45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0669 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  100 
 
 		 75 aa  147  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5956  YcfA family protein  94.52 
 
 		 74 aa  136  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  48.65 
 
 		 74 aa  77.4  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  56.52 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  47.3 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  44.29 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  42.86 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  44.29 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0298  YcfA-like  44.16 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  41.43 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  41.43 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  42.86 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_007796  Mhun_2779  YcfA-like  39.39 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0377  YcfA-like  36.36 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0773151 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  41.43 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  41.43 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1010  hypothetical protein  37.5 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000868639  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  38.57 
 
 		 73 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  38.57 
 
 		 73 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  37.14 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  45.45 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3102  YcfA-like  42.25 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  0.0893777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  42.47 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1246  YcfA family protein  37.5 
 
 		 75 aa  50.1  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2354  hypothetical protein  38.03 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal  0.0102619 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3343  YcfA family protein  50.91 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  decreased coverage  0.00934326 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  40.54 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0035  hypothetical protein  30.77 
 
 		 65 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.151222  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1099  YcfA family protein  52.08 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.718032  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  32.43 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2364  hypothetical protein  35.21 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404097  normal  0.0567112 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1661  hypothetical protein  40.35 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1471  YcfA family protein  33.8 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2121  hypothetical protein  34.43 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0116167  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3798  YcfA family protein  40 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2715  YcfA-like  38.46 
 
 		 74 aa  42.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.307819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0701  YcfA family protein  41.27 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00509047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0136  hypothetical protein  36.67 
 
 		 60 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0161  YcfA family protein  42.62 
 
 		 81 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2674  YcfA family protein  35 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232678  normal  0.169693 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4379  YcfA family protein  36.21 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000396987  unclonable  0.0000000014534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0047  YcfA family protein  43.4 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000425869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4059  YcfA family protein  37.1 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2094  YcfA family protein  43.4 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.432616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0711  YcfA-like  39.13 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.032978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>