16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1137 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1137  YcfA family protein  100 
 
 
80 aa  163  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0318024  normal  0.63493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2213  YcfA family protein  58.23 
 
 
79 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2276  YcfA family protein  58.23 
 
 
79 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0979587  hitchhiker  0.00000437635 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0355  hypothetical protein  53.75 
 
 
80 aa  94  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3192  YcfA family protein  54.43 
 
 
80 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0334864  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0794  hypothetical protein  48.75 
 
 
82 aa  85.9  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.331284  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2582  hypothetical protein  37.97 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103745  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  42.62 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  40.32 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  35.29 
 
 
74 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  40.32 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  35.29 
 
 
74 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  35.29 
 
 
74 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  41.18 
 
 
73 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0152  hypothetical protein  36.84 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  35.71 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>