More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02142 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02142  remnant of a transposase gene protein  100 
 
 		 155 aa  324  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.965684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03433  ISXoo15 transposase  66.21 
 
 		 315 aa  195  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01854  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  69.63 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03339  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  69.63 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03016  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  69.63 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03801  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  69.63 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00950  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  69.63 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06216  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  69.63 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.805285  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  65.73 
 
 		 343 aa  191  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05425  integrase core domain, putative  69.63 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01834  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  69.63 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.878416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04105  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  69.63 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06099  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  69.63 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.747253  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00937  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  69.63 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01211  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  68.15 
 
 		 144 aa  187  7e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04612  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  68.15 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.809805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01165  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  69.77 
 
 		 127 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.632104  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5954  transposase ISRme10  52.08 
 
 		 336 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  50.7 
 
 		 339 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0939  Integrase catalytic region  48.63 
 
 		 342 aa  138  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  47.95 
 
 		 343 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  50.7 
 
 		 339 aa  137  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  50.7 
 
 		 339 aa  137  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  50.7 
 
 		 339 aa  137  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3165  Integrase catalytic region  48.65 
 
 		 356 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3055  Integrase catalytic region  48.65 
 
 		 356 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  45.89 
 
 		 342 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  44.52 
 
 		 342 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  44.52 
 
 		 342 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  44.52 
 
 		 342 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  44.52 
 
 		 342 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  44.52 
 
 		 342 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  44.52 
 
 		 342 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  44.52 
 
 		 342 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  44.52 
 
 		 342 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  44.52 
 
 		 342 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  45.89 
 
 		 342 aa  130  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  45.99 
 
 		 519 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  45.99 
 
 		 519 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  45.99 
 
 		 496 aa  130  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  45.99 
 
 		 519 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  45.99 
 
 		 519 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  45.99 
 
 		 525 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  45.99 
 
 		 519 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3263  integrase  46.48 
 
 		 189 aa  128  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  45.26 
 
 		 326 aa  128  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  42.36 
 
 		 423 aa  127  6e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  42.36 
 
 		 423 aa  127  6e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  42.36 
 
 		 423 aa  127  6e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  42.36 
 
 		 423 aa  127  6e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  42.36 
 
 		 423 aa  127  6e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  45.39 
 
 		 385 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  45.39 
 
 		 385 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  51.69 
 
 		 466 aa  124  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0052  putative transposase  46.21 
 
 		 340 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0368  integrase catalytic subunit  42.36 
 
 		 192 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.810172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  46.88 
 
 		 402 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  45 
 
 		 386 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  44.53 
 
 		 457 aa  120  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 386 aa  121  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  44.53 
 
 		 457 aa  120  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  44.53 
 
 		 457 aa  120  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  44.53 
 
 		 457 aa  120  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  44.53 
 
 		 457 aa  120  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  44.53 
 
 		 457 aa  120  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  44.53 
 
 		 457 aa  120  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  44.53 
 
 		 457 aa  120  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  44.53 
 
 		 457 aa  120  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  44.53 
 
 		 457 aa  120  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  42.76 
 
 		 386 aa  120  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  43.45 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4206  integrase catalytic region  37.72 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4255  integrase catalytic region  37.72 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703282 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 		 386 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 		 386 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3004  integrase catalytic region  48.61 
 
 		 326 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  43.88 
 
 		 386 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1557  integrase catalytic region  48.61 
 
 		 326 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0883  integrase catalytic region  48.61 
 
 		 326 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3005  integrase catalytic region  48.61 
 
 		 326 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  41.84 
 
 		 342 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4468  integrase catalytic region  37.72 
 
 		 465 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3232  integrase catalytic subunit  37.72 
 
 		 465 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4426  integrase catalytic region  37.72 
 
 		 465 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3406  integrase catalytic region  37.72 
 
 		 465 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  44.03 
 
 		 385 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  44.03 
 
 		 385 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3555  Integrase catalytic region  42.76 
 
 		 317 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0118  hypothetical protein  47.46 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19217  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  46.02 
 
 		 380 aa  117  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  53 
 
 		 386 aa  117  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0893  integrase catalytic region  37.13 
 
 		 465 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  45.14 
 
 		 401 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  45.14 
 
 		 401 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  41.13 
 
 		 386 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  47.86 
 
 		 479 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  47.86 
 
 		 479 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  47.86 
 
 		 479 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  43.8 
 
 		 385 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  45.13 
 
 		 380 aa  114  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>