13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1233 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1233  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  163  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0780039 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  36.99 
 
 		 74 aa  51.2  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  39.19 
 
 		 73 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  39.19 
 
 		 73 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  33.78 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  34.25 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  37.88 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2779  YcfA-like  29.73 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  33.78 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  32.88 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  33.78 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4379  YcfA family protein  33.87 
 
 		 74 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000396987  unclonable  0.0000000014534 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  31.08 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>