrome c, class I  27.18 
 
 		 428 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1626  putative diheme cytochrome c-553  26.32 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  34.15 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3623  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  31.58 
 
 		 447 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  34.15 
 
 		 497 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.55 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6575  cytochrome c, class I  28.9 
 
 		 554 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0822253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33640  dehydrogenase cytochrome c subunit  26.28 
 
 		 434 aa  55.8  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2110  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  30.59 
 
 		 447 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.375253 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0808  cytochrome c, class I  30.06 
 
 		 437 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.71514  normal  0.0769565 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  34.15 
 
 		 492 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.18 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1417  cytochrome c, class I  26.86 
 
 		 421 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00268752  normal  0.0511274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  26.74 
 
 		 415 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0648  cytochrome c family protein  26.53 
 
 		 332 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3842  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.28 
 
 		 436 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4890  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.85 
 
 		 436 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2812  hypothetical protein  30.36 
 
 		 537 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.9 
 
 		 426 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1543  cytochrome c, class I  27.1 
 
 		 419 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303209  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6289  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.68 
 
 		 530 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.550632  normal  0.0291984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4058  isoquinoline 1-oxidoreductase  29.94 
 
 		 1215 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.222777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2986  cytochrome c, class I  26.85 
 
 		 436 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2490  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.86 
 
 		 432 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5380  cytochrome c, class I  26.85 
 
 		 436 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 440 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  26.37 
 
 		 417 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2963  hypothetical protein  30.36 
 
 		 537 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1453  cytochrome c, class I  28.01 
 
 		 432 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0263  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.68 
 
 		 470 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2502  cytochrome c, class I  27.47 
 
 		 450 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  25.75 
 
 		 427 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.65 
 
 		 425 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.94 
 
 		 434 aa  53.9  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5887  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.15 
 
 		 419 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal  0.403041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1857  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25 
 
 		 538 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3647  cytochrome c, class I  26.57 
 
 		 477 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  35.24 
 
 		 683 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1130  putative cytochrome c alcohol dehydrogenase subunit  26.51 
 
 		 484 aa  52.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  26.37 
 
 		 439 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7344  cytochrome c, class I  26.49 
 
 		 501 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.335201  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0201  cytochrome c, class I  26.26 
 
 		 432 aa  52.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  26.91 
 
 		 432 aa  52.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  25.95 
 
 		 463 aa  52.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  27.64 
 
 		 439 aa  52.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  26.3 
 
 		 434 aa  52.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2423  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  27.92 
 
 		 1181 aa  52.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2187  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor, cytochrome c553  28.32 
 
 		 476 aa  52.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0851  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.33 
 
 		 304 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.569662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>