73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0983 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0983  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  100 
 
 
302 aa  580  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3257  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  66.47 
 
 
332 aa  344  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0211  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  31.23 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.64 
 
 
208 aa  57.4  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  32.43 
 
 
175 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1600  twin-arginine translocation protein TatB, putative  52.38 
 
 
96 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0401964  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  36.56 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.51 
 
 
156 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1482  sec-independent protein translocase TatB  52.38 
 
 
95 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.338937  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1346  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  52.38 
 
 
96 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  30.77 
 
 
182 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  31.11 
 
 
162 aa  53.5  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  32.31 
 
 
172 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  31.11 
 
 
229 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  24.48 
 
 
128 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  27.45 
 
 
169 aa  50.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  37.18 
 
 
104 aa  49.7  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.1 
 
 
234 aa  49.7  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  26.75 
 
 
179 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  26.75 
 
 
179 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  26.67 
 
 
175 aa  49.7  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  26.75 
 
 
179 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0364  sec-independent translocase  30.09 
 
 
176 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  53.49 
 
 
138 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  28.99 
 
 
178 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  29.2 
 
 
176 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  30.69 
 
 
175 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  26.32 
 
 
115 aa  47  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.62 
 
 
116 aa  47  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  26.15 
 
 
170 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  25.41 
 
 
170 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  30.85 
 
 
140 aa  46.6  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  29.73 
 
 
139 aa  46.6  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  29.7 
 
 
175 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  29.7 
 
 
175 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3681  sec-independent translocase  29.7 
 
 
175 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  29.7 
 
 
175 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2753  sec-independent translocase  29.7 
 
 
175 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  29.7 
 
 
175 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  29.7 
 
 
175 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.12 
 
 
163 aa  45.8  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.43 
 
 
92 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.61 
 
 
151 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  41.43 
 
 
112 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25870  hypothetical protein  50 
 
 
167 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537825  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3988  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.5 
 
 
165 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.900518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  41.18 
 
 
179 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  39.39 
 
 
104 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  27.64 
 
 
120 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  31.63 
 
 
168 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1607  sec-independent translocase  35 
 
 
162 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  51.16 
 
 
110 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  31.03 
 
 
194 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  24.59 
 
 
172 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  30 
 
 
155 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  48.57 
 
 
87 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.5 
 
 
140 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.67 
 
 
152 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1987  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.5 
 
 
71 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283995  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  54.29 
 
 
91 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.32 
 
 
122 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  32.05 
 
 
104 aa  43.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  31.63 
 
 
168 aa  43.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  30.85 
 
 
90 aa  43.1  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  32.22 
 
 
90 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  27.55 
 
 
170 aa  42.7  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  26 
 
 
147 aa  42.7  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  29.63 
 
 
142 aa  42.7  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.3 
 
 
169 aa  42.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 
91 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 
91 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  48.57 
 
 
96 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  48.57 
 
 
88 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>