81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3330 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3330  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 175 aa  351  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1012  phosphoglycerate mutase  82.29 
 
 		 175 aa  292  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0909  Phosphoglycerate mutase  42.94 
 
 		 171 aa  133  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.223074  hitchhiker  0.000993193 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1435  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1875  phosphoglycerate mutase family protein  31.03 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  35.35 
 
 		 218 aa  52  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 215 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 215 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 215 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 215 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 215 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 224 aa  47.8  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0209  phosphoglycerate mutase family protein  25.49 
 
 		 189 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 		 223 aa  48.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  39.76 
 
 		 211 aa  47.8  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  39.44 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  27.5 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  25.79 
 
 		 207 aa  45.4  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.23 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  24.87 
 
 		 209 aa  44.7  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 204 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.23 
 
 		 222 aa  44.7  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  34.07 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  34 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.23 
 
 		 222 aa  44.7  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 		 190 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4034  phosphoglycerate mutase  33.04 
 
 		 223 aa  44.3  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  26.28 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  30.23 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  28.7 
 
 		 448 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  26.79 
 
 		 223 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  37.93 
 
 		 245 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  30.49 
 
 		 227 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  35.63 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  25.58 
 
 		 210 aa  42.4  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  28.31 
 
 		 230 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.09 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  27.89 
 
 		 194 aa  42  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03579  putative phosphoglycerate mutase family protein  33.76 
 
 		 158 aa  42  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  31.37 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  31.37 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  31.37 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  31.37 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  31.37 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 211 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  31.37 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.37 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  36.62 
 
 		 209 aa  41.2  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 217 aa  41.2  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  31.37 
 
 		 161 aa  41.2  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  31.37 
 
 		 161 aa  41.2  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  27.53 
 
 		 225 aa  41.2  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.97 
 
 		 442 aa  41.2  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  30.39 
 
 		 161 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  30.39 
 
 		 161 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  35.29 
 
 		 224 aa  41.2  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  30.39 
 
 		 161 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  30.39 
 
 		 161 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  30.39 
 
 		 161 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1402  phosphohistidine phosphatase  37.1 
 
 		 163 aa  40.8  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.1 
 
 		 382 aa  40.8  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3096  phosphoglycerate mutase domain-containing protein  33.88 
 
 		 166 aa  40.8  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.897971  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1511  phosphohistidine phosphatase  37.1 
 
 		 158 aa  40.8  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>