19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2116 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2116  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  197  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  66.67 
 
 		 74 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  66.67 
 
 		 74 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  65.45 
 
 		 74 aa  80.9  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1010  hypothetical protein  43.75 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000868639  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  38 
 
 		 73 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  48 
 
 		 76 aa  50.4  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2364  hypothetical protein  41.3 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404097  normal  0.0567112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2354  hypothetical protein  43.48 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal  0.0102619 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0377  YcfA-like  42.55 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0773151 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  34.92 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  34.92 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  40 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  44 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  31.82 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  31.82 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  42 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  36 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  41.51 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.417133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>