51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2943 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  100 
 
 
74 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  100 
 
 
74 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  69.57 
 
 
74 aa  104  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2116  hypothetical protein  66.67 
 
 
95 aa  90.1  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  47.14 
 
 
73 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1010  hypothetical protein  54.41 
 
 
74 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000868639  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2354  hypothetical protein  47.14 
 
 
74 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal  0.0102619 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  45.71 
 
 
73 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  45.71 
 
 
73 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  44.93 
 
 
76 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  44.93 
 
 
76 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2364  hypothetical protein  44.12 
 
 
74 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404097  normal  0.0567112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  48.48 
 
 
74 aa  70.5  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  42.86 
 
 
76 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  46.38 
 
 
75 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  38.03 
 
 
74 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0377  YcfA-like  40.3 
 
 
73 aa  65.5  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0773151 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  42.03 
 
 
75 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  43.48 
 
 
75 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  44.93 
 
 
76 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  40.85 
 
 
73 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0711  YcfA-like  46.38 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2779  YcfA-like  30 
 
 
76 aa  54.7  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  41.43 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  40.28 
 
 
73 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  38.89 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2880  YcfA family protein  40.91 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0224984  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4379  YcfA family protein  36.92 
 
 
74 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000396987  unclonable  0.0000000014534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5956  YcfA family protein  41.79 
 
 
74 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2715  YcfA-like  39.71 
 
 
74 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.307819  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1471  YcfA family protein  40.58 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1936  YcfA family protein  36.92 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.797457 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1951  YcfA family protein  36.92 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.508484 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2649  YcfA-like  36.62 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3238  YcfA family protein  36.36 
 
 
69 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2669  YcfA family protein  37.84 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.16159 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3102  YcfA-like  36.36 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  0.0893777 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1077  YcfA-like protein  32.2 
 
 
59 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615888  normal  0.167749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1137  YcfA family protein  35.29 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0318024  normal  0.63493 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2666  YcfA family protein  36.07 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000153756  normal  0.80145 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1661  hypothetical protein  36.07 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0211  YcfA family protein  34.78 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1246  YcfA family protein  30 
 
 
75 aa  43.5  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3798  YcfA family protein  40 
 
 
60 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2276  YcfA family protein  38.18 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0979587  hitchhiker  0.00000437635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2121  hypothetical protein  30.14 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0116167  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2213  YcfA family protein  38.18 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0794  hypothetical protein  38.18 
 
 
82 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.331284  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3514  YcfA family protein  32.79 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0161  YcfA family protein  34.43 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2603  YcfA family protein  32.79 
 
 
76 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>