37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0377 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0377  YcfA-like  100 
 
 		 73 aa  150  8e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0773151 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2354  hypothetical protein  39.73 
 
 		 74 aa  75.5  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal  0.0102619 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2364  hypothetical protein  36.99 
 
 		 74 aa  71.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404097  normal  0.0567112 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  40.3 
 
 		 74 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  40.3 
 
 		 74 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  42.67 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  41.33 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  38.24 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  32.88 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  40.79 
 
 		 75 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  35.62 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  35.29 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  35.62 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  34.25 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  34.25 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1010  hypothetical protein  36.76 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000868639  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  36.36 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5956  YcfA family protein  31.51 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  33.78 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  38.03 
 
 		 74 aa  51.2  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4379  YcfA family protein  33.33 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000396987  unclonable  0.0000000014534 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1246  YcfA family protein  30.67 
 
 		 75 aa  50.1  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2116  hypothetical protein  42.55 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2669  YcfA family protein  32.86 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.16159 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  27.78 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2779  YcfA-like  27.4 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0555  YcfA family protein  32.88 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0711  YcfA-like  33.33 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  32.43 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1471  YcfA family protein  31.51 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  33.33 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0621  YcfA-like protein  33.33 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2715  YcfA-like  33.33 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.307819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3238  YcfA family protein  37.5 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2880  YcfA family protein  39.06 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0224984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2932  YcfA family protein  41.82 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0794  hypothetical protein  33.33 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.331284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>