More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4186 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



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Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_4186  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  100 
 
 
293 aa  600  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15940  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.81 
 
 
293 aa  394  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0555  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.73 
 
 
296 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6649  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.26 
 
 
298 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6247  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.91 
 
 
298 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0385422  normal  0.992107 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3286  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.46 
 
 
288 aa  388  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4018  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.69 
 
 
305 aa  387  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1194  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.75 
 
 
292 aa  385  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1603  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.54 
 
 
292 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.982513  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0754  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.26 
 
 
299 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3386  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.86 
 
 
298 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4028  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.37 
 
 
310 aa  384  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.86 
 
 
290 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.314543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4164  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.32 
 
 
291 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.375509  normal  0.0599581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01945  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.54 
 
 
292 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1618  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.19 
 
 
293 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952229  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.81 
 
 
293 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1779  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.37 
 
 
293 aa  383  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.149846  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0517  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.81 
 
 
293 aa  383  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3075  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.62 
 
 
293 aa  381  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.11788 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0166  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.16 
 
 
293 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0478  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.64 
 
 
293 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543511  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0625  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.24 
 
 
290 aa  383  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.150141 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5902  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.81 
 
 
293 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.11 
 
 
293 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0399407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.77 
 
 
296 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03667  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.24 
 
 
293 aa  377  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.24 
 
 
293 aa  377  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1238  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.24 
 
 
296 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0539  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.51 
 
 
294 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.057049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4056  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.2 
 
 
296 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2101  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.72 
 
 
294 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.338319  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1798  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.72 
 
 
287 aa  378  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2009  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.19 
 
 
292 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2328  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.49 
 
 
294 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2330  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.19 
 
 
292 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0550352  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4153  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.24 
 
 
293 aa  377  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1382  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.76 
 
 
293 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585484 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.49 
 
 
294 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000187637 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.64 
 
 
293 aa  379  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03616  hypothetical protein  62.24 
 
 
293 aa  377  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2597  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.11 
 
 
297 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0621  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.89 
 
 
293 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2896  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.83 
 
 
288 aa  377  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.257197 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4006  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.24 
 
 
293 aa  377  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3933  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.46 
 
 
296 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.527502  normal  0.192647 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.24 
 
 
293 aa  377  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4132  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.24 
 
 
293 aa  377  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4300  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.24 
 
 
293 aa  377  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.671584  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2220  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.14 
 
 
294 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281714  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4021  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.18 
 
 
289 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401685  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.14 
 
 
289 aa  375  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1079  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.16 
 
 
296 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857116  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2321  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.14 
 
 
294 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00736153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0702  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.76 
 
 
307 aa  374  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00504967  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0331  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.02 
 
 
291 aa  375  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.284071  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1470  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.75 
 
 
312 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.759037  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5841  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.11 
 
 
286 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.572504 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0696  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.81 
 
 
294 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53714  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3121  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.32 
 
 
293 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.14 
 
 
289 aa  375  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.310491  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5222  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.89 
 
 
293 aa  374  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.350144  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3464  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.72 
 
 
293 aa  376  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.349025 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2629  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.67 
 
 
298 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.357597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2889  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.84 
 
 
286 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4055  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3186  glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase  61.4 
 
 
304 aa  371  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0843  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 
297 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0237145 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  61.54 
 
 
293 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.34 
 
 
296 aa  372  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.942362  decreased coverage  0.00289209 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2435  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.79 
 
 
294 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000704371 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3162  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.11 
 
 
312 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0774  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  62.94 
 
 
292 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1851  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.11 
 
 
297 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.84 
 
 
296 aa  371  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.32 
 
 
289 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112189  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2652  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.49 
 
 
291 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0048  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.28 
 
 
294 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.231271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.37 
 
 
294 aa  371  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4022  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.32 
 
 
286 aa  371  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.11 
 
 
297 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3019  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  59.03 
 
 
295 aa  371  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.313086  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2558  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.89 
 
 
295 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3140  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.11 
 
 
297 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0403  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.19 
 
 
303 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.504553 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2754  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.11 
 
 
297 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1423  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.79 
 
 
291 aa  372  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0872  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 
297 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2263  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.02 
 
 
305 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1406  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 
290 aa  371  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0680028  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.11 
 
 
297 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0791129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3810  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.81 
 
 
292 aa  371  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3489  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.16 
 
 
295 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.374251 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1783  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.64 
 
 
293 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1989  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.75 
 
 
297 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112346  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0541  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.09 
 
 
297 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3029  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.75 
 
 
291 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1715  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 
297 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.703429 
 
 
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NC_009901  Spea_1399  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.38 
 
 
290 aa  367  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_1494  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.54 
 
 
287 aa  368  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_0390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.7 
 
 
297 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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