More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3615 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04013  chaperonin GroEL  61.55 
 
 		 548 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3849  chaperonin GroEL  61.55 
 
 		 548 aa  641    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4585  chaperonin GroEL  72.3 
 
 		 545 aa  782    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.3483 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3675  chaperonin GroEL  63.12 
 
 		 548 aa  656    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1361  chaperonin GroEL  62.43 
 
 		 546 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396838  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5285  chaperonin GroEL  64.96 
 
 		 546 aa  694    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.928272  normal  0.361226 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0844  chaperonin Cpn60, GroEL, large subunit of GroESL  60.88 
 
 		 544 aa  638    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  62.81 
 
 		 545 aa  648    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  61 
 
 		 542 aa  649    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  60.15 
 
 		 547 aa  637    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0638  chaperonin GroEL  61.33 
 
 		 548 aa  646    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0722  chaperonin GroEL  63.12 
 
 		 548 aa  656    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0195  chaperonin GroEL  66.1 
 
 		 546 aa  686    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0704  chaperonin GroEL  61.67 
 
 		 545 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4376  chaperonin, 60 kDa  62.91 
 
 		 547 aa  646    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1671  chaperonin GroEL  67.93 
 
 		 547 aa  728    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2521  60 kDa chaperonin (protein Cpn60)  63.19 
 
 		 541 aa  681    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2503  chaperonin GroEL  66.29 
 
 		 549 aa  716    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45914  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4072  chaperonin GroEL  62.62 
 
 		 547 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0436792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0553  chaperonin GroEL  60.38 
 
 		 546 aa  639    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3376  chaperonin GroEL  66.79 
 
 		 549 aa  701    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0621223 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2656  chaperonin GroEL  59.96 
 
 		 547 aa  636    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5253  chaperonin GroEL  62.62 
 
 		 540 aa  638    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  66.48 
 
 		 542 aa  707    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2192  chaperonin GroEL  64.96 
 
 		 545 aa  699    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2574  chaperonin GroEL  67.74 
 
 		 548 aa  722    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0330  chaperonin GroEL  61.48 
 
 		 547 aa  638    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000528969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3124  chaperonin GroEL  61.29 
 
 		 545 aa  636    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.549796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  60.94 
 
 		 554 aa  644    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4501  chaperonin GroEL  61.74 
 
 		 548 aa  647    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.356522  hitchhiker  0.00205266 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2311  chaperonin GroEL  73.24 
 
 		 547 aa  788    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3615  chaperonin Cpn60  100 
 
 		 542 aa  1068    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0985  chaperonin GroEL  73.06 
 
 		 547 aa  786    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4264  chaperonin GroEL  64.33 
 
 		 543 aa  671    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154167  normal  0.0469061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3034  chaperonin GroEL  66.42 
 
 		 540 aa  708    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4130  chaperonin GroEL  65.53 
 
 		 544 aa  699    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.800331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0701  chaperonin GroEL  61.74 
 
 		 545 aa  642    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.149625  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0408  chaperonin GroEL  66.48 
 
 		 545 aa  711    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.522888 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4698  chaperonin GroEL  61.55 
 
 		 548 aa  640    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0346  chaperonin Cpn60/TCP-1  61.22 
 
 		 544 aa  636    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000118378  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2344  chaperonin GroEL  60.72 
 
 		 552 aa  642    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.00000584882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0162  chaperonin GroEL  64.14 
 
 		 543 aa  703    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.762857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  66.23 
 
 		 548 aa  723    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6084  chaperonin GroEL  66.48 
 
 		 545 aa  709    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.879265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0177  chaperonin GroEL  65.72 
 
 		 546 aa  682    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00120697  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2237  chaperonin GroEL  61.36 
 
 		 544 aa  642    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0147  chaperonin GroEL  62.64 
 
 		 545 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0741  chaperonin GroEL  65.72 
 
 		 548 aa  702    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1836  chaperonin GroEL  67.55 
 
 		 550 aa  728    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253263  normal  0.0261483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3234  chaperonin GroEL  65.91 
 
