54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1494 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  154  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  61.33 
 
 		 76 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  61.33 
 
 		 76 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  52.05 
 
 		 73 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  52.05 
 
 		 73 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  52.05 
 
 		 73 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  50 
 
 		 74 aa  77  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2779  YcfA-like  43.84 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  42.86 
 
 		 74 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  42.86 
 
 		 74 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2354  hypothetical protein  45.95 
 
 		 74 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal  0.0102619 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1010  hypothetical protein  35.62 
 
 		 74 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000868639  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  44.44 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  50 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  41.67 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  44.44 
 
 		 73 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  44.44 
 
 		 75 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  44.44 
 
 		 75 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2364  hypothetical protein  41.89 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404097  normal  0.0567112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  45.83 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3102  YcfA-like  45.21 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  0.0893777 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0377  YcfA-like  32.88 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0773151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  46.67 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  44.29 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5956  YcfA family protein  42.47 
 
 		 74 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0555  YcfA family protein  41.67 
 
 		 80 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0621  YcfA-like protein  47.83 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  45.31 
 
 		 73 aa  52.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1246  YcfA family protein  44.74 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4379  YcfA family protein  40.91 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000396987  unclonable  0.0000000014534 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2116  hypothetical protein  48 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3192  YcfA family protein  44.59 
 
 		 80 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0334864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0161  YcfA family protein  47.46 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1322  YcfA-like  36.11 
 
 		 76 aa  48.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1471  YcfA family protein  35.53 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0152  hypothetical protein  37.31 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1951  YcfA family protein  38.89 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.508484 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0355  hypothetical protein  41.89 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1936  YcfA family protein  38.89 
 
 		 74 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.797457 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3514  YcfA family protein  30.26 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2669  YcfA family protein  40.28 
 
 		 74 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.16159 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1233  hypothetical protein  33.78 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0780039 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0711  YcfA-like  34.21 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2715  YcfA-like  35.21 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.307819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2603  YcfA family protein  30.26 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0298  YcfA-like  36.49 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2276  YcfA family protein  41.67 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0979587  hitchhiker  0.00000437635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2213  YcfA family protein  41.67 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2582  hypothetical protein  38.6 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2121  hypothetical protein  31.58 
 
 		 80 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0116167  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0980  YcfA family protein  34.21 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000157599  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0794  hypothetical protein  39.29 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.331284  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0484  YcfA-like  37.14 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0494568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1512  YcfA family protein  34.33 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>