62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0870 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  150  8e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  81.33 
 
 		 75 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  74.67 
 
 		 75 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0152  hypothetical protein  51.39 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  42.47 
 
 		 76 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  42.47 
 
 		 76 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  45.21 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  41.67 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  42.67 
 
 		 74 aa  63.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  43.48 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  43.48 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2779  YcfA-like  44.44 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  36 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1010  hypothetical protein  35.62 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000868639  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  36 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0377  YcfA-like  40.79 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0773151 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  42.47 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1246  YcfA family protein  41.33 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5956  YcfA family protein  45.07 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  46.15 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4379  YcfA family protein  42.42 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000396987  unclonable  0.0000000014534 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2276  YcfA family protein  46.77 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0979587  hitchhiker  0.00000437635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2213  YcfA family protein  46.77 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  42.86 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2354  hypothetical protein  41.67 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal  0.0102619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  43.66 
 
 		 73 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3192  YcfA family protein  44.44 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0334864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2364  hypothetical protein  41.67 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404097  normal  0.0567112 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0355  hypothetical protein  41.33 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  43.66 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2121  hypothetical protein  37.33 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0116167  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1137  YcfA family protein  42.62 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0318024  normal  0.63493 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1098  hypothetical protein  48.33 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.459799  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1951  YcfA family protein  37.84 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.508484 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1936  YcfA family protein  37.84 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.797457 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0298  YcfA-like  38.16 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  37.14 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  39.73 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0555  YcfA family protein  36.84 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0794  hypothetical protein  36.67 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.331284  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2666  YcfA family protein  46.77 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000153756  normal  0.80145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1322  YcfA-like  36.49 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2715  YcfA-like  37.68 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.307819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0711  YcfA-like  36.84 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3102  YcfA-like  36.23 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  0.0893777 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0035  hypothetical protein  37.5 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.151222  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3514  YcfA family protein  31.08 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2603  YcfA family protein  31.08 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0566  YcfA-like  38.71 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2669  YcfA family protein  36 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.16159 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3238  YcfA family protein  35.21 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2880  YcfA family protein  34.72 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0224984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1739  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650653  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3658  YcfA family protein  43.64 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0621  YcfA-like protein  34.72 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0211  YcfA family protein  30.99 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2116  hypothetical protein  42 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0161  YcfA family protein  42.42 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1451  YcfA family protein  35.48 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1661  hypothetical protein  44.83 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2582  hypothetical protein  36.07 
 
 		 79 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0136  hypothetical protein  39.66 
 
 		 60 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>