 		 547 aa  662    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.554891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0035  chaperonin GroEL  66.41 
 
 		 547 aa  701    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0226788  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3358  chaperonin GroEL  71.86 
 
 		 546 aa  780    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0645  chaperonin GroEL  61.02 
 
 		 545 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3334  chaperonin GroEL  64.71 
 
 		 540 aa  693    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3172  chaperonin GroEL  65.41 
 
 		 547 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.252237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4726  chaperonin GroEL  67.68 
 
 		 551 aa  726    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1166  chaperonin GroEL  65.34 
 
 		 548 aa  682    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.89242  normal  0.956764 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2609  chaperonin GroEL  62.43 
 
 		 540 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000319213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4384  chaperonin GroEL  61.55 
 
 		 548 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4544  chaperonin GroEL  62.43 
 
 		 540 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0409  chaperonin GroEL  61.1 
 
 		 548 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4363  chaperonin GroEL  62.43 
 
 		 546 aa  648    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.594439  normal  0.0391228 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0422  chaperonin GroEL  61.29 
 
 		 545 aa  638    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00454013  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2227  chaperonin GroEL  65.53 
 
 		 547 aa  681    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182713  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  67.87 
 
 		 550 aa  728    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2919  chaperonin GroEL  71.97 
 
 		 547 aa  776    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1176  chaperonin GroEL  64.02 
 
 		 545 aa  668    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.412382  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2594  chaperonin GroEL  64.39 
 
 		 546 aa  690    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3196  chaperonin GroEL  68.5 
 
 		 545 aa  711    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0541  chaperonin GroEL  60 
 
 		 549 aa  638    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3026  chaperonin GroEL  65.53 
 
 		 546 aa  684    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0591  chaperonin GroEL  61.67 
 
 		 546 aa  639    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3654  chaperonin GroEL  72.3 
 
 		 545 aa  782    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0597  chaperonin GroEL  71.78 
 
 		 547 aa  778    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.411178  normal  0.110788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0452  chaperonin GroEL  66.41 
 
 		 547 aa  700    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.992131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  64.87 
 
 		 539 aa  702    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3708  chaperonin GroEL  61.21 
 
 		 545 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.889887  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1580  chaperonin GroEL  61.86 
 
 		 540 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3753  chaperonin GroEL  62.24 
 
 		 548 aa  652    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  67.42 
 
 		 544 aa  720    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  65.91 
 
 		 542 aa  704    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0804  chaperonin GroEL  64.51 
 
 		 542 aa  705    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451933  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0468  chaperonin GroEL  62.5 
 
 		 547 aa  647    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0739991  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3397  chaperonin GroEL  61.48 
 
 		 545 aa  637    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0555  chaperonin GroEL  61.48 
 
 		 545 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.22128  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0019  chaperonin GroEL  60.61 
 
 		 553 aa  636    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.557028  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0672  chaperonin GroEL  61.55 
 
 		 545 aa  641    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0604  chaperonin GroEL  69.26 
 
 		 551 aa  740    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390233  normal  0.0849194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3688  chaperonin GroEL  62.6 
 
 		 548 aa  649    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1172  chaperonin GroEL  65.91 
 
 		 544 aa  704    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368643  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6392  chaperonin GroEL  61.24 
 
 		 540 aa  651    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0385642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57010  chaperonin GroEL  61.83 
 
 		 547 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1281  chaperonin GroEL  64.7 
 
 		 542 aa  700    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127549  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4956  chaperonin GroEL  62.02 
 
 		 547 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34034  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6251  chaperonin GroEL  61.86 
 
 		 540 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.775744 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2189  chaperonin GroEL  73.62 
 
 		 546 aa  787    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0610  chaperonin GroEL  68.63 
 
 		 550 aa  699    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.271913 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0295  chaperonin GroEL  63.45 
 
 		 551 aa  672    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.206807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3567  chaperonin GroEL  61.48 
 
 		 545 aa  638    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0280431  decreased coverage  0.00325194 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2493  chaperonin Cpn60, GroEL, large subunit of GroESL  60.69 
 
 		 544 aa  637    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0259197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>