15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0161 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0161  YcfA family protein  100 
 
 		 81 aa  171  5e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0631  YcfA family protein  60.98 
 
 		 83 aa  103  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0378293  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0701  YcfA family protein  56.63 
 
 		 83 aa  88.2  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00509047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  43.55 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  47.46 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  32.88 
 
 		 74 aa  49.7  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3011  hypothetical protein  53.85 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2715  YcfA-like  40.68 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.307819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  42.62 
 
 		 75 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  42.42 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  38.6 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  38.6 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  34.43 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  34.43 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0152  hypothetical protein  46.55 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>