94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3257 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3257  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  100 
 
 
332 aa  641    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0983  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  66.47 
 
 
302 aa  344  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0211  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  39.05 
 
 
239 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.64 
 
 
208 aa  58.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1346  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  52.38 
 
 
96 aa  56.2  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1600  twin-arginine translocation protein TatB, putative  52.38 
 
 
96 aa  56.2  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0401964  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1482  sec-independent protein translocase TatB  52.38 
 
 
95 aa  56.2  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.338937  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  27.12 
 
 
231 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  31.11 
 
 
162 aa  54.7  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.23 
 
 
156 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.41 
 
 
234 aa  53.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  31.16 
 
 
104 aa  53.1  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  31.11 
 
 
229 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.28 
 
 
128 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  28.7 
 
 
115 aa  50.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  26.79 
 
 
170 aa  49.3  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  26.79 
 
 
170 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  25.48 
 
 
179 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  25.49 
 
 
168 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.62 
 
 
116 aa  49.3  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  25.48 
 
 
179 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  25.48 
 
 
179 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  55.26 
 
 
179 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  31.53 
 
 
169 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  42.65 
 
 
194 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  30.85 
 
 
140 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.79 
 
 
151 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.83 
 
 
152 aa  47.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  26.43 
 
 
178 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  24.84 
 
 
168 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  25.89 
 
 
172 aa  47  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  33.64 
 
 
104 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1987  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  52.78 
 
 
71 aa  47  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283995  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
92 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1607  sec-independent translocase  29.63 
 
 
162 aa  46.6  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  28.08 
 
 
175 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  30 
 
 
155 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.56 
 
 
163 aa  46.2  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0364  sec-independent translocase  26.35 
 
 
176 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 
91 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.5 
 
 
140 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 
91 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25870  hypothetical protein  50 
 
 
167 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537825  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  30.95 
 
 
142 aa  45.4  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40 
 
 
214 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  30.85 
 
 
90 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  24.73 
 
 
176 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  40 
 
 
112 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  26.23 
 
 
175 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.32 
 
 
122 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  26.67 
 
 
175 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  26.87 
 
 
147 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  41.67 
 
 
87 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.16 
 
 
138 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  32.53 
 
 
90 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  32.14 
 
 
132 aa  44.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2918  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  54.05 
 
 
127 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0437928  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  52.78 
 
 
91 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  27.08 
 
 
96 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  30.77 
 
 
120 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  25.58 
 
 
152 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  47.22 
 
 
88 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.78 
 
 
117 aa  43.5  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  52.94 
 
 
122 aa  43.9  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  32.22 
 
 
123 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  29.31 
 
 
175 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  31.52 
 
 
139 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  28.57 
 
 
172 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3681  sec-independent translocase  29.31 
 
 
175 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.06 
 
 
207 aa  43.9  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  29.31 
 
 
175 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  29.01 
 
 
175 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0983  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  47.5 
 
 
128 aa  43.5  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  29.01 
 
 
175 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  29.01 
 
 
175 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  47.22 
 
 
88 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2753  sec-independent translocase  29.01 
 
 
175 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  47.22 
 
 
95 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.5 
 
 
189 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.69 
 
 
167 aa  43.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.305104  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.94 
 
 
99 aa  43.1  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  52.78 
 
 
91 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  36.67 
 
 
126 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  40.82 
 
 
103 aa  42.7  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3988  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.5 
 
 
165 aa  42.7  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.900518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0745  sec-independent translocase  26.19 
 
 
159 aa  42.7  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0849771  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  26.53 
 
 
170 aa  42.7  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  27.34 
 
 
125 aa  42.7  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  50 
 
 
89 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.16 
 
 
153 aa  42.7  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  26.12 
 
 
137 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  26.12 
 
 
137 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02761  Sec-independent protein secretion pathway component  33.8 
 
 
83 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.226319  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  26.12 
 
 
137 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>