61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4579 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  100 
 
 		 78 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0298  YcfA-like  50 
 
 		 77 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  48 
 
 		 73 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  48 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  48 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0711  YcfA-like  39.19 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2354  hypothetical protein  47.95 
 
 		 74 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal  0.0102619 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2364  hypothetical protein  46.58 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404097  normal  0.0567112 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  46.48 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1010  hypothetical protein  41.1 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000868639  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  42.67 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  46.67 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  42.67 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0555  YcfA family protein  40 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2880  YcfA family protein  34.85 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0224984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  42.86 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1322  YcfA-like  39.44 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3514  YcfA family protein  37.31 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3238  YcfA family protein  33.33 
 
 		 69 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  38.89 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  38.89 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2603  YcfA family protein  37.31 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  42.67 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2779  YcfA-like  36 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6578  YcfA family protein  46.03 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000196737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  43.66 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  42.25 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  42.47 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2932  YcfA family protein  44.26 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  42.67 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1246  YcfA family protein  37.66 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1951  YcfA family protein  39.44 
 
 		 74 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.508484 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5956  YcfA family protein  41.1 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1936  YcfA family protein  39.44 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.797457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1634  hypothetical protein  38.71 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  32.89 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1471  YcfA family protein  36.99 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1587  hypothetical protein  38.71 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  43.28 
 
 		 73 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2771  YcfA family protein  38.24 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2649  YcfA-like  38.03 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0377  YcfA-like  32.43 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0773151 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2075  YcfA family protein  37.7 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.547184  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2669  YcfA family protein  36.99 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.16159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2021  YcfA-like  40 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2121  hypothetical protein  36.76 
 
 		 80 aa  43.5  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0116167  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1739  hypothetical protein  42.86 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650653  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2644  YcfA family protein  42.86 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3102  YcfA-like  37.18 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  0.0893777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2666  YcfA family protein  42.86 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000153756  normal  0.80145 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0484  YcfA-like  32.88 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0494568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1099  YcfA family protein  46.15 
 
 		 84 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.718032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1999  hypothetical protein  37.7 
 
 		 59 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00856081  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2546  YcfA family protein  40.32 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3798  YcfA family protein  37.7 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2884  YcfA family protein  41.18 
 
 		 54 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1661  hypothetical protein  41.67 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0136  hypothetical protein  40.35 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  35.14 
 
 		 74 aa  40  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0172  YcfA family protein  34.43 
 
 		 59 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0621  YcfA-like protein  31.08 
 
 		 76 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>