54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1012 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1012  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3330  phosphoglycerate mutase  82.29 
 
 		 175 aa  292  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0909  Phosphoglycerate mutase  45.61 
 
 		 171 aa  140  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.223074  hitchhiker  0.000993193 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  33.72 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  34.02 
 
 		 207 aa  51.6  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 241 aa  51.2  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1435  phosphoglycerate mutase  27.91 
 
 		 193 aa  50.8  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1875  phosphoglycerate mutase family protein  29.03 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  24.74 
 
 		 209 aa  48.5  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  38.82 
 
 		 224 aa  48.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 222 aa  47.8  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  29.63 
 
 		 222 aa  47.8  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  41.94 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  37.66 
 
 		 223 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  25.58 
 
 		 210 aa  45.8  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 216 aa  45.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  24.14 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4034  phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 		 223 aa  45.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 		 218 aa  45.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.32 
 
 		 162 aa  45.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2822  Phosphoglycerate mutase  31.78 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  29.24 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0209  phosphoglycerate mutase family protein  28.92 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155223 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  29.76 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  27.52 
 
 		 448 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  30.28 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  27.38 
 
 		 223 aa  41.6  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  32.18 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  25.16 
 
 		 190 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  34.12 
 
 		 224 aa  40.8  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  23.56 
 
 		 207 aa  40.8  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  35.92 
 
 		 197 aa  40.8  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2012  Phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 190 aa  40.8  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  34.62 
 
 		 161 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 		 181 aa  40.8  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